-
የጂኖም-ሰፊ ማህበር ትንተና
የጂኖም-ሰፊ ማህበር ጥናት (GWAS) ዓላማው ከተወሰኑ ባህሪያት (phenotype) ጋር የተያያዙ የዘረመል ልዩነቶችን (ጂኖታይፕ) ለመለየት ነው።የGWAS ጥናት የጄኔቲክ ማርከሮች ብዙ ግለሰቦችን ሙሉ ጂኖም ያቋርጣሉ እና በሕዝብ ደረጃ በስታቲስቲካዊ ትንታኔ የጂኖታይፕ-ፍኖታይፕ ማህበራትን ይተነብያል።በእንስሳት ወይም በእጽዋት ውስብስብ ባህሪያት ላይ በሰዎች በሽታዎች እና በተግባራዊ የጂን ቁፋሮ ላይ በምርምር ላይ በስፋት ተተግብሯል.
-
ነጠላ-ኒውክሊየስ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
የነጠላ ሴል ቀረጻ እና የግለሰብ ቤተመፃህፍት ግንባታ ቴክኒክ ከከፍተኛ ደረጃ ቅደም ተከተል ጋር በማጣመር የጂን አገላለጽ በሴል ላይ ጥናት ለማድረግ ያስችላል።ውስብስብ በሆኑ የሕዋስ ህዝቦች ላይ ጥልቅ እና የተሟላ የሥርዓት ትንተና እንዲኖር ያስችላል፣ በዚህ ውስጥ የሁሉንም ህዋሶች አማካኝ በመውሰድ የልዩነታቸውን መደበቅ በእጅጉ ያስወግዳል።
ይሁን እንጂ አንዳንድ ሴሎች ወደ ነጠላ ሕዋስ እገዳ ለመሥራት ተስማሚ አይደሉም, ስለዚህ ሌሎች የናሙና ዝግጅት ዘዴዎች - ኒውክሊየስ ከቲሹዎች ማውጣት ያስፈልጋሉ, ማለትም, ኒውክሊየስ በቀጥታ ከቲሹዎች ወይም ሴል ተወስዶ ወደ ነጠላ-ኒውክሊየስ እገዳ ለነጠላ- የሕዋስ ቅደም ተከተል.
BMK ባለ 10× ጂኖሚክስ ChromiumTM ነጠላ ሴል አር ኤን ኤ ተከታታይ አገልግሎት ይሰጣል።ይህ አገልግሎት ከበሽታ ጋር በተያያዙ ጥናቶች እንደ የበሽታ ተከላካይ ሕዋሳት ልዩነት ፣የእጢ ልዩነት ፣ የሕብረ ሕዋሳት እድገት ፣ ወዘተ ባሉ ጥናቶች ላይ በሰፊው ጥቅም ላይ ውሏል።
የቦታ ትራንስክሪፕት ቺፕ፡ 10× ጂኖሚክስ
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ 6000
-
የእፅዋት/የእንስሳ ሙሉ ጂኖም ቅደም ተከተል
ሙሉ የጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል፣ እንዲሁም WGS በመባል የሚታወቀው፣ ነጠላ ኑክሊዮታይድ ፖሊሞርፊዝም (SNP)፣ የማስገባት ስረዛ (InDel)፣ የመዋቅር ልዩነት (SV) እና የቁጥር ልዩነትን (CNV) ጨምሮ በጠቅላላው ጂኖም ላይ ሁለቱንም የተለመዱ እና ያልተለመዱ ሚውቴሽን ለማሳየት ያስችላል። ).SVs ከ SNPs የበለጠ የልዩነት መሰረቱን ይይዛሉ እና በጂኖም ላይ የበለጠ ተፅእኖ አላቸው ፣ ይህም በህያዋን ፍጥረታት ላይ ከፍተኛ ተጽዕኖ ያሳድራል።ረጅም ንባቦች እንደ ታንደም ተደጋጋሚ፣ ጂሲ/ኤቲ-የበለፀጉ ክልሎች እና ከፍተኛ ተለዋዋጭ ክልሎች ባሉ ውስብስብ ክልሎች ላይ ክሮሞሶም መሻገርን በጣም ቀላል ስለሚያደርግ የረጅም ጊዜ ንባቦችን እና የተወሳሰቡ ልዩነቶችን በበለጠ ትክክለኛነት ለመለየት ያስችላል።
መድረክ፡ ኢሉሚና፣ ፓክባዮ፣ ናኖፖሬ
-
BMKMANU S1000 የቦታ ትራንስክሪፕት
የሕዋስ የቦታ አደረጃጀት በተለያዩ ባዮሎጂያዊ ሂደቶች ውስጥ ወሳኝ ሚና ይጫወታል፣ ለምሳሌ የበሽታ መከላከያ ሰርጎ መግባት፣ ሽል እድገት፣ ወዘተ።በቴክኖሎጂ እድገት ፣ እጅግ በጣም ግልፅ የሆነ የቲሹ ሞርፎሎጂ እና የቦታ ሞለኪውላር አገላለጽ ትክክለኛ መዋቅራዊ ልዩነት በከፍተኛ ጥራት ማጥናት ያስፈልጋል።BMKGENE ከናሙናዎች እስከ ባዮሎጂካል ግንዛቤዎች ሁሉን አቀፍ፣ አንድ-ማቆሚያ የቦታ ትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል አገልግሎት ይሰጣል።
የመገኛ ቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ ቴክኖሎጂዎች በልዩ ልዩ የምርምር መድረክ ውስጥ የጂን አገላለጽ መገለጫን ከቦታ ይዘት ጋር በተለያዩ ናሙናዎች በመፍታት ልብ ወለድ እይታዎችን አበረታተዋል።
የቦታ ትራንስክሪፕት ቺፕ፡ BMKMANU S1000
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ 6000
-
10x ጂኖሚክስ ቪዚየም የቦታ ትራንስክሪፕት
ቪዚየም ስፓሻል ጂን አገላለጽ በጠቅላላ ኤምአርኤን ላይ የተመሰረተ ቲሹን ለመመደብ ዋና የቦታ ትራንስክሪፕት ተከታታይ ቴክኖሎጂ ነው።ስለ መደበኛ እድገት፣ በሽታ ፓቶሎጂ እና ክሊኒካዊ የትርጉም ምርምር አዳዲስ ግንዛቤዎችን ለማግኘት ሙሉውን ትራንስክሪፕት ከሥነ-ቅርጽ አውድ ጋር ካርታ ያውጡ።BMKGENE ከናሙናዎች እስከ ባዮሎጂካል ግንዛቤዎች ሁሉን አቀፍ፣ አንድ-ማቆሚያ የቦታ ትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል አገልግሎት ይሰጣል።
የመገኛ ቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ ቴክኖሎጂዎች የጂን አገላለጽ መገለጫን ከቦታ ይዘት ጋር በተለያዩ ናሙናዎች በመፍታት በተለያዩ የምርምር መድረክ ላይ አዳዲስ አመለካከቶችን አበረታተዋል።.
የቦታ ትራንስክሪፕት ቺፕ፡ 10x ጂኖሚክስ ቪዚየም
መድረክ፡ኢሉሚና ኖቫሴክ 6000
-
ባለሙሉ ርዝመት mRNA ቅደም ተከተል-ናኖፖር
የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ለአጠቃላይ የጽሑፍ ግልባጭ ትንተና በዋጋ ሊተመን የማይችል መሳሪያ ነው።ምንም ጥርጥር የለውም፣ ተለምዷዊ የአጭር-ንባብ ቅደም ተከተል እዚህ ውስጥ ብዙ ጠቃሚ እድገቶችን አግኝቷል።ቢሆንም፣ ብዙ ጊዜ በሙሉ ርዝመት አይዞፎርም መለያዎች፣ መጠናዊ፣ PCR አድልዎ ላይ ገደቦች ያጋጥመዋል።
የናኖፖር ቅደም ተከተል እራሱን ከሌሎች ተከታታይ መድረኮች ይለያል, ምክንያቱም ኑክሊዮታይዶች ያለ ዲ ኤን ኤ ውህደት በቀጥታ ይነበባሉ እና በአስር ኪሎባዝ ረጅም ንባብ ያመነጫሉ.ይህ በቀጥታ የተነበበ የሙሉ ርዝመት ግልባጮችን ማቋረጫ እና በአይሶፎርም-ደረጃ ጥናቶች ውስጥ ያሉ ተግዳሮቶችን ለመቋቋም ኃይል ይሰጣል።
መድረክ፦ናኖፖሬ ፕሮሜሽን
ቤተ መጻሕፍት፡ሲዲኤንኤ-PCR
-
ባለሙሉ ርዝመት mRNA ቅደም ተከተል -PacBio
ደ ኖቮየሙሉ ርዝመት ግልባጭ ቅደም ተከተል፣ እንዲሁም በመባል ይታወቃልደ ኖቮኢሶ-ሴክ የሙሉ ርዝመት ሲዲኤንኤ ሞለኪውሎችን ያለ ምንም እረፍት ቅደም ተከተል ለማስያዝ የሚያስችል የPacBio sequencer ጥቅሞችን በንባብ ርዝመት ይወስዳል።ይህ በጽሁፍ ግልባጭ የመሰብሰቢያ ደረጃዎች ውስጥ የሚፈጠሩ ማናቸውም ስህተቶችን ሙሉ በሙሉ ያስወግዳል እና በ isoform-ደረጃ ጥራት የዩኒጂን ስብስቦችን ይገነባል።ይህ ዩኒጂን ስብስቦች ኃይለኛ የጄኔቲክ መረጃን እንደ “ማጣቀሻ ጂኖም” በጽሑፍ ግልባጭ ደረጃ ያቀርባል።በተጨማሪም፣ ከቀጣዩ ትውልድ ተከታታይ መረጃ ጋር በማጣመር፣ ይህ አገልግሎት የኢሶፎርም-ደረጃ አገላለጽ ትክክለኛ መጠንን ያጎናጽፋል።
መድረክ፡- PacBio Sequel IIቤተ-መጽሐፍት: SMRT ደወል ቤተ-መጽሐፍት -
Eukaryotic mRNA Sequencing-Ilumina
የኤምአርኤን ቅደም ተከተል በተወሰኑ ሁኔታዎች ውስጥ ከሴሎች የተገለበጡ ሁሉንም mRNAs መገለጫ ማድረግ ያስችላል።የጂን አገላለጽ መገለጫን፣ የጂን አወቃቀሮችን እና የአንዳንድ ባዮሎጂካል ሂደቶችን ሞለኪውላዊ ዘዴዎችን ለማሳየት ኃይለኛ ቴክኖሎጂ ነው።እስካሁን ድረስ፣ የኤምአርኤንኤ ቅደም ተከተል በመሠረታዊ ምርምር፣ በክሊኒካዊ ምርመራ፣ በመድኃኒት ልማት፣ ወዘተ በስፋት ተቀጥሯል።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ 6000
-
በማጣቀሻ ላይ የተመሰረተ mRNA Sequencing-Illumina
mRNA sequencing መልእክተኛውን አር ኤን ኤ (ኤም አር ኤን ኤ) ለመያዝ የሚቀጥለው ትውልድ ቅደም ተከተል ቴክኒክን (NGS) ይጠቀማል ይህም በተወሰነ ጊዜ ውስጥ አንዳንድ ልዩ ተግባራት እየሰሩ ነው።በጣም ረጅሙ የጽሑፍ ግልባጭ 'Unigene' ተብሎ ይጠራ ነበር እና ለቀጣይ ትንተና እንደ ማመሳከሪያ ቅደም ተከተል ያገለግል ነበር ፣ ይህ ውጤታማ ዘዴ የዝርያውን ሞለኪውላዊ ዘዴ እና የቁጥጥር መረብን ያለማጣቀሻ ለማጥናት ነው።
ከተገለበጠ መረጃ ከተሰበሰበ እና ዩኒጂን ተግባራዊ ማብራሪያ በኋላ
(1) የኤስኤስአር ትንተና፣ የሲዲኤስ ትንበያ እና የጂን አወቃቀር አስቀድሞ ይዘጋጃል።
(2) በእያንዳንዱ ናሙና ውስጥ የዩኒጂን አገላለጽ መጠን ይከናወናል.
(3) በናሙናዎች (ወይም ቡድኖች) መካከል በተለየ ሁኔታ የተገለጹ ዩኒጂንስ በዩኒጂን አገላለጽ ላይ ተመስርተው ይገኛሉ።
(4) በልዩነት የተገለጹ ዩኒጂንስ ክላስተር፣ ተግባራዊ ማብራሪያ እና ማበልፀጊያ ትንተና ይከናወናል።
-
ረጅም ኮድ ያልሆነ ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
ረጅም ኮድ ያልሆኑ አር ኤን ኤዎች (lncRNAs) ከ 200 nt በላይ ርዝመት ያላቸው የአር ኤን ኤ ሞለኪውሎች አይነት ናቸው፣ እነዚህም እጅግ በጣም ዝቅተኛ በሆነ ኮድ የመፃፍ አቅም ተለይተው ይታወቃሉ።LncRNA፣ ኮድ በማይሰጡ አር ኤን ኤዎች ውስጥ እንደ ቁልፍ አባል፣ በዋናነት በኒውክሊየስ እና በፕላዝማ ውስጥ ይገኛል።በቴክኖሎጂ እና በባዮኢንፎርሜሽን ቅደም ተከተል ውስጥ ያለው እድገት በርካታ ልብ ወለድ lncRNAዎችን ለመለየት እና እነዚያን ከባዮሎጂካል ተግባራት ጋር ለማያያዝ ያስችላል።የተጠራቀሙ መረጃዎች እንደሚያሳዩት lncRNA በሰፊው በኤፒጄኔቲክ ደንብ፣ በጽሑፍ ግልባጭ እና በድህረ-ጽሑፍ ደንብ ውስጥ ይሳተፋል።
