-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptionome
የቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ በቲሹዎች ውስጥ የጂን አገላለጽን ለመያዝ እና በዓይነ ሕሊናችን ለመሳል የሚያስችል ዘዴ ነው። ይህ ሴሎች እንዴት እንደሚገናኙ ለመረዳት ወሳኝ ሊሆን ይችላል።
ለዚህ አቀራረብ የተለያዩ መድረኮች አሉ። በዚህ ጉዳይ ላይ፣ BMKGene BMKManu 3000 Spatial Transcriptome Chip አዘጋጅቷል፣ ይህም የቴክኒክ አፈጻጸምን የሚያሻሽል፣ የንዑስ ሴሉላር ጥራት ላይ የሚደርስ እና ባለብዙ ደረጃ ጥራት ቅንብርን የሚያነቃ መድረክ ነው።
ይህ ቺፕ በቦታ ባርኮድ የተደረደሩ መመርመሪያዎችን በጫኑ ዶቃዎች የተደረደሩ ማይክሮዌሎችን በመጠቀም 4.2 ሚሊዮን ቦታዎችን ይይዛል። በዚህ ዘዴ፣ ከተቀረጸ እና ከተጨመረ በኋላ፣ ከኢሉሚና ጋር የሚስማማ ባርኮድ የተደረደሩ ናሙናዎችን የያዘ የcDNA ቤተ-መጽሐፍት እናገኛለን።
በመረጃው ላይ፣ የቦታ ባርኮድ እና የUMIዎች ጥምረት የተፈጠረውን መረጃ ትክክለኛነት እና ዝርዝርነት ያረጋግጣል። ከላይ የተጠቀሱትን ሁሉ በማጣመር፣ BMKManu እጅግ በጣም ሁለገብ የውሂብ ቅንብር ያቀርባል።
-
ነጠላ-ኒውክሊየስ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
የነጠላ ሕዋስ ቀረጻ እና ብጁ የቤተ-መጻሕፍት ግንባታ ቴክኒኮች ልማት፣ ከከፍተኛ-ፍጥነት ቅደም ተከተል ጋር ተዳምሮ፣ በሴል ደረጃ የጂን አገላለጽ ጥናቶችን አብዮት አድርጓል። ይህ ግኝት ውስብስብ የሴል ህዝቦችን በጥልቀት እና የበለጠ አጠቃላይ ትንተና ያስችላል፣ በሁሉም ሴሎች ላይ ካለው አማካይ የጂን አገላለጽ ጋር የተያያዙ ገደቦችን በማለፍ እና በእነዚህ ህዝቦች ውስጥ ያለውን እውነተኛ ልዩነት በመጠበቅ። የነጠላ ሕዋስ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል (scRNA-seq) የማይካዱ ጥቅሞች ቢኖሩትም፣ የነጠላ ሕዋስ እገዳ መፍጠር አስቸጋሪ በሚሆንበት እና አዲስ ናሙናዎችን የሚፈልግባቸው በተወሰኑ ሕብረ ሕዋሳት ውስጥ ተግዳሮቶችን ያጋጥመዋል። በBMKGene፣ ይህንን መሰናክል የምንፈታው ዘመናዊውን 10X ጂኖሚክስ ክሮሚየም ቴክኖሎጂን በመጠቀም ነጠላ-ኒውክሊየስ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል (snRNA-seq) በማቅረብ ነው። ይህ አካሄድ በነጠላ ሕዋስ ደረጃ ለትራንስክሪፕቶሜ ትንተና ተስማሚ የሆኑ የናሙናዎችን ስፔክትረም ያሰፋል።
የኒውክሊየስ መነጠል የሚከናወነው በፈጠራው 10X Genomics Chromium ቺፕ ሲሆን ባለ ሁለት ቻናል ማይክሮፍሉይዲክስ ሲስተም ድርብ መስቀለኛ መንገድ አለው። በዚህ ስርዓት ውስጥ ባርኮዶችን፣ ፕሪመሮችን፣ ኢንዛይሞችን እና አንድ ኒውክሊየስን የያዙ የጄል ዶቃዎች በናኖሊተር መጠን ባለው የዘይት ጠብታዎች ውስጥ ተሸፍነው ጄል ቤድ-ኢ-ኢሙልሽን (ጂኢኤም) ይፈጥራሉ። የጂኢኤም ምስረታ ከተደረገ በኋላ የሴል ሊሲስ እና የባርኮድ ልቀት በእያንዳንዱ ጂኢኤም ውስጥ ይከሰታሉ። በመቀጠልም፣ የኤምአርኤንኤ ሞለኪውሎች 10X ባርኮዶችን እና ልዩ ሞለኪውላር መለያዎችን (UMIs) በማካተት ወደ cDNAs በተገላቢጦሽ ግልባጭ ይደረግላቸዋል። እነዚህ cDNAዎች ከዚያም ለመደበኛ የቅደም ተከተል ቤተ-መጽሐፍት ግንባታ ተገዢ ይሆናሉ፣ ይህም በነጠላ ሴል ደረጃ የጂን አገላለጽ መገለጫዎችን ጠንካራ እና ሁሉን አቀፍ ፍለጋን ያመቻቻል።
መድረክ፡ 10× ጂኖሚክስ ክሮሚየም እና ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
