የሙቀት ካርታ
የሙቀት ካርታ መሳሪያው የማትሪክስ የውሂብ ፋይልን እንደ ግብዓት ይቀበላል እና ተጠቃሚዎች ውሂብን እንዲያጣሩ፣ መደበኛ እንዲሆኑ እና እንዲያከማቹ ያስችላቸዋል። የሙቀት ካርታዎች ዋና የአጠቃቀም ጉዳይ በተለያዩ ናሙናዎች መካከል የጂን አገላለጽ ደረጃ የክላስተር ትንተና ነው።
የጂን ማብራሪያ
የጂን ማብራሪያ መሳሪያው የFASTA ግቤት ፋይሎችን ከተለያዩ የውሂብ ጎታዎች ጋር በቅደም ተከተል በማስተካከል ላይ በመመስረት የጂን ማብራሪያ ያከናውናል።
መሰረታዊ የአካባቢ አሰላለፍ ፍለጋ መሳሪያ (BLAST)
የBLAST መሳሪያው የ NCBI BLAST የBMKCloud የተቀናጀ ስሪት ሲሆን ወደ BMKCloud መለያ የተሰቀለ ውሂብ በመጠቀም ተመሳሳይ ተግባራትን ለማከናወን ሊያገለግል ይችላል።
የCDS_UTR ትንበያ
የCDS_UTR ትንበያ መሳሪያ በBLAST ውጤቶች እና በORF ትንበያ ውጤቶች ላይ በመመስረት በተሰጡ የትራንስክሪፕት ቅደም ተከተሎች ውስጥ የኮድ ክልሎችን (CDS) እና ያልሆኑ የኮዲንግ ክልሎችን (UTR) ለመተንበይ የተነደፈ ነው።
የማንሃተን ፕላት
የማንሃተን ፕሎት መሳሪያ ከፍተኛ የናሙና ሙከራዎችን ለማሳየት ያስችላል እና በጂኖም-አቀፍ የአሶሴሽን ጥናቶች (GWAS) ውስጥ በብዛት ጥቅም ላይ ይውላል።
የሰርኮስ ዲያግራም
የCIRCOS ዲያግራም መሳሪያ በጂኖም ውስጥ የጂኖሚክ ባህሪ እንዴት እንደሚሰራጭ ውጤታማ በሆነ መልኩ ምስላዊ እይታ ይሰጣል። የተለመዱ ባህሪያት መጠናዊ ሎሲ፣ SNPs፣ InDels፣ መዋቅራዊ እና የቅጂ ቁጥር ልዩነቶችን ያካትታሉ።
የጂን ኦንቶሎጂ (GO) ማበልጸጊያ
የGO Enrichment መሳሪያ ተግባራዊ የማበልጸጊያ ትንተና ይሰጣል። በዚህ መሳሪያ ውስጥ ያለው ዋናው ሶፍትዌር የTopGO-Bioconductor ጥቅል ሲሆን ይህም የDifferential expression analysis፣ GO enrichment analysis እና የውጤቶቹን ምስላዊነት ያካትታል።
የክብደት ጂን የጋራ-አገላለጽ አውታረ መረብ ትንተና (WGCNA)
WGCNA የጂን የጋራ-አገላለጽ ሞጁሎችን ለማግኘት በስፋት ጥቅም ላይ የሚውል የውሂብ ማዕድን ማውጣት ዘዴ ነው። ማይክሮአሬይ እና የNGS የጂን አገላለጽ መረጃን ጨምሮ ለተለያዩ የአገላለጽ የውሂብ ስብስብ ተፈጻሚ ይሆናል።
ኢንተርፕሮስካን
የኢንተርፕሮስካን መሳሪያ የኢንተርፕሮ ፕሮቲን ቅደም ተከተል ትንተና እና ምደባ ይሰጣል።
የጂ ኬጂ ማበልጸጊያ
የGO KEGG ማበልጸጊያ መሳሪያው በተሰጠው የጂን ስብስብ እና ተዛማጅ ማብራሪያ ላይ በመመስረት የGO ማበልጸጊያ ሂስቶግራም፣ የKEGG ማበልጸጊያ ሂስቶግራም እና የKEGG ማበልጸጊያ መንገድን ለማመንጨት የተነደፈ ነው።
