page_head_bg

ምርቶች

ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል (NGS)

Metagenome የሚያመለክተው እንደ አካባቢ ሜታጂኖም፣ የሰው ሜታጂኖም፣ ወዘተ ያሉ የተዋሃዱ የኦርጋኒክ ማህበረሰብ አጠቃላይ የዘረመል ቁስ ስብስብ ነው።ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል ከአካባቢያዊ ናሙናዎች የተውጣጡ ድብልቅ ጂኖሚክ ቁሳቁሶችን ለመተንተን የሚያገለግል ሞለኪውላዊ መሳሪያ ነው ፣ ይህም ስለ ዝርያ ልዩነት እና ብዛት ፣ የስነ ሕዝብ አወቃቀር ፣ የፍየልጄኔቲክ ግንኙነት ፣ የተግባር ጂኖች እና ከአካባቢያዊ ሁኔታዎች ጋር ያለውን ትስስር ዝርዝር መረጃ ይሰጣል።

መድረክ፡ኢሉሚና NovaSeq6000


የአገልግሎት ዝርዝሮች

የማሳያ ውጤቶች

የጉዳይ ጥናት

የአገልግሎት ጥቅሞች

Øለማይክሮቢያዊ ማህበረሰቡ መገለጫ ከመገለል እና ከእርሻ-ነጻ

Øበአካባቢያዊ ናሙናዎች ውስጥ ዝቅተኛ የተትረፈረፈ ዝርያዎችን በመለየት ከፍተኛ ጥራት

Øየ "ሜታ-" ሀሳብ ሁሉንም ባዮሎጂያዊ ባህሪያት በተግባራዊ ደረጃ, በዝርያ ደረጃ እና በጂን ደረጃ ያዋህዳል, ይህም ወደ እውነታ ቅርብ የሆነ ተለዋዋጭ እይታን ያሳያል.

ØBMK በተለያዩ የናሙና ዓይነቶች ከ10,000 በላይ ናሙናዎች በማዘጋጀት ሰፊ ልምድ ያከማቻል።

የአገልግሎት ዝርዝሮች

ቅደም ተከተልመድረክ

ቤተ መፃህፍት

የሚመከር የውሂብ ምርት

የሚገመተው የማዞሪያ ጊዜ

ኢሉሚና ኖቫሴክ 6000

ፒኢ250

50ኪ/100ኪ/300ኪ መለያዎች

30 ቀናት

ባዮኢንፎርማቲክስ ትንታኔዎች

üጥሬ የውሂብ ጥራት ቁጥጥር

üMetagenome ስብሰባ

üያልተደጋገመ የጂን ስብስብ እና ማብራሪያ

üየዝርያ ልዩነት ትንተና

üየጄኔቲክ ተግባር ልዩነት ትንተና

üየቡድን ትንተና

üከሙከራ ምክንያቶች አንጻር የማህበሩ ትንተና

2

ናሙና መስፈርቶች እና ማድረስ

የናሙና መስፈርቶች፡-

የዲኤንኤ ውህዶች:

የናሙና ዓይነት

መጠን

ትኩረት መስጠት

ንጽህና

የዲኤንኤ ውህዶች

: 30 ንግ

1 ng/μl

OD260/280= 1.6-2.5

ለአካባቢያዊ ናሙናዎች፡-

የናሙና ዓይነት

የሚመከር የናሙና አሰራር

አፈር

የናሙና መጠን: በግምት.5 ግ;የተረፈውን የደረቀ ንጥረ ነገር ከምድር ላይ ማስወገድ ያስፈልጋል;ትላልቅ ቁርጥራጮችን መፍጨት እና በ 2 ሚሜ ማጣሪያ ውስጥ ማለፍ;ቦታ ለማስያዝ በጸዳ EP-tube ወይም cyrotube ውስጥ ያሉ የ Aliquot ናሙናዎች።

ሰገራ

የናሙና መጠን: በግምት.5 ግ;ለቦታ ማስያዝ በማይጸዳ EP-tube ወይም cryotube ውስጥ ናሙናዎችን ይሰብስቡ እና ይልቀቁ።

የአንጀት ይዘት

ናሙናዎች በ aseptic ሁኔታ ውስጥ መደረግ አለባቸው.የተሰበሰበውን ቲሹ በፒቢኤስ ያጠቡ;ፒቢኤስን ሴንትሪፉግ ያድርጉ እና በ EP-tubes ውስጥ ያለውን ተንሳፋፊ ይሰብስቡ።

ዝቃጭ

የናሙና መጠን: በግምት.5 ግ;የዝቃጭ ናሙናን በ EP-tube ወይም cryotube ውስጥ ለቦታ ማስያዝ ይሰብስቡ እና ይላኩ።

የውሃ አካል

እንደ የቧንቧ ውሃ፣ የጉድጓድ ውሃ፣ ወዘተ የመሳሰሉ ውስን መጠን ያለው ረቂቅ ተሕዋስያን ላለው ናሙና ቢያንስ 1 ሊትር ውሃ ይሰብስቡ እና በ 0.22 μm ማጣሪያ ውስጥ ተህዋሲያንን ለማበልጸግ ይለፉ።ሽፋኑን በማይጸዳ ቱቦ ውስጥ ያከማቹ።

ቆዳ

በጥንቃቄ የቆዳውን ገጽ በማይጸዳ ጥጥ ወይም በቀዶ ጥገና ቧጨረው እና በማይጸዳ ቱቦ ውስጥ ያስቀምጡት።

የሚመከር ናሙና ማድረስ

ናሙናዎቹን በፈሳሽ ናይትሮጅን ውስጥ ለ 3-4 ሰአታት ያቀዘቅዙ እና በፈሳሽ ናይትሮጅን ወይም -80 ዲግሪ ለረጅም ጊዜ ቦታ ያስቀምጡ.ከደረቅ በረዶ ጋር ናሙና መላክ ያስፈልጋል.

የአገልግሎት ሥራ ፍሰት

logo_02

ናሙና መላኪያ

logo_04

የቤተ መፃህፍት ግንባታ

logo_05

ቅደም ተከተል

logo_06

የውሂብ ትንተና

logo_07

ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች


  • ቀዳሚ፡
  • ቀጣይ፡-

  • 1.ሂስቶግራም: ዝርያዎች ስርጭት

    3

    2.Functional ጂኖች ለ KEGG ተፈጭቶ መንገዶች የተገለጹ

    4

    3.የሙቀት ካርታ: በተመጣጣኝ የጂን ብዛት ላይ የተመሰረተ ልዩነት ተግባራት5CARD አንቲባዮቲክ የመቋቋም ጂኖች 4.Circos

    6

    BMK መያዣ

    በአፈር-ማንግሩቭ ሥር ቀጣይነት ላይ የአንቲባዮቲክ መከላከያ ጂኖች እና የባክቴሪያ በሽታ አምጪ ተህዋሲያን መስፋፋት

    የታተመየአደገኛ እቃዎች ጆርናል፣ 2021

    የቅደም ተከተል ስልት፡

    ቁሳቁስ፡- ከማንግሩቭ ሥር ጋር የተያያዙ ናሙናዎች ከአራት ቁርጥራጮች የተውጣጡ፡ ያልተተከለ አፈር፣ ራይዞስፌር፣ ኤፒስፌር እና ኤንዶስፌር ክፍሎች።
    መድረክ፡ ኢሉሚና ሂሴክ 2500
    ዒላማዎች: Metagenome
    16S rRNA ጂን V3-V4 ክልል

    ቁልፍ ውጤቶች

    የሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል እና የሜታባርኮዲንግ ፕሮፋይል በአፈር-ሥር ቀጣይነት የማንግሩቭ ችግኞች ላይ የአንቲባዮቲክ ተከላካይ ጂኖች (ARGs) ከአፈር ወደ ተክሎች መስፋፋትን ለማጥናት ተዘጋጅቷል.የሜታጂኖሚክ መረጃ እንደሚያሳየው 91.4% አንቲባዮቲክ የመቋቋም ጂኖች በተለምዶ ከላይ በተጠቀሱት በአራቱም የአፈር ክፍሎች ውስጥ ተለይተው ይታወቃሉ ይህም ቀጣይነት ያለው ፋሽን አሳይቷል.16S rRNA amplicon sequencing 346 ዝርያዎችን የሚወክል 29,285 ቅደም ተከተሎችን ፈጠረ።በአምፕሊኮን ቅደም ተከተል ከተዘረዘሩት ዝርያዎች ጋር በማጣመር ይህ ስርጭቱ ከስር-ተያያዥ ማይክሮባዮታ ነፃ ሆኖ ተገኝቷል ነገር ግን በጄኔቲክ ንጥረ ነገሮች ተንቀሳቃሽ ስልክ ሊረዳ ይችላል።ይህ ጥናት የ ARGs እና በሽታ አምጪ ተህዋሲያን ከአፈር ወደ ተክሎች የሚፈሱትን እርስ በርስ ተያያዥነት ባለው የአፈር-ሥሩ ቀጣይነት ነው.

    ማጣቀሻ

    ዋንግ፣ ሲ.፣ ሁ፣ አር.፣ ጠንካራ፣ ፒጄ፣ ዙዋንግ፣ ደብሊው፣ እና ሹ፣ ኤል.(2020)በአፈር-ማንግሩቭ ሥር ቀጣይነት ውስጥ የአንቲባዮቲክ ተከላካይ ጂኖች እና የባክቴሪያ በሽታ አምጪ ተህዋሲያን መስፋፋት.አደገኛ እቃዎች ጆርናል, 408፣ 124985 እ.ኤ.አ.

    ጥቅስ ያግኙ

    መልእክትህን እዚህ ጻፍና ላኩልን።

    መልእክትህን ላክልን፡