-
የT2T ጂኖም አሰባሳቢ | እጅግ በጣም ረጅም ቅደም ተከተል
T2T (ቴሎሜር-ወደ-ቴሎሜር) ጂኖም ከፍተኛ ጥራት ላለው የጂኖም ስብስብ የወርቅ ደረጃ ሲሆን፣ ክፍተት የሌለው ወይም ክፍተት የሌለው፣ ከአንዱ ቴሎሜር ወደ ሌላኛው የሚዘልቅ የክሮሞሶም ሚዛን ጂኖም መልሶ ግንባታን የሚያመለክት ሲሆን ይህም የባህላዊ ጂኖም ስብስብ የመበታተን ገደቦችን የሚጥስ ነው።
በኮር ኦን ኦን ኦን ኦን ኦን እጅግ ረጅም የንባብ ቅደም ተከተል የተጎላበተ እና ከብዙ-መድረክ ጥልቅ ቅደም ተከተል እና ከተመቻቹ የባዮኢንፎርማቲክስ ቧንቧዎች ጋር የተዋሃደ፣ BMKGENE T2T የጂኖም መፍትሄ በጣም አስቸጋሪ የሆኑትን የጂኖሚክ “ጨለማ ክልሎች” - ቴሎሜርስ (በዩካርዮቲክ ክሮሞሶም ጫፎች ላይ ልዩ የሆኑ የኒውክሊዮፕሮቲን ውህዶች)፣ ከፍተኛ ኦርጋኒክ ሴንትሮሜርስ (ግዙፍ የታንደም ድግግሞሽ ድርድሮች) እና ሌሎች ውስብስብ ድግግሞሽ እና ሄትሮዚጎስ ሃፕሎታይፕ ክልሎችን ያነጣጠረ ሲሆን እነዚህም ለረጅም ጊዜ ለመደበኛ የረጅም ጊዜ ቅደም ተከተል መፍትሄ አያገኙም። እነዚህን ክልሎች አቋርጠው ቅደም ተከተል መሰባበር ወይም የቺሜሪክ ኮንቲግስ የሚያስከትሉ ባህላዊ ረጅም ንባቦች በተለየ፣ ኦን ኦን ኦን እጅግ ረጅም ንባቦች የማይገጣጠሙ ክፍተቶችን እና ውስብስብ ክልሎችን ሊሸፍኑ ይችላሉ። BMKGEne ለተለያዩ ዝርያዎች ክፍተት የሌላቸው ወይም ክፍተት የሌላቸው፣ ከፍተኛ ጥራት ያላቸው የT2T ጂኖሞችን ለማቅረብ ቁርጠኛ ነው።
የT2T ጂኖም ግንባታ ቀደም ሲል ተደራሽ ያልሆኑ ውስብስብ የጂኖሚክ ክልሎችን ይከፍታል፣ ወሳኝ የምርምር ክፍተቶችን ይሞላል፣ እና የዝርያ ዝግመተ ለውጥን፣ ተግባራዊ የጂን ማዕድን ማውጣትን፣ የሞለኪውላር እርባታ፣ ትክክለኛ ህክምና እና ሌሎች ዘመናዊ ሳይንሳዊ ምርምርን ጨምሮ ጥልቅ ጥናቶችን ለማድረግ ጠንካራ እና ከፍተኛ ትክክለኛነት ያለው መሰረታዊ መረጃ ይሰጣል።
-
ፕሮቲዮሚክስ
ፕሮቲዮሚክስ በፕሮቲኖች ላይ ያተኩራል - በኦርጋኒክ ግልባጭ ቁጥጥር ውስጥ ወሳኝ ሚና የሚጫወቱ የህይወት እንቅስቃሴዎች አስፈፃሚዎች። በቲሹዎች ወይም በሴሎች ውስጥ በተለዋዋጭ የሚለዋወጡ ፕሮቲኖችን ስብጥር፣ የአገላለጽ ደረጃዎች እና የማሻሻያ ሁኔታዎችን ይተነትናል፣ ይህም የፕሮቲን ብዛት ተለዋዋጭነት በተለያዩ የህይወት ሂደቶች ላይ ያለውን ከፍተኛ ተጽዕኖ ይመለከታል። በሕክምና፣ በግብርና እና በእንስሳት እርባታ በስፋት ይተገበራል። ጥራት ያለው ፕሮቲዮሚክስ የጄል ስትሪፕስ፣ አይፒ፣ እና CO-IP/Pull down ናሙናዎችን ጨምሮ ናሙናዎችን ለመለየት የHPLC-MS/MS ፕሮቲን መለያ ቴክኖሎጂን ይጠቀማል። ቁጥራዊ ፕሮቲዮሚክስ በጂኖም ወይም ውስብስብ በሆነ ድብልቅ ስርዓት ውስጥ የተገለጹትን ሁሉንም ፕሮቲኖች ትክክለኛ መጠን እና መለየት ያስገኛል። የአሁኑ የቁጥራዊ ፕሮቲዮሚክስ ቴክኖሎጂዎች በዋናነት በተሰየሙ (TMT) እና በመለያ-ነጻ (Label Free፣ DIA፣ PRM) አቀራረቦች ይመደባሉ። BMKGENE ባለብዙ-መድረክ እና ባለብዙ-ቴክኖሎጂ ፕሮቲዮሚክስ መፍትሄዎችን ይሰጣል።
-
ሜታቦሎሚክስ
ሜታቦሎሚክስ፣ የጂኖሚክስ ተፋሰስ ክፍል፣ በዋናነት ከ1500 ዳ በታች የሞለኪውላር ክብደት ያላቸውን ትናንሽ ሞለኪውሎችን ያነጣጠረ ነው። ሜታቦሎሚክስ ለውጭ ማነቃቂያዎች እና ለፊዚዮሎጂ/ፓቶሎጂካል ለውጦች የህዋሳትን ምላሽ በበለጠ ስሜታዊነት እንዲያንፀባርቁ ያስችላቸዋል። በጄኔቲክ ልዩነቶች ምክንያት የሚከሰቱ የሜታቦሊዝም ደረጃ ለውጦችም በምርምር ክልሉ ውስጥ ይገኛሉ፣ ይህም አዲስ የምርምር እይታን ይሰጣል።
BMKGENE ኢላማ ያልሆኑ ሜታቦሎሚክስ፣ በስፋት ኢላማ የተደረጉ ሜታቦሎሚክስ እና ኢላማ የተደረጉ ሜታቦሎሚክስን ጨምሮ ሙሉ የሜታቦሎሚክስ አገልግሎቶችን ይሰጣል። ፈሳሽ ክሮማቶግራፊ-ማስ ስፔክትሮሜትሪ (LC-MS) ወይም የጋዝ ክሮማቶግራፊ-ማስ ስፔክትሮሜትሪ (GC-MS) በመጠቀም፣ በእንስሳት ውስጥ ባሉ አብዛኛዎቹ ትናንሽ ሞለኪውሎች ሜታቦላይቶች ላይ የሚደረጉ ተለዋዋጭ ለውጦች ከውጭ ማነቃቂያ በፊት እና በኋላ ሊታወቁ ይችላሉ። የእነዚህ አገልግሎቶች ዋና ነገር በሙከራ እና በቁጥጥር ቡድኖች መካከል ጉልህ ልዩነቶች ያላቸውን ሜታቦላይቶች በመለየት እና ከፊዚዮሎጂ/ፓቶሎጂካል ለውጦች እና ከስር ባሉት ዘዴዎች ጋር ያላቸውን ትስስር የበለጠ በማሰስ ላይ ነው።
-
ኤክሶሶማል ኤምአርኤንኤ/ኤልንሲአርኤንኤ/ሲርክአርኤንኤ ሴክዊንሲንግ-ኢሉሚና
ኤክሶሶሞች በሴሎች የሚመነጩ ትናንሽ ቬሲሎች ሲሆኑ፣ በተለምዶ ከ30 እስከ 100 ናኖሜትር ዲያሜትር አላቸው። እነዚህ ቬሲሎች የተለያዩ አር ኤን ኤ ይይዛሉ። ኤክሶሶሞች በሴሉላር ግንኙነት፣ በሽታ የመከላከል ምላሾች እና የበሽታ እድገት ውስጥ ወሳኝ ሚና እንደሚጫወቱ ይታመናል፣ እና እንደ ፕላዝማ፣ ምራቅ እና ሽንት ባሉ የሰውነት ፈሳሾች ወደ ሌሎች የሰውነት ክፍሎች ሊሰራጩ ይችላሉ። የተቀባዩ ሴሎችን ተግባራት ለመቆጣጠር የተወሰኑ ባዮሞለኪውሎችን ይይዛሉ፣ ይህም የሴሉላር ፊዚዮሎጂ ሁኔታዎችን ይነካል። ኤክሶሶሞች በበሽታ እድገት ውስጥ ቁልፍ ሚና እንደሚጫወቱ ይታሰባል፣ ካንሰርን፣ የነርቭ በሽታ አምጪ በሽታዎችን እና የእብጠት ሁኔታዎችን ጨምሮ። በኤክሶሶሞች ላይ የተደረገው ጥናት ለበሽታዎች ምርመራ፣ ሕክምና እና መከላከል አዳዲስ ግንዛቤዎችን እና ዘዴዎችን ይሰጣል።
-
ኤክሶሶማል ስሞል አር ኤን ኤ ሴክዩንሲንግ-ኢሉሚና
ኤክሶሶሞች በሴሎች የሚለቀቁ ትናንሽ ቬሲሎች ሲሆኑ፣ በተለምዶ ከ30 እስከ 100 ናኖሜትሮች ዲያሜትር አላቸው። እነዚህ ቬሲሎች የተለያዩ አር ኤን ኤዎችን ይይዛሉ። በኤክሶሶሞች ውስጥ ካሉት የአር ኤን ኤ ዓይነቶች መካከል በጣም የተለመደው እና በስፋት የተጠኑት ማይክሮ አር ኤን ኤ (ሚአር ኤን ኤ) ነው። ሚአር ኤን ኤ በግምት 18-25 ኑክሊዮታይዶች ርዝመት ያላቸው ኮድ-አልባ ትናንሽ አር ኤን ኤዎች ክፍል ነው። ከ3′ ያልተተረጎመ ክልል (3′ UTR) ጋር በማያያዝ የድህረ-ትራንስክሪፕሽን ጂን ጸጥታን ያስታግሳሉ፣ በዚህም የጂን አገላለጽን ይቆጣጠራሉ። ለምሳሌ፣ በተወሰኑ የቲዩመር ሴሎች የሚወጡት ኤክሶሶሞች እንደ miR-126 እና miR-92a ያሉ የተወሰኑ ሚአር ኤን ኤዎችን ይይዛሉ። እነዚህ ሚአር ኤን ኤዎች በተቀባይ ሴሎች ውስጥ የጂን አገላለጽ ላይ ተጽዕኖ ሊያሳድሩ እና የቲዩመር አንጂዮጄኔሲስን ሊያበረታቱ ይችላሉ (ቶሞሂሮ ኡሜዙ፣ እና ሌሎችም፣ ኦንኮጅን፣ 2012)።
-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptionome
የቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ በቲሹዎች ውስጥ የጂን አገላለጽን ለመያዝ እና በዓይነ ሕሊናችን ለመሳል የሚያስችል ዘዴ ነው። ይህ ሴሎች እንዴት እንደሚገናኙ ለመረዳት ወሳኝ ሊሆን ይችላል።
ለዚህ አቀራረብ የተለያዩ መድረኮች አሉ። በዚህ ጉዳይ ላይ፣ BMKGene BMKManu 3000 Spatial Transcriptome Chip አዘጋጅቷል፣ ይህም የቴክኒክ አፈጻጸምን የሚያሻሽል፣ የንዑስ ሴሉላር ጥራት ላይ የሚደርስ እና ባለብዙ ደረጃ ጥራት ቅንብርን የሚያነቃ መድረክ ነው።
ይህ ቺፕ በቦታ ባርኮድ የተደረደሩ መመርመሪያዎችን በጫኑ ዶቃዎች የተደረደሩ ማይክሮዌሎችን በመጠቀም 4.2 ሚሊዮን ቦታዎችን ይይዛል። በዚህ ዘዴ፣ ከተቀረጸ እና ከተጨመረ በኋላ፣ ከኢሉሚና ጋር የሚስማማ ባርኮድ የተደረደሩ ናሙናዎችን የያዘ የcDNA ቤተ-መጽሐፍት እናገኛለን።
በመረጃው ላይ፣ የቦታ ባርኮድ እና የUMIዎች ጥምረት የተፈጠረውን መረጃ ትክክለኛነት እና ዝርዝርነት ያረጋግጣል። ከላይ የተጠቀሱትን ሁሉ በማጣመር፣ BMKManu እጅግ በጣም ሁለገብ የውሂብ ቅንብር ያቀርባል።
-
DNBSEQ ቀድሞ የተሰሩ ቤተ-መጻሕፍት
በኤምጂአይ የተገነባው DNBSEQ፣ የቅደም ተከተል ወጪዎችን በመቀነስ እና የውጤት መጠንን በመጨመር የቻለ አዲስ የNGS ቴክኖሎጂ ነው። የDNBSEQ ቤተ-መጻሕፍት ዝግጅት የዲኤንኤ መበታተን፣ የssDNA ዝግጅት እና የዲኤንኤ ናኖቦሎችን (DNB) ለማግኘት የሚሽከረከር ክብ ማጉያን ያካትታል። እነዚህ ከዚያም በጠጣር ወለል ላይ ተጭነው በመቀጠልም በኮምቢናቶሪያል ፕሮቤ-አንቸር ሲንተሲስ (cPAS) ቅደም ተከተል ይደረደራሉ። የDNBSEQ ቴክኖሎጂ ዝቅተኛ የማጉላት ስህተት መጠን የመኖሩን ጥቅሞች ከናኖቦሎች ጋር ከፍተኛ ጥግግት የስህተት ቅጦችን በመጠቀም ያጣምራል፣ ይህም ከፍተኛ throughput እና ትክክለኛነት ያለው ቅደም ተከተል ያስከትላል።
አስቀድሞ የተዘጋጀው የቤተ-መጻሕፍት ቅደም ተከተል አገልግሎታችን ደንበኞች ከተለያዩ ምንጮች (mRNA፣ ሙሉ ጂኖም፣ አምፒኮን፣ 10x ቤተ-መጻሕፍት እና ሌሎችም) የኢሉሚና ቅደም ተከተል ቤተ-መጻሕፍትን እንዲያዘጋጁ ያስችላቸዋል፣ እነዚህም በቤተ-ሙከራዎቻችን ውስጥ ወደ MGI ቤተ-መጻሕፍት ተቀይረው በDNBSEQ-T7 ቅደም ተከተል እንዲቀመጡ ያስችላቸዋል፣ ይህም ከፍተኛ የውሂብ መጠን በዝቅተኛ ወጪ እንዲኖር ያስችላል።
-
በሃይ-ሲ ላይ የተመሠረተ የክሮማቲን መስተጋብር
ሃይ-ሲ የመመርመሪያ ቅርበት ላይ የተመሰረቱ መስተጋብሮችን እና ከፍተኛ-ውጤት ቅደም ተከተልን በማጣመር የጂኖሚክ ውቅርን ለመያዝ የተነደፈ ዘዴ ነው። ዘዴው የተመሠረተው በክሮማቲን ከፎርማልዴይድ ጋር በመገናኘት ላይ ሲሆን በመቀጠልም በተጣመሩ ቁርጥራጮች ብቻ የተገናኙ የሊጌሽን ምርቶችን እንዲፈጥሩ በሚያስችል መንገድ መፈጨት እና እንደገና መገጣጠም ላይ ነው። እነዚህን የሊጌሽን ምርቶች በቅደም ተከተል በማድረግ የጂኖምን 3D አደረጃጀት ማጥናት ይቻላል። ሃይ-ሲ በትንሹ የታሸጉትን (A ክፍሎች፣ ዩክሮማቲን) እና በትራንስክሪፕት ንቁ የመሆን ዕድላቸው ከፍተኛ የሆኑ የጂኖም ክፍሎችን ስርጭት እና የበለጠ በጥብቅ የታሸጉትን ክልሎች (B ክፍሎች፣ ሄትሮክሮማቲን) ለማጥናት ያስችላል። ሃይ-ሲ እንዲሁም ቶፖሎጂካል አሶሴሽን ዶሜይንስ (TADs)፣ የታጠፉ መዋቅሮች ያሏቸው እና ተመሳሳይ የአገላለጽ ቅጦች ሊኖራቸው የሚችል የጂኖም ክልሎችን ለመለየት እና የክሮማቲን ሉፖችን፣ በፕሮቲኖች አንድ ላይ የተጣበቁ እና ብዙውን ጊዜ በተቆጣጣሪ አካላት የበለፀጉ የዲኤንኤ ክልሎችን ለመለየት ጥቅም ላይ ሊውል ይችላል። የቢኤምኬጂኔ የሃይ-ሲ ቅደም ተከተል አገልግሎት ተመራማሪዎች የጂኖሚክስን የቦታ ገጽታዎች እንዲመረምሩ ያስችላቸዋል፣ ይህም የጂኖም ቁጥጥርን እና በጤና እና በበሽታ ላይ ያለውን አንድምታ ለመረዳት አዳዲስ መንገዶችን ይከፍታል።
-
PacBio 2+3 ሙሉ-ርዝመት mRNA መፍትሄ
በኤንጂኤስ ላይ የተመሠረተ የኤንአርኤንኤ ቅደም ተከተል የጂን አገላለጽን ለመለካት ሁለገብ መሳሪያ ቢሆንም፣ በአጭር ንባብ ላይ ያለው ጥገኝነት ውስብስብ በሆነ የትራንስክሪፕቶሚክ ትንተናዎች ውስጥ ውጤታማነቱን ይገድባል። በሌላ በኩል፣ የፓክባዮ ቅደም ተከተል (Iso-Seq) ረጅም ንባብ ያለው ቴክኖሎጂን ይጠቀማል፣ ይህም የሙሉ ርዝመት mRNA ግልባጮችን ቅደም ተከተል እንዲኖር ያስችላል። ይህ አካሄድ አማራጭ ስፒሊንግ፣ የጂን ፊውዥን እና ፖሊ-አዴኒሌሽን አጠቃላይ ፍለጋን ያመቻቻል፣ ምንም እንኳን ለጂን አገላለጽ መጠን ዋና ምርጫ ባይሆንም። የ2+3 ጥምረት ተመሳሳይ ኢሶፎርሞችን ለመለካት የተሟላውን የትራንስክሪፕት ኢሶፎርሞችን እና የኤንጂኤስ ቅደም ተከተል ስብስብን ለመለየት በኢሉሚና እና በፓክባዮ መካከል ያለውን ክፍተት በPacBio HiFi ንባቦች ላይ በመደገፍ ያገናኛል።
መድረኮች፡ PacBio Revio እና Illumina NovaSeq
-
ጂኖም-አቀፍ የአሶሴሽን ትንተና
የጂኖም-ዋይድ አሶሴሽን ጥናቶች (GWAS) ዓላማ ከተወሰኑ ባህሪያት (phenotypes) ጋር የተያያዙ የጄኔቲክ ልዩነቶችን (ጂኖታይፕ) መለየት ነው። GWAS በብዙ ግለሰቦች ውስጥ በጠቅላላው ጂኖም ውስጥ የጄኔቲክ ምልክቶችን በመመርመር፣ በሕዝብ ደረጃ ስታትስቲካዊ ትንታኔዎች አማካኝነት የጂኖታይፕ-ፌኖታይፕ ማህበራትን ያወጣል። ይህ ዘዴ የሰውን በሽታዎች በመመርመር እና በእንስሳት ወይም በእፅዋት ውስጥ ካሉ ውስብስብ ባህሪያት ጋር የተያያዙ ተግባራዊ ጂኖችን በማሰስ ሰፊ አፕሊኬሽኖችን ያገኛል።
በBMKGENE፣ GWASን በትልልቅ ህዝቦች ላይ ለማካሄድ ሁለት መንገዶችን እናቀርባለን፡- ሙሉ-ጂኖም ሴኪንግ (WGS) መጠቀም ወይም የተቀነሰ የውክልና ጂኖም ሴኪንግ ዘዴን መምረጥ፣ ይህም በቤት ውስጥ የተዘጋጀው Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) ነው። WGS ለአነስተኛ ጂኖሞች ተስማሚ ቢሆንም፣ SLAF ረጅም ጂኖሞች ያላቸውን ትላልቅ ህዝቦች ለማጥናት ወጪ ቆጣቢ አማራጭ ሆኖ ብቅ ይላል፣ የቅደም ተከተል ወጪዎችን በብቃት ይቀንሳል፣ እንዲሁም ከፍተኛ የጄኔቲክ ምልክት ማድረጊያ ግኝት ውጤታማነትን ያረጋግጣል።
-
ነጠላ-ኒውክሊየስ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
የነጠላ ሕዋስ ቀረጻ እና ብጁ የቤተ-መጻሕፍት ግንባታ ቴክኒኮች ልማት፣ ከከፍተኛ-ፍጥነት ቅደም ተከተል ጋር ተዳምሮ፣ በሴል ደረጃ የጂን አገላለጽ ጥናቶችን አብዮት አድርጓል። ይህ ግኝት ውስብስብ የሴል ህዝቦችን በጥልቀት እና የበለጠ አጠቃላይ ትንተና ያስችላል፣ በሁሉም ሴሎች ላይ ካለው አማካይ የጂን አገላለጽ ጋር የተያያዙ ገደቦችን በማለፍ እና በእነዚህ ህዝቦች ውስጥ ያለውን እውነተኛ ልዩነት በመጠበቅ። የነጠላ ሕዋስ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል (scRNA-seq) የማይካዱ ጥቅሞች ቢኖሩትም፣ የነጠላ ሕዋስ እገዳ መፍጠር አስቸጋሪ በሚሆንበት እና አዲስ ናሙናዎችን የሚፈልግባቸው በተወሰኑ ሕብረ ሕዋሳት ውስጥ ተግዳሮቶችን ያጋጥመዋል። በBMKGene፣ ይህንን መሰናክል የምንፈታው ዘመናዊውን 10X ጂኖሚክስ ክሮሚየም ቴክኖሎጂን በመጠቀም ነጠላ-ኒውክሊየስ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል (snRNA-seq) በማቅረብ ነው። ይህ አካሄድ በነጠላ ሕዋስ ደረጃ ለትራንስክሪፕቶሜ ትንተና ተስማሚ የሆኑ የናሙናዎችን ስፔክትረም ያሰፋል።
የኒውክሊየስ መነጠል የሚከናወነው በፈጠራው 10X Genomics Chromium ቺፕ ሲሆን ባለ ሁለት ቻናል ማይክሮፍሉይዲክስ ሲስተም ድርብ መስቀለኛ መንገድ አለው። በዚህ ስርዓት ውስጥ ባርኮዶችን፣ ፕሪመሮችን፣ ኢንዛይሞችን እና አንድ ኒውክሊየስን የያዙ የጄል ዶቃዎች በናኖሊተር መጠን ባለው የዘይት ጠብታዎች ውስጥ ተሸፍነው ጄል ቤድ-ኢ-ኢሙልሽን (ጂኢኤም) ይፈጥራሉ። የጂኢኤም ምስረታ ከተደረገ በኋላ የሴል ሊሲስ እና የባርኮድ ልቀት በእያንዳንዱ ጂኢኤም ውስጥ ይከሰታሉ። በመቀጠልም፣ የኤምአርኤንኤ ሞለኪውሎች 10X ባርኮዶችን እና ልዩ ሞለኪውላር መለያዎችን (UMIs) በማካተት ወደ cDNAs በተገላቢጦሽ ግልባጭ ይደረግላቸዋል። እነዚህ cDNAዎች ከዚያም ለመደበኛ የቅደም ተከተል ቤተ-መጽሐፍት ግንባታ ተገዢ ይሆናሉ፣ ይህም በነጠላ ሴል ደረጃ የጂን አገላለጽ መገለጫዎችን ጠንካራ እና ሁሉን አቀፍ ፍለጋን ያመቻቻል።
መድረክ፡ 10× ጂኖሚክስ ክሮሚየም እና ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
የእፅዋት/የእንስሳት ሙሉ ጂኖም ቅደም ተከተል
ሙሉ የጂኖም ቅደም ተከተል (WGS) የአንድን ኦርጋኒክ ጂኖም ሙሉ የዲኤንኤ ቅደም ተከተል በአንድ ጊዜ ለመወሰን የሚያገለግል ዘዴ ነው።
ብዙውን ጊዜ፣ አገልግሎቱ እንደ ማጣቀሻ ጂኖም መኖር በሁለት የተለያዩ ቡድኖች ይከፈላል፡
- ዴ ኖቮሙሉ የጂኖም ቅደም ተከተል።በዚህ ሁኔታ፣ የሚቀመመው ጂኖም የማጣቀሻ ጂኖም የለውም፣ እና በዚህ ምክንያት፣ የዚህ ቅደም ተከተል ዓላማ እሱን ማመንጨት (ወይም ያለውን ለማሻሻል) ነው። ይህ ዘዴ በንባቦች መካከል መደራረብ በመፍጠር የጂኖም አሰባሰብን ለማሻሻል ሁለቱንም፣ የኢሉሚና ዳታ እና የረጅም ጊዜ ቅደም ተከተልን መጠቀም አለበት።
- ዳግም ቅደም ተከተል።የሚታወቀው የማጣቀሻ ጂኖም ያላቸው የተለያዩ ዝርያዎችን አጠቃላይ የጂኖም ቅደም ተከተል ያመለክታል። በዚህ መሠረት፣ የግለሰቦች ወይም የሕዝቦች የጂኖሚክ ልዩነቶች የበለጠ ሊታወቁ ይችላሉ።
-
ሙሉ-ርዝመት mRNA ቅደም ተከተል-ናኖፖሬ
በኤንጂኤስ ላይ የተመሠረተ የኤምአርኤንኤ ቅደም ተከተል የጂን አገላለጽን ለመለካት ሁለገብ መሳሪያ ቢሆንም፣ በአጭር ንባብ ላይ ያለው ጥገኛነት ውስብስብ በሆነው የትራንስክሪፕቶሚክ ትንተናዎች ውስጥ ውጤታማነቱን ይገድባል። በሌላ በኩል ደግሞ የናኖፖሬ ቅደም ተከተል ረጅም ንባብ ቴክኖሎጂን ይጠቀማል፣ ይህም የሙሉ ርዝመት ያለው የኤምአርኤንኤ ቅጂዎችን ቅደም ተከተል ያስችላል። ይህ አካሄድ አማራጭ ስፒሊንግ፣ የጂን ፊውዥንስ፣ ፖሊ-አዴኒሌሽን እና የኤምአርኤንኤ ኢሶፎርሞችን መጠን አጠቃላይ ምርመራን ያመቻቻል።
ናኖፖሬ ሴክዩንሲንግ፣ በናኖፖሬ ነጠላ-ሞለኪውል በእውነተኛ-ጊዜ የኤሌክትሪክ ምልክቶች ላይ የተመሰረተ ዘዴ፣ በእውነተኛ-ጊዜ ውጤቶችን ይሰጣል። በሞተር ፕሮቲኖች የሚመራ፣ ድርብ-ክር ያለው ዲኤንኤ በባዮፊልም ውስጥ ከተካተቱት ናኖፖሬ ፕሮቲኖች ጋር ይያያዛል፣ በቮልቴጅ ልዩነት ስር በናኖፖሬ ቻናል ውስጥ ሲያልፍ ይፈታዋል። በዲኤንኤ ክር ላይ ባሉ የተለያዩ መሠረቶች የሚመነጩት ልዩ የኤሌክትሪክ ምልክቶች በእውነተኛ-ጊዜ ተገኝተው ይመደባሉ፣ ይህም ትክክለኛ እና ቀጣይነት ያለው የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተልን ያመቻቻል። ይህ ፈጠራዊ አቀራረብ የአጭር-ንባብ ገደቦችን ያሸንፋል እና ውስብስብ የትራንስክሪፕቶሚክ ጥናቶችን ጨምሮ ውስብስብ የጂኖሚክ ትንተና ተለዋዋጭ መድረክ ያቀርባል።
መድረክ፡ ናኖፖሬ ፕሮሜቲዮን 48
