-
ሜታጂኖሚክ ሴኩዊንሲንግ -NGS
ሜታጂኖም እንደ የአካባቢ እና የሰው ሜታጂኖም ያሉ የተደባለቀ የህዋሳት ማህበረሰብ አጠቃላይ የጄኔቲክ ቁሳቁስ ስብስብ ነው። ሊበቅሉ የሚችሉ እና ሊታረሱ የማይችሉ ረቂቅ ተሕዋስያን ጂኖሞችን ይዟል። ከኤንጂኤስ ጋር የተኩስ ሽጉጥ ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል እነዚህን ውስብስብ የጂኖሚክ መልክዓ ምድሮች ከታክሶኖሚክ መገለጫ በላይ በማቅረብ በአካባቢ ናሙናዎች ውስጥ የተካተቱትን ጥናት ያስችላል፣ ይህም ስለ ዝርያዎች ልዩነት፣ የብዛት ተለዋዋጭነት እና ውስብስብ የህዝብ አወቃቀሮች ጥልቅ ግንዛቤዎችን ይሰጣል። ከታክሶኖሚክ ጥናቶች በተጨማሪ፣ የሹትቦን ሜታጂኖሚክስ ተግባራዊ የጂኖሚክስ እይታን ይሰጣል፣ ይህም የተመሰጠሩ ጂኖችን እና በሥነ-ምህዳር ሂደቶች ውስጥ ያላቸውን ሚና እንዲመረምር ያስችላል። በመጨረሻም፣ በጄኔቲክ ንጥረ ነገሮች እና በአካባቢያዊ ሁኔታዎች መካከል ያለው የትስስር አውታረ መረቦች መመስረት በማይክሮባላዊ ማህበረሰቦች እና በሥነ-ምህዳር ዳራቸው መካከል ያለውን ውስብስብ መስተጋብር ሁሉን አቀፍ ግንዛቤ ለማግኘት ይረዳል። ለማጠቃለል፣ ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል የተለያዩ የማይክሮባላዊ ማህበረሰቦችን የጂኖሚክ ውስብስብነት ለመፍታት እንደ ወሳኝ መሳሪያ ሆኖ ያገለግላል፣ በእነዚህ ውስብስብ ሥነ-ምህዳሮች ውስጥ በጄኔቲክስ እና በኢኮሎጂ መካከል ያለውን ባለብዙ ገጽታ ግንኙነት ያበራል።
መድረኮች፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ እና DNBSEQ-T7
-
ሜታጀኖሚክ ሴኩዊንሲንግ-ቲጂኤስ
ሜታጂኖም እንደ የአካባቢ እና የሰው ሜታጂኖም ያሉ የተደባለቀ የህዋሳት ማህበረሰብ የጄኔቲክ ቁሳቁስ ስብስብ ነው። ሊበቅሉ የሚችሉ እና ሊታረሱ የማይችሉ ረቂቅ ተሕዋስያን ጂኖሞችን ይዟል። ሜታጂኖም ቅደም ተከተል እነዚህን ውስብስብ የጂኖሚክ መልክዓ ምድሮች ከታክሶኖሚክ መገለጫ በላይ በማቅረብ በኢኮሎጂካል ናሙናዎች ውስጥ የተካተቱትን ለማጥናት ያስችላል። እንዲሁም የተመዘገቡ ጂኖችን እና በአካባቢ ሂደቶች ውስጥ ያላቸውን ሚና በመቃኘት ተግባራዊ የጂኖሚክስ እይታን ይሰጣል። ከኢሉሚና ቅደም ተከተል ጋር ባህላዊ የሾትጉ አቀራረቦች በሜታጂኖሚክ ጥናቶች ውስጥ በስፋት ጥቅም ላይ ሲውሉ፣ የናኖፖር እና የፓክባዮ ረጅም ንባብ ቅደም ተከተል መምጣት መስክን ቀይሮታል። የናኖፖር እና የፓክባዮ ቴክኖሎጂ የታችኛውን ባዮኢንፎርማቲክ ትንታኔዎችን በተለይም የሜታጂኖም ስብሰባን ያሻሽላሉ፣ ይህም የበለጠ ቀጣይ ስብሰባዎችን ያረጋግጣል። ሪፖርቶች እንደሚያሳዩት ናኖፖር ላይ የተመሰረቱ እና በፓክባዮ ላይ የተመሰረቱ ሜታጂኖሚክስ ከተወሳሰቡ ማይክሮባዮሞች የተሟላ እና የተዘጉ የባክቴሪያ ጂኖሞችን በተሳካ ሁኔታ አምጥተዋል (ሞስ፣ ኤል፣ እና ሌሎች፣ ኔቸር ባዮቴክ፣ 2020)። የናኖፖሬ ንባቦችን ከኢሉሚና ንባቦች ጋር ማዋሃድ የስህተት እርማት ስትራቴጂካዊ አቀራረብን ይሰጣል፣ የናኖፖሬ ውስጣዊ ዝቅተኛ ትክክለኛነትን ይቀንሳል። ይህ የተመሳሳይ ጥምረት የእያንዳንዱን የቅደም ተከተል መድረክ ጥንካሬዎች ይጠቀማል፣ ሊከሰቱ የሚችሉ ገደቦችን ለማሸነፍ እና የሜታጀኖሚክ ትንታኔዎችን ትክክለኛነት እና አስተማማኝነት ለማሳደግ ጠንካራ መፍትሄ ይሰጣል።
መድረክ፡ ናኖፖሬ ፕሮሜቲዮን 48፣ ኢሉሚያ እና ፓክባዮ ሪቪዮ
-
16S/18S/ITS የአምፒኮን ሴክዊንንግ-ፓክባዮ
የ16S እና 18S rRNA ጂኖች ከውስጣዊ ትራንስክሪብድ ስፔሰር (ITS) ክልል ጋር በመሆን፣ በከፍተኛ ሁኔታ የተጠበቁ እና ከፍተኛ-ተለዋዋጭ ክልሎች ጥምረት ምክንያት እንደ ወሳኝ ሞለኪውላዊ የጣት አሻራ ጠቋሚዎች ሆነው ያገለግላሉ፣ ይህም የፕሮካርዮቲክ እና የዩኩሪዮቲክ ህዋሳትን ለመለየት እጅግ ጠቃሚ መሳሪያዎች ያደርጋቸዋል። የእነዚህ ክልሎች ማጉላት እና ቅደም ተከተል በተለያዩ ስነ-ምህዳሮች ውስጥ የማይክሮባላዊ ስብጥር እና ልዩነትን ለመመርመር ከማግለል ነፃ የሆነ አቀራረብ ይሰጣል። የኢሉሚና ቅደም ተከተል በተለምዶ እንደ 16S እና ITS1 ያሉ አጫጭር ሃይፐርተለዋዋጭ ክልሎችን ኢላማ ሲያደርግ፣ የላቀ የታክሶኖሚክ ማብራሪያ ሙሉውን የ16S፣ 18S እና ITS ርዝመት በመከተል ሊደረስበት እንደሚችል ታይቷል። ይህ ሁሉን አቀፍ አቀራረብ በትክክል የተመደቡ ቅደም ተከተሎችን ከፍተኛ መቶኛ ያስገኛል፣ ይህም እስከ ዝርያዎች መለያነት የሚዘልቅ የጥራት ደረጃ ይደርሳል። የፓክባዮ ነጠላ-ሞለኪውል እውነተኛ ጊዜ (SMRT) ቅደም ተከተል መድረክ ሙሉ ርዝመት ያላቸውን አምፒኮኖች የሚሸፍኑ በጣም ትክክለኛ ረጅም ንባቦችን (HiFi) በማቅረብ ጎልቶ ይታያል፣ የኢሉሚና ቅደም ተከተል ትክክለኛነትን ይወዳደራል። ይህ ችሎታ ተመራማሪዎች ተወዳዳሪ የሌለውን ጥቅም እንዲያገኙ ያስችላቸዋል - የጄኔቲክ መልክዓ ምድርን ፓኖራሚክ እይታ። የተራዘመው ሽፋን በተለይም በባክቴሪያ ወይም በፈንገስ ማህበረሰቦች ውስጥ በዝርያዎች ማብራሪያ ውስጥ ያለውን ጥራት በእጅጉ ከፍ ያደርገዋል፣ ይህም የማይክሮባላዊ ህዝቦችን ውስብስብነት በጥልቀት ለመረዳት ያስችላል።
-
16S/18S/ITS የአምፒኮን ሴክዊንንግ-NGS
በኢሉሚና ቴክኖሎጂ የሚመራው የአምፒኮን ቅደም ተከተል፣ በተለይም 16S፣ 18S እና ITS የጄኔቲክ ማርከሮችን የሚያነጣጥር፣ በማይክሮባላዊ ማህበረሰቦች ውስጥ ያለውን ፋይሎጀኒ፣ ታክሶኖሚ እና የዝርያዎች ብዛት ለመፈታት ኃይለኛ ዘዴ ነው። ይህ አካሄድ የቤት አያያዝ የጄኔቲክ ማርከሮችን ከፍተኛ ተለዋዋጭ ክልሎች ቅደም ተከተል ማስያዝን ያካትታል። መጀመሪያ ላይ እንደ ሞለኪውላዊ የጣት አሻራ የቀረበው በዎሴስ እና ሌሎችምእ.ኤ.አ. በ1977 ይህ ዘዴ ከመነጠል ነፃ የሆኑ ትንታኔዎችን በማስቻል የማይክሮባዮም ፕሮፋይሊንግን አብዮት አድርጓል። ተመራማሪዎች በ16S (ባክቴሪያ)፣ 18S (ፈንገሶች) እና በInternal Transcribed Spacer (ITS፣ ፈንገሶች) ቅደም ተከተል አማካኝነት የተትረፈረፈ ዝርያዎችን ብቻ ሳይሆን ብርቅዬ እና ያልታወቁ ዝርያዎችን መለየት ይችላሉ። በስፋት እንደ ወሳኝ መሳሪያ ተቀባይነት ያገኘው የአምፒኮን ቅደም ተከተል በተለያዩ አካባቢዎች ውስጥ ያሉ የተለያዩ የማይክሮባላዊ ውህዶችን ለመለየት ወሳኝ ሚና ተጫውቷል፣ ይህም የሰው አፍ፣ አንጀት፣ ሰገራ እና ከዚያም በላይ ነው።
-
የባክቴሪያ እና የፈንገስ ሙሉ ጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል
የባክቴሪያ እና የፈንገስ ሙሉ ጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል ፕሮጀክቶች የማይክሮባላዊ ጂኖሞችን ማጠናቀቅ እና ማወዳደር በማስቻል የማይክሮባላዊ ጂኖሞችን ለማራመድ ወሳኝ ናቸው። ይህ የማፍላት ምህንድስናን፣ የኢንዱስትሪ ሂደቶችን ማመቻቸት እና የሁለተኛ ደረጃ ሜታቦሊዝም መንገዶችን መመርመርን ያመቻቻል። በተጨማሪም የፈንገስ እና የባክቴሪያ ዳግም ቅደም ተከተል የአካባቢን መላመድ ለመረዳት፣ ዝርያዎችን ማመቻቸት እና በህክምና፣ በግብርና እና በአካባቢ ሳይንስ ላይ ሰፊ አንድምታ ያለው የጄኔቲክ ዝግመተ ለውጥ ተለዋዋጭነትን ለመግለጥ ወሳኝ ነው።
-
የፕሮካርዮቲክ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል በተወሰኑ ሁኔታዎች ውስጥ በሴሎች ውስጥ ያሉትን ሁሉንም የአር ኤን ኤ ግልባጮች አጠቃላይ መገለጫ እንዲያገኝ ያስችለዋል። ይህ ዘመናዊ ቴክኖሎጂ ውስብስብ የጂን አገላለጽ መገለጫዎችን፣ የጂን አወቃቀሮችን እና ከተለያዩ ባዮሎጂካል ሂደቶች ጋር የተያያዙ ሞለኪውላዊ ዘዴዎችን የሚያጋልጥ ኃይለኛ መሳሪያ ሆኖ ያገለግላል። በመሠረታዊ ምርምር፣ በክሊኒካዊ ምርመራዎች እና በመድኃኒት ልማት በስፋት ጥቅም ላይ የዋለው አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል የሴሉላር ተለዋዋጭነት እና የጄኔቲክ ቁጥጥር ውስብስብነት ላይ ግንዛቤዎችን ይሰጣል። የእኛ የፕሮካርዮቲክ አር ኤን ኤ ናሙና ሂደት ለፕሮካርዮቲክ ትራንስክሪፕቶሞች የተበጀ ሲሆን ይህም የ rRNA መሟጠጥን እና የአቅጣጫ ቤተ-መጽሐፍት ዝግጅትን ያካትታል።
-
ሜታትራንስክሪፕቶሜ ሴኩዊንሲንግ
የኢሉሚና ቅደም ተከተል ቴክኖሎጂን በመጠቀም የቢኤምኬጄኔ የሜትትራንክሪፕቶሜ ቅደም ተከተል አገልግሎት እንደ አፈር፣ ውሃ፣ ባህር፣ ሰገራ እና አንጀት ባሉ ተፈጥሯዊ አካባቢዎች ውስጥ ከዩካርዮት እስከ ፕሮካርዮት እና ቫይረሶች ድረስ የተለያዩ ረቂቅ ተሕዋስያን ተለዋዋጭ የጂን አገላለጽን ያሳያል። አጠቃላይ አገልግሎታችን ተመራማሪዎች ውስብስብ የሆኑ ረቂቅ ተሕዋስያን ማህበረሰቦችን የተሟላ የጂን አገላለጽ መገለጫዎችን እንዲመረምሩ ያስችላቸዋል። ከታክሶኖሚክ ትንተና በተጨማሪ፣ የሜታትራንስክሪፕቶሜ ቅደም ተከተል አገልግሎታችን ተግባራዊ ማበልጸጊያ ፍለጋን ያመቻቻል፣ በተለያዩ የተገለጹ ጂኖች እና ሚናዎቻቸው ላይ ብርሃን ይፈነጥቃል። በእነዚህ የተለያዩ የአካባቢ ዘርፎች ውስጥ የጂን አገላለጽ፣ የታክሶኖሚክ ልዩነት እና ተግባራዊ ተለዋዋጭነት ውስብስብ ገጽታዎችን ሲዳስሱ በርካታ ባዮሎጂያዊ ግንዛቤዎችን ያግኙ።
-
ደ ኖቮ የፈንገስ ጂኖም ስብሰባ
ቢኤምኬጄኔ ለተለያዩ የምርምር ፍላጎቶች እና ለተፈለገው የጂኖም ሙሉነት የሚስማማ ለፈንገስ ጂኖሞች ሁለገብ መፍትሄዎችን ያቀርባል። አጭር ንባብ ያለው የኢሉሚና ቅደም ተከተል ብቻውን የረቂቅ ጂኖም እንዲፈጠር ያስችላል። አጭር ንባብ እና ረጅም ንባብ ያለው ናኖፖሬ ወይም ፓባዮን በመጠቀም ረዘም ላለ ጊዜ የሚቆይ ቅደም ተከተል ተጣምረው የበለጠ የተጣራ የፈንገስ ጂኖም ለማግኘት ይጣመራሉ።
-
ደ ኖቮ የባክቴሪያ ጂኖም ስብስብ
የተሟላ የባክቴሪያ ጂኖም ስብሰባ አገልግሎት እንሰጣለን፣ ይህም 0 ክፍተቶችን ዋስትና ይሰጣል። ይህ የሚቻለው እንደ ናኖፖሬ እና ፓክባዮ ያሉ ለረጅም ጊዜ የተነበቡ የቅደም ተከተል ቴክኖሎጂዎችን በማዋሃድ እና ለአጭር ጊዜ የተነበቡ የቅደም ተከተል ቴክኖሎጂዎችን በማዋሃድ ነው፣ ይህም የONT ንባቦችን የመገጣጠም ማረጋገጫ እና የስህተት እርማት ከኢሉሚና ጋር ለመገጣጠም እና ለአጭር ጊዜ የተነበቡ የቅደም ተከተል ቴክኖሎጂዎችን በማዋሃድ ነው። አገልግሎታችን ከመገጣጠም፣ ከተግባራዊ ማብራሪያ እና ከተራቀቀ ባዮኢንፎርማቲክ ትንተና የተሟላ የባዮኢንፎርማቲክ የስራ ፍሰትን ያቀርባል፣ ይህም የተወሰኑ የምርምር ግቦችን ያሟላል። ይህ አገልግሎት ለተለያዩ የጄኔቲክ እና የጂኖሚክ ጥናቶች ትክክለኛ የማጣቀሻ ጂኖሞችን ለማዘጋጀት ያስችላል። በተጨማሪም፣ እንደ ውጥረት ማመቻቸት፣ የጄኔቲክ ምህንድስና እና የማይክሮባላዊ ቴክኖሎጂ ልማት ላሉ አፕሊኬሽኖች መሠረት ይሆናል፣ ይህም ለሳይንሳዊ ግንዛቤዎች እና ለባዮቴክኖሎጂ ፈጠራ እድገት ወሳኝ እና አስተማማኝ እና ክፍተት የሌለበት የጂኖሚክ መረጃ ያረጋግጣል።
