ረጅም ኮድ ያልሆነ ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
የአገልግሎት ጥቅሞች
● የአገልግሎት ጥቅሞች
● ሴሉላር እና ቲሹ ልዩ
● የተወሰነ ደረጃ ተለዋዋጭ አገላለጽ ለውጥን ይገልፃል እና ያቀርባል
● የጊዜ እና የቦታ አገላለጽ ትክክለኛ ቅጦች
● የጋራ ትንተና ከ mRNA ውሂብ ጋር።
● በ BMKCloud ላይ የተመሰረተ የውጤት አቅርቦት፡ ብጁ የውሂብ ማዕድን በመድረክ ላይ ይገኛል።
● ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች ፕሮጀክቱ ሲጠናቀቅ ለ 3 ወራት ያገለግላል
ናሙና መስፈርቶች እና ማድረስ
| ቤተ መፃህፍት | መድረክ | የሚመከር ውሂብ | ውሂብ QC |
| rRNA መሟጠጥ | ኢሉሚና ፒኢ150 | 10 ጊባ | Q30≥85% |
| ኮንክ.(ng/μl) | መጠን (μg) | ንጽህና | ታማኝነት |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 የተወሰነ ወይም ምንም የፕሮቲን ወይም የዲኤንኤ ብክለት በጄል ላይ አይታይም። | ለእጽዋት፡ RIN≥6.5; ለእንስሳት፡ RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; የተገደበ ወይም የመነሻ ከፍታ የለውም |
ኑክሊዮታይዶች;
ቲሹ፡ ክብደት(ደረቅ)፡ ≥1 ግ
*ከ 5 ሚ.ግ በታች ለሆኑ ቲሹዎች ፍላሽ የቀዘቀዘ (ፈሳሽ ናይትሮጅን ውስጥ) ቲሹ ናሙና ለመላክ እንመክራለን።
የሕዋስ መታገድ፡ የሕዋስ ብዛት = 3×107
* የቀዘቀዙ የሴል ሊዛትን ለመላክ እንመክራለን።ያ ሕዋስ ከ5×10 ያነሰ ቢቆጠር5በፈሳሽ ናይትሮጅን ውስጥ የቀዘቀዘ ብልጭታ ይመከራል።
የደም ናሙናዎች;
PA × geneBloodRNATube;
6mlTRIzol እና 2ml ደም (TRIzol:ደም=3:1)
የሚመከር ናሙና ማድረስ
መያዣ፡ 2 ሚሊ ሴንትሪፉጅ ቱቦ (ቲን ፎይል አይመከርም)
የናሙና መሰየሚያ፡ ቡድን+ ማባዛት ለምሳሌ A1፣ A2፣ A3;B1፣ B2፣ B3......
መላኪያ፡
1.Dry-ice: ናሙናዎች በከረጢቶች ውስጥ ተጭነው በደረቅ በረዶ ውስጥ መቀበር አለባቸው.
2.RNAstable tubes፡ የአር ኤን ኤ ናሙናዎች በአር ኤን ኤ ማረጋጊያ ቱቦ (ለምሳሌ RNAstable®) ውስጥ ይደርቃሉ እና በክፍል ሙቀት ውስጥ ይላካሉ።
የአገልግሎት ሥራ ፍሰት
የሙከራ ንድፍ
ናሙና መላኪያ
አር ኤን ኤ ማውጣት
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች
ባዮኢንፎርማቲክስ
1.LncRNA ምደባ
ከላይ ባሉት አራት ሶፍትዌሮች የተተነበየው LncRNA በ 4 ምድቦች ተከፍሏል: lincRNA, anti-sense-LncRNA, intronic-LncRNA;ስሜት-LncRNA.የ LncRNA ምደባ ከዚህ በታች ባለው ሂስቶግራም ውስጥ ታይቷል።
LncRNA ምደባ
DE-lncRNA ማበልጸጊያ ትንተና 2.Cis-ያነጣጠረ ጂኖች
ክላስተር ፕሮፋይለር በጂኦ ማበልጸጊያ ትንተና ተቀጥሮ በ cis-targeted ጂኖች ላይ በተለየ ሁኔታ የተገለጹ lncRNA (DE-lncRNA)፣ በባዮሎጂካል ሂደቶች፣ ሞለኪውላዊ ተግባራት እና ሴሉላር ክፍሎች።የGO ማበልፀጊያ ትንተና ከሙሉ ጂኖም ጋር ሲነፃፀር በ DEG-የሚመራ በከፍተኛ ደረጃ የበለፀጉ የGO ቃላትን የመለየት ሂደት ነው።ከታች እንደሚታየው የበለጸጉ ቃላት በሂስቶግራም, የአረፋ ሠንጠረዥ, ወዘተ ቀርበዋል.
የDE-lncRNA ማበልጸጊያ ትንተና-የአረፋ ገበታ
3. የ mRNA እና lncRNA ርዝማኔን፣ የኤክሶን ቁጥርን፣ ORFን እና የገለፃ መጠንን በማነፃፀር በመካከላቸው ያለውን የአወቃቀር፣የቅደም ተከተል እና የመሳሰሉትን ልዩነቶች መረዳት እንችላለን እንዲሁም በእኛ የተተነበየው ልቦለድ lncRNA ከአጠቃላይ ባህሪያቱ ጋር የሚስማማ መሆኑን ማረጋገጥ እንችላለን።
BMK መያዣ
በKRAS-G12D ሚውቴሽን እና P53 ማንኳኳት በመዳፊት ሳንባ adenocarcinomas ውስጥ የተበላሸ lncRNA አገላለጽ መገለጫ
የታተመሴሉላር እና ሞለኪውላር ሜዲስን ጆርናል2019
የቅደም ተከተል ስልት
ኢሉሚና
የናሙና ስብስብ
የ NONMMUT015812-knockdown KP (shRNA-2) ሴሎች እና አሉታዊ ቁጥጥር (sh-Scr) ሴሎች በተወሰነ የቫይረስ ኢንፌክሽን ቀን 6 ላይ ተገኝተዋል.
ቁልፍ ውጤቶች
ይህ ጥናት በP53 knockout እና KrasG12D ሚውቴሽን በመዳፊት ሳንባ adenocarcinoma ውስጥ በተዛባ ሁኔታ የተገለጹ lncRNAsን ይመረምራል።
1.6424 lncRNAs በተለየ ሁኔታ ተገልጸዋል (≥ 2-fold ለውጥ፣ P <0.05)።
2.ከሁሉም 210 lncRNAs(FC≥8) የ11 lncRNAs አገላለጽ በP53፣ 33 lncRNAs በ KRAS እና 13 lncRNAs በዋና KP ሴሎች ውስጥ በሃይፖክሲያ ቁጥጥር ተደረገ።
3.NONMMUT015812፣ በመዳፊት ሳንባ አድኖካርሲኖማ ውስጥ በሚያስደንቅ ሁኔታ የተስተካከለ እና በP53 እንደገና አገላለጽ አሉታዊ ቁጥጥር የተደረገው ሴሉላር ተግባሩን ለመተንተን ተገኝቷል።
4.NONMMUT015812 በ shRNAs ማገድ የKP ሴሎችን የመስፋፋት እና የፍልሰት ችሎታን ቀንሷል።NONMMUT015812 እምቅ ኦንኮጂን ነበር።
 በNONMMUT015812-Knockdown KP ሴሎች ውስጥ የ KEGG መንገድ ትንተና በተለየ ሁኔታ የተገለጹ ጂኖች |  በNONMMUT015812-Knockdown KP ሕዋሳት ውስጥ የጂን ኦንቶሎጂ ትንተና በተለየ ሁኔታ የተገለጹ ጂኖች |
ማጣቀሻ
የተስተካከለ lncRNA አገላለጽ መገለጫ በመዳፊት ሳንባ adenocarcinomas ከKRAS-G12D ሚውቴሽን እና P53 knockout[J] ጋር።ሴሉላር እና ሞለኪውላር ሜዲስን ጆርናል፣ 2019፣ 23(10)።DOI፡ 10.1111/jcm.14584
