የፕሮካርዮቲክ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
ባህሪያት
● የአር ኤን ኤ ናሙና ሂደት የ rRNA መሟጠጥን እና የአቅጣጫ አር ኤን ኤ ቤተ-መጽሐፍት ዝግጅትን ያካትታል።
● ከማጣቀሻ ጂኖም ጋር በማጣጣም ላይ የተመሠረተ ባዮኢንፎርማቲክ ትንተና
● ትንተና የጂን አገላለጽ እና DEGsን ያካትታል ነገር ግን የትራንስክሪፕት መዋቅር እና የsRNA ትንተናንም ያካትታል
የአገልግሎት ጥቅሞች
●ጥብቅ የጥራት ቁጥጥር፦ ከናሙና እና ከቤተ-መጽሐፍት ዝግጅት ጀምሮ እስከ ቅደም ተከተል እና ባዮኢንፎርማቲክስ ድረስ በሁሉም ደረጃዎች ዋና የቁጥጥር ነጥቦችን ተግባራዊ እናደርጋለን። ይህ ጥንቃቄ የተሞላበት ክትትል በተከታታይ ከፍተኛ ጥራት ያላቸውን ውጤቶች ማድረስን ያረጋግጣል።
●በክር ላይ የተወሰነ የቅደም ተከተል መረጃ: የአር ኤን ኤ ቤተ-መጽሐፍት ዝግጅት አቅጣጫዊ በመሆኑ፣ ፀረ-ስሜት ህዋሳትን ለመለየት ያስችላል።
●ለፕሮካርዮቲክ ትራንስክሪፕቶሞች የተዘጋጀ የተሟላ ትንታኔባዮኢንፎርማቲክ ቧንቧ መስመር የጂን አገላለጽ ትንተና ብቻ ሳይሆን የኦፔሮን፣ የUTRዎችን እና የማስተዋወቂያዎችን መለየትን ጨምሮ የትራንስክሪፕት አወቃቀሩን ትንተና ያካትታል። እንዲሁም የsRNAs ትንተናን ያካትታል፣ ማለትም የሁለተኛ ደረጃ መዋቅር እና ኢላማዎች ማብራሪያ እና ትንበያ።
●የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ: ቁርጠኝነታችን ከፕሮጀክቱ መጠናቀቅ ባሻገር ከሽያጭ በኋላ ለ3 ወራት የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ፣ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመመለስ የፕሮጀክት ክትትል፣ የመላ ፍለጋ እርዳታ እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።
የናሙና መስፈርቶች እና አቅርቦት
| ቤተ መጻሕፍት | የቅደም ተከተል ስትራቴጂ | የሚመከር ውሂብ | የጥራት ቁጥጥር |
| የ rRNA የተሟጠጠ የአቅጣጫ ቤተ-መጽሐፍት | ኢሉሚና PE150 | 1-2 Gb | ሩብ 30≥85% |
የናሙና መስፈርቶች፡
| ኮንክ.(ng/μl) | መጠን (μg) | ንጽሕና | ታማኝነት |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260/280=1.8-2.0 OD260/230=1.0-2.5 በጄል ላይ የተወሰነ ወይም ምንም የፕሮቲን ወይም የዲኤንኤ ብክለት አይታይም። | RIN≥6.5 |
የሚመከር የናሙና አቅርቦት
ኮንቴይነር፡ 2 ሚሊ ሊትር የሴንትሪፉጅ ቱቦ (የቲን ፎይል አይመከርም)
የናሙና መለያ፡ ቡድን+ድግምግሞሽ ለምሳሌ A1፣ A2፣ A3፤ B1፣ B2፣ B3።
ጭነት፡
1. ደረቅ በረዶ፡- ናሙናዎቹ በከረጢቶች ውስጥ መታሸግ እና በደረቅ በረዶ ውስጥ መቀበር አለባቸው።
2. RNA-ሊረጋጉ የሚችሉ ቱቦዎች፡- RNA ናሙናዎች በRNA ማረጋጊያ ቱቦ ውስጥ ሊደርቁ እና በክፍል ሙቀት ውስጥ ሊላኩ ይችላሉ።
የአገልግሎት የስራ ፍሰት
የናሙና አቅርቦት
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች
የባዮኢንፎርማቲክ ትንተና የስራ ፍሰት
የሚከተለውን ትንታኔ ያካትታል፡
● ጥሬ የውሂብ ጥራት ቁጥጥር
● ከማጣቀሻ ጂኖም ጋር አሰላለፍ
● የቤተ መፃህፍት ጥራት ግምገማ፡ የአር ኤን ኤ መበታተን በዘፈቀደ፣ የማስገቢያ መጠን እና የቅደም ተከተል ሙሌት
● የተተነበዩ የኮድ ጂኖች ተግባራዊ ማብራሪያ
● የገለጻ ትንተና፡ ትስስር እና ዋና ዋና የክፍሎች ትንተና (PCA)
● የዲፈረንሻል ጂን አገላለጽ (DEGs)
● የDEGዎች ተግባራዊ ማብራሪያ እና ማበልጸጊያ
● የsRNA ትንተና፡ ትንበያ፣ ማብራሪያ፣ ዒላማ እና ሁለተኛ ደረጃ መዋቅር ትንበያ
● የትራንስክሪፕት አወቃቀር ትንተና፡ ኦፔሮን፣ የመነሻ እና የመጨረሻ ቦታዎች፣ ያልተተረጎመ ክልል (UTS)፣ ፕሮሞተር እና የSNP/InDel ትንተና
የቅደም ተከተል ሙሌት
የኮድ ጂኖች ተግባራዊ ማብራሪያ
በናሙናዎች መካከል ያለው ትስስር
የዲፈረንሻል ኤክስፕሬሽን ጂኖች (DEGs) ትንተና
የተግባር ማበልጸጊያ ትንተና
የsRNA ማብራሪያ
በዚህ ተለይቶ በቀረበ ህትመት ውስጥ በBMKGene's Nanopore ሙሉ-ርዝመት mRNA ቅደም ተከተል አገልግሎቶች የተመቻቹትን እድገቶች ያስሱ።
ጓን፣ ሲፒ እና ሌሎችም (2018) 'የሶፎሪያ አልፖኩሮይድስን አጠቃላይ አልካሎይድ የሚቋቋም የባዮፊልም-ፎርሚንግ ስቴፕሎኮከስ ኤፒደርሚዲስ ዓለም አቀፍ የትራንስክሪፕቶሜም ለውጦች'፣የማይክሮባዮሎጂ የፖላንድ ጆርናል፣ 67(2) ፣ ገጽ. 223. doi: 10.21307 / PJM-2018-024.
