የዩካርዮቲክ mRNA ትንተና (በማጣቀሻ ላይ የተመሠረተ እና አዲስ አማራጮች ይገኛሉ)
ይህ የቧንቧ መስመር የNGS RNA-Seq ውሂብን እንደ ግብዓት የሚጠቀም ሲሆን ከብዙ የታችኛው ተፋሰስ ትንታኔዎች ውጤቶችን ያስገኛል፤ ከእነዚህም ውስጥ ግን በእነዚህ ብቻ የተወሰነ አይደለም፤ዴ ኖቮየትራንስክሪፕት ጣቢያ ማብራሪያ፣ ተለዋዋጭ የስፕሊንግ ትንተና፣ የልዩነት አገላለጽ ትንተና፣ የተግባር ማብራሪያ እና የማበልጸጊያ ትንተና።
ረጅም ኮድ ያልሆነ አር ኤን ኤ ትንተና
ረጅም ኮድ-አልባ አር ኤን ኤዎች (lncRNA) ከ200 nt በላይ ርዝመት ያላቸው እና በክሮማቲን አደረጃጀት እና ቁጥጥር ውስጥ ሚና እንደሚጫወቱ የሚታወቁ ኮድ-አልባ ግልባጮች ናቸው። ከፍተኛ-ፍጥነት ቅደም ተከተል ቴክኖሎጂዎች እና ባዮኢንፎርማቲክ የlncRNA ቅደም ተከተሎችን እና የአቀማመጥ መረጃን የመረዳት ችሎታችንን ወሳኝ የቁጥጥር ተግባራት ያላቸውን lncRNAs ለመለየት አስችለዋል። ይህ የቧንቧ መስመር በዩካርዮቲክ mRNA ትንተና ቧንቧ ውስጥ ከተጠቀሱት ትንታኔዎች በተጨማሪ lncRNA ትንተና ይሰጣል።
16S/18S/ITS የአምፕሊኮን ቅደም ተከተል
የአምፒኮን ሴኩዌንሲንግ የማይክሮባላዊ ልዩነት ትንተና መስመር የተገነባው በማይክሮባላዊ ልዩነት ፕሮጀክት ትንተና ውስጥ ለዓመታት ባሳለፈው ልምድ ላይ በመመስረት ነው። የቧንቧ መስመር ደረጃውን የጠበቀ መሰረታዊ ትንተናን የያዘ ሲሆን ይህም የአሁኑ የማይክሮባላዊ ምርምር እና የግል ትንተና ዋና ዋና የትንታኔ ይዘቶችን ይሸፍናል። የትንታኔ ሪፖርቱ የበለፀገ እና ሁሉን አቀፍ ሲሆን የተለያዩ የግል ትንተናዎችን የማከናወን አማራጭ አለው። በተጨማሪም፣ ናሙናዎች እና ቡድኖች ለተጨማሪ ማበጀት እና ቁጥጥር በሂደት ላይ ሊሻሻሉ ይችላሉ።
የሾትገን ሜታጂኖሚክስ ትንተና
የሾትጉን ሜታጂኖሚክ ትንተና መስመር ከአካባቢ ናሙናዎች የተወሰዱ የተደባለቁ የጂኖሚክ ቁሶችን የNGS መረጃን ይጠቀማል። የተካተቱት ትንታኔዎች ስለ ዝርያዎች ልዩነት እና ብዛት፣ የህዝብ ብዛት አወቃቀር፣ የፊሎጄኔቲክ ግንኙነት፣ ተግባራዊ ጂኖች እና ከአካባቢያዊ ሁኔታዎች ጋር ስላለው ትስስር አውታረ መረቦች ዝርዝር መረጃ ይሰጣሉ።
የNGS-WGS ተለዋዋጭ ትንተና
የNGS-WGS ተለዋዋጭ ትንተና የውሂብ ጥራት ቁጥጥርን፣ የቅደም ተከተል አሰላለፍን፣ ማብራሪያን እና የጂን ሚውቴሽን ትንተናን የሚያከናውን የተቀናጀ የተለዋዋጭ መፈለጊያ ቧንቧ ነው። የቧንቧ መስመሩ ለSNP እና InDel ለይቶ ማወቅ የGATK ምርጥ ልምዶችን የሚከተል ሲሆን ማንታን ለመዋቅራዊ ተለዋጭ ጥሪ ይጠቀማል።
የጂኖም ዋይድ አሶሴሽን ጥናት (GWAS)
የGWAS ቧንቧ መስመር ቀደም ሲል የተፈጠሩ የVCF ፋይሎችን እና ተዛማጅ የፊኖታይፕ መረጃዎችን ለግለሰቦች ቡድን እንደ ግብዓት የሚወስድ የታችኛው ትንተና ነው። የተወሰኑ የስታቲስቲክስ ዘዴዎችን በመጠቀም፣ GWAS ከፊኖታይፕ ልዩነቶች ጋር የተያያዙ የጂኖም-አቀፍ ኑክሊዮታይድ ልዩነቶችን ለማግኘት ያለመ ነው። ውስብስብ ከሆኑ የሰው ልጅ በሽታዎች እና በእፅዋትና በእንስሳት ውስጥ ካሉ ውስብስብ ባህሪያት ጋር የተያያዙ ተግባራዊ ጂኖችን በመፈለግ ረገድ ወሳኝ ሚና ይጫወታል።
የጅምላ ክፍፍል ትንተና (BSA)
የቢኤስኤ ትንተና እጅግ በጣም ፌኖታይፕ ባህሪያት ያላቸውን ግለሰቦች ከተለየ ሕዝብ ማዋሃድን ያካትታል። በተዋሃዱ ናሙናዎች መካከል ያለውን ልዩነት በማነፃፀር፣ ይህ አካሄድ ከዒላማ ጂኖች ጋር የተያያዙ በቅርበት የተገናኙ ሞለኪውላዊ ምልክቶችን በፍጥነት ይለያል። በእፅዋትና በእንስሳት የጄኔቲክ ካርታ ስራ በስፋት ጥቅም ላይ የሚውል ሲሆን በማርከር የታገዘ እርባታ ለማድረግ ጠቃሚ መሳሪያ ነው።
የዝግመተ ለውጥ ጄኔቲክስ ትንተና
የዝግመተ ለውጥ ጄኔቲክስ ትንተና የስራ ፍሰት የBMKGENEን በጄኔቲክ ዝግመተ ለውጥ ፕሮጀክቶች ውስጥ ያለውን ሰፊ ልምድ የሚጠቀም ሲሆን የፊሎጄኔቲክ ዛፍ ግንባታ፣ የሊንክኤጅ አለመመጣጠን ትንተና፣ የጄኔቲክ ልዩነት ግምገማ፣ የምርጫ ክሊን መለየት፣ የዝምድና ትንተና፣ ዋና ዋና የክፍሎች ትንተና እና የህዝብ አወቃቀር ባህሪን ያካትታል።
