ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል -ኤን.ኤስ
ሜታጂኖም እንደ የአካባቢ እና የሰው ሜታጂኖም ያሉ የተቀላቀሉ ህዋሳት ማህበረሰብ አጠቃላይ የዘረመል ቁስ ስብስብ ነው። በውስጡም ሊለሙ የሚችሉ እና የማይበቅሉ ረቂቅ ተሕዋስያን ጂኖም ይዟል. የሾትጉን ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል ከኤንጂኤስ ጋር እነዚህን ውስብስብ የጂኖሚክ መልክዓ ምድሮች ከታክሶኖሚክ መገለጫ በላይ በማቅረብ በአካባቢያዊ ናሙናዎች ውስጥ የተካተቱትን ለማጥናት ያስችላል። ከታክሶኖሚክ ጥናቶች ባሻገር፣ የተኩስ ሽጉጥ ሜታጂኖሚክስ እንዲሁ ተግባራዊ የሆነ የጂኖም እይታ ይሰጣል፣ ይህም ኢንኮድ የተደረገባቸው ጂኖች እና በስነምህዳር ሂደቶች ውስጥ ያላቸውን የማስቀመጥ ሚናዎች ለመፈተሽ ያስችላል። በመጨረሻም፣ በጄኔቲክ አካላት እና በአካባቢያዊ ሁኔታዎች መካከል የግንኙነት መረቦች መመስረት በጥቃቅን ተህዋሲያን ማህበረሰቦች እና በስነ-ምህዳር ዳራ መካከል ያለውን ውስብስብ መስተጋብር አጠቃላይ ግንዛቤን ለመፍጠር አስተዋፅኦ ያደርጋል። በማጠቃለያው፣ የሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል የተለያዩ ጥቃቅን ተህዋሲያን ማህበረሰቦችን ጂኖሚክ ውስብስብነት ለመፍታት፣ በእነዚህ ውስብስብ ስነ-ምህዳሮች ውስጥ በጄኔቲክስ እና በስነ-ምህዳር መካከል ያለውን ዘርፈ-ብዙ ግንኙነት የሚያበራ መሳሪያ ሆኖ ይቆማል።
መድረኮች፡ Illumina NovaSeq እና DNBSEQ-T7
የአገልግሎት ጥቅሞች
●ለጥቃቅን ተህዋሲያን ማህበረሰባዊ መገለጫ ማግለል እና ከማሳደግ-ነጻ ዘዴለማዳበር ካልቻሉ ፍጥረታት የጄኔቲክ ቁሳቁሶችን ቅደም ተከተል ማንቃት።
●ከፍተኛ ጥራትበአካባቢ ናሙናዎች ውስጥ ዝቅተኛ የተትረፈረፈ ዝርያዎችን ያግኙ.
●አጠቃላይ የባዮኢንፎርማቲክስ ትንተና፡-በታክሶኖሚክ ልዩነት ላይ ብቻ ሳይሆን በማህበረሰቡ ተግባራዊ ብዝሃነት ላይ ያተኮረ።
●ሰፊ ልምድ፡-በተለያዩ የምርምር ዘርፎች ውስጥ ያሉ በርካታ የሜታጂኖሚክስ ፕሮጄክቶችን በተሳካ ሁኔታ በመዝጋት እና ከ200,000 በላይ ናሙናዎችን በማዘጋጀት ታሪክ አማካኝነት ቡድናችን ለእያንዳንዱ ፕሮጀክት ብዙ ልምድን ያመጣል።
የአገልግሎት ዝርዝሮች
| ቅደም ተከተል መድረክ | የቅደም ተከተል ስልት | ውሂብ ይመከራል | የጥራት ቁጥጥር |
| Illumina NovaSeq ወይም DNBSEQ-T7 | ፒኢ150 | 6-20ጂቢ | Q30≥85% |
የአገልግሎት መስፈርቶች
| ትኩረት (ng/µL) | ጠቅላላ መጠን (ng) | መጠን (µL) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● አፈር / ዝቃጭ: 2-3 ግ
● የአንጀት ይዘት-እንስሳ: 0.5-2g
● የአንጀት ይዘቶች-ነፍሳት: 0.1-0.25g
● የእፅዋት ገጽታ (የበለፀገ ደለል): 0.5-1g
● የመፍላት ሾርባ የበለፀገ ደለል): 0.2-0.5g
● ሰገራ (ትላልቅ እንስሳት): 0.5-2g
● ሰገራ (አይጥ): 3-5 ጥራጥሬዎች
● የ pulmonary alveolar lavage ፈሳሽ፡ የማጣሪያ ወረቀት
● የሴት ብልት እጥበት: 5-6 ስዋቦች
● ቆዳ/ብልት ስዋብ/ምራቅ/የአፍ ለስላሳ ቲሹ/የፊንጢጣ እብጠት/የፊንጢጣ እጥበት፡2-3 ስዋብ
● Surface microorganism: 5-6 swabs
● የውሃ አካል/አየር/ባዮፊልም፡ የማጣሪያ ወረቀት
● Endophytes: 2-3g
● የጥርስ ንጣፍ: 0.5-1g
የአገልግሎት ሥራ ፍሰት
ናሙና መላኪያ
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች
የሚከተለውን ትንታኔ ያካትታል።
● የውሂብ ጥራት ቁጥጥር ቅደም ተከተል
● የሜታጂኖም ስብስብ እና የጂን ትንበያ
● የጂን ማብራሪያ
● የታክሶኖሚክ አልፋ ልዩነት ትንተና
● የማህበረሰቡ ተግባራዊ ትንተና-ባዮሎጂካል ተግባር, ሜታቦሊክ, አንቲባዮቲክ መቋቋም
● በሁለቱም በተግባራዊ እና በታክሶኖሚክ ልዩነት ላይ ትንተና፡-
የቤታ ልዩነት ትንተና
የቡድን ትንተና
የግንኙነት ትንተና-በአካባቢያዊ ሁኔታዎች እና OUT ስብጥር እና ልዩነት መካከል
ተግባራዊ ትንተና: CARD አንቲባዮቲክ መቋቋም
የ KEGG ሜታቦሊዝም መንገዶች ልዩነት ትንተና-የጉልህ መንገዶች የሙቀት ካርታ
የታክሶኖሚክ ስርጭት አልፋ ልዩነት፡ ACE ኢንዴክስ
የታክሶኖሚክ ስርጭት ቤታ ልዩነት፡ PCoA
በBKGene የሜታጂኖም ቅደም ተከተል አገልግሎቶች ከኢሉሚና ጋር በተዘጋጁ የሕትመት ስብስቦች አማካኝነት ያመቻቹትን እድገቶች ያስሱ።
ሃይ, Q. et al. (2023) ቀስተ ደመና ትራውት (Oncorhynchus mykiss) የአንጀት ይዘቶች ላይ ለውጥ metagenomic እና metabolomic ትንተና በተለያዩ የባህል የውሃ ሙቀት ላይ ተላላፊ hematopoietic necrosis ቫይረስ,በማይክሮባዮሎጂ ውስጥ ድንበር, 14, ገጽ. 1275649. doi: 10.3389 / FMCB.2023.1275649.
ማኦ, ሲ እና ሌሎች. (2023) 'ተህዋሲያን ማህበረሰቦች፣ የመቋቋም ጂኖች እና የተለያዩ ትሮፊክ ግዛቶች ባሉ የከተማ ሀይቆች ውስጥ የመቋቋም አደጋዎች፡ የውስጥ ግንኙነቶች እና ውጫዊ ተጽእኖዎች'፣የአደገኛ እቃዎች እድገቶች ጆርናል9, ገጽ. 100233. doi: 10.1016 / J.HAZADV.2023.100233.
ሱ, ኤም. እና ሌሎች. (2022) 'የሜታጂኖሚክ ትንተና በፈሳሽ-ተያያዥ እና ጠንካራ ተያያዥነት ባላቸው የበግ ሩመን ረቂቅ ተሕዋስያን መካከል ባለው ቅንብር እና ተግባር መካከል ያለውን ልዩነት ገልጧል'፣በማይክሮባዮሎጂ ውስጥ ድንበር, 13, ገጽ. 851567. doi: 10.3389 / FMCB.2022.851567.
ዪን, ጄ እና ሌሎች. (2023) 'ከወፍራም ኒንክሲያንግ አሳማ የተገኘ ማይክሮባዮታ የጡንቻን የሰባ አሲድ ክምችትን በቀጭኑ DLY አሳማዎች ውስጥ እንዲከማች ለማድረግ የካርኒቲን ሜታቦሊዝምን እንደገና ያስተካክላል'ፈጠራው፣ 4(5)፣ ገጽ. 100486. doi: 10.1016 / J.XINN.2023.100486.
Zhao, X. እና ሌሎች. (2023) 'በቻይና ሃይሂ ኢስታሪ በላይኛው እና ታችኛው ጫፍ ላይ ተወካይ ባዮ/የማይበሰብስ ፕላስቲክ እና ፕላስቲክ ያልሆኑ ፍርስራሾች ሊኖሩ ስለሚችሉ አደጋዎች ሜታጂኖሚክ ግንዛቤዎች'የጠቅላላ አካባቢ ሳይንስ, 887, ገጽ. 164026. doi: 10.1016 / J.SCITOTENV.2023.164026.
