የሙቀት ካርታ
የHeatmap መሳሪያው የማትሪክስ ውሂብ ፋይልን እንደ ግብአት ይቀበላል እና ተጠቃሚዎች መረጃን እንዲያጣሩ፣ መደበኛ እንዲያደርጉ እና እንዲሰበስቡ ያስችላቸዋል። ለሙቀት ካርታዎች ዋናው የአጠቃቀም ጉዳይ በተለያዩ ናሙናዎች መካከል ያለውን የጂን አገላለጽ ደረጃ ክላስተር ትንተና ነው።
የጂን ማብራሪያ
የጂን ማብራሪያ መሳሪያው የ FASTA ፋይሎችን ከተለያዩ የውሂብ ጎታዎች ጋር በቅደም ተከተል በማጣመር የጂን ማብራሪያን ያከናውናል።
መሰረታዊ የአካባቢ አሰላለፍ ፍለጋ መሳሪያ (BLAST)
የBLAST መሳሪያ የ BMKCloud የተቀናጀ የNCBI BLAST ስሪት ነው እና ወደ BMKCloud መለያ የተሰቀለውን ውሂብ በመጠቀም ተመሳሳይ ተግባራትን ለማከናወን ሊያገለግል ይችላል።
CDS_UTR ትንበያ
የCDS_UTR ትንበያ መሳሪያ በBLAST ውጤቶች ላይ በሚታወቁ የፕሮቲን ዳታቤዝ እና የ ORF ትንበያ ውጤቶች ላይ በመመርኮዝ በተሰጡ የጽሑፍ ቅደም ተከተሎች ውስጥ ኮድ መስጫ ክልሎችን (CDS) እና ኮድ የማይሰጡ ክልሎችን (UTR) ለመተንበይ የተነደፈ ነው።
ማንሃተን ሴራ
የማንሃታን ፕላት መሳሪያ ከፍተኛ የናሙና ሙከራዎችን ለማሳየት ያስችላል እና በተለምዶ በጂኖም-ሰፊ ማህበር ጥናቶች (GWAS) ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላል።
የሲርኮስ ንድፍ
የCIRCOS ዲያግራም መሳሪያ የጂኖም ባህሪ በጂኖም ውስጥ እንዴት እንደሚሰራጭ ውጤታማ እይታን ይሰጣል። የተለመዱ ባህሪያት መጠናዊ loci፣ SNPs፣ InDels፣ መዋቅራዊ እና የቅጂ ቁጥር ልዩነቶች ያካትታሉ።
የጂን ኦንቶሎጂ (GO) ማበልጸግ
የGO ማበልጸጊያ መሳሪያው ተግባራዊ የማበልጸጊያ ትንተና ይሰጣል። በዚህ መሣሪያ ውስጥ ያለው ቀዳሚ ሶፍትዌር የ TopGO-Bioconductor ጥቅል ነው፣ ይህም ልዩነት መግለጫ ትንተና፣ GO ማበልጸጊያ ትንተና እና የውጤቶችን እይታን ያካትታል።
ክብደት ያለው የጂን የጋራ መግለጫ አውታረ መረብ ትንተና (WGCNA)
WGCNA የጂን አብሮ አገላለጽ ሞጁሎችን ለማግኘት በስፋት ጥቅም ላይ የዋለ የመረጃ ማውጣት ዘዴ ነው። የማይክሮአረይ እና የኤንጂኤስ የጂን አገላለጽ ውሂብን ጨምሮ ለተለያዩ የገለጻ ዳታ ስብስቦች ተፈጻሚ ይሆናል።
ኢንተርፕሮስካን
የኢንተርፕሮስካን መሳሪያ የ InterPro ፕሮቲን ቅደም ተከተል ትንተና እና ምደባ ያቀርባል።
GO KEGG ማበልጸጊያ
የGO KEGG ማበልፀጊያ መሳሪያ የ GO ማበልፀጊያ ሂስቶግራም ፣ KEGG ማበልፀጊያ ሂስቶግራም እና የ KEGG ማበልፀጊያ መንገድ በዘረመል ስብስብ እና በተዛማጅ ማብራሪያ ላይ በመመስረት የተነደፈ ነው።