ሜታጂኖሚክ ሴኩዊንሲንግ -NGS
ሜታጂኖም እንደ የአካባቢ እና የሰው ሜታጂኖም ያሉ የተደባለቀ የህዋሳት ማህበረሰብ አጠቃላይ የጄኔቲክ ቁሳቁስ ስብስብ ነው። ሊበቅሉ የሚችሉ እና ሊታረሱ የማይችሉ ረቂቅ ተሕዋስያን ጂኖሞችን ይዟል። ከኤንጂኤስ ጋር የተኩስ ሽጉጥ ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል እነዚህን ውስብስብ የጂኖሚክ መልክዓ ምድሮች ከታክሶኖሚክ መገለጫ በላይ በማቅረብ በአካባቢ ናሙናዎች ውስጥ የተካተቱትን ጥናት ያስችላል፣ ይህም ስለ ዝርያዎች ልዩነት፣ የብዛት ተለዋዋጭነት እና ውስብስብ የህዝብ አወቃቀሮች ጥልቅ ግንዛቤዎችን ይሰጣል። ከታክሶኖሚክ ጥናቶች በተጨማሪ፣ የሹትቦን ሜታጂኖሚክስ ተግባራዊ የጂኖሚክስ እይታን ይሰጣል፣ ይህም የተመሰጠሩ ጂኖችን እና በሥነ-ምህዳር ሂደቶች ውስጥ ያላቸውን ሚና እንዲመረምር ያስችላል። በመጨረሻም፣ በጄኔቲክ ንጥረ ነገሮች እና በአካባቢያዊ ሁኔታዎች መካከል ያለው የትስስር አውታረ መረቦች መመስረት በማይክሮባላዊ ማህበረሰቦች እና በሥነ-ምህዳር ዳራቸው መካከል ያለውን ውስብስብ መስተጋብር ሁሉን አቀፍ ግንዛቤ ለማግኘት ይረዳል። ለማጠቃለል፣ ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል የተለያዩ የማይክሮባላዊ ማህበረሰቦችን የጂኖሚክ ውስብስብነት ለመፍታት እንደ ወሳኝ መሳሪያ ሆኖ ያገለግላል፣ በእነዚህ ውስብስብ ሥነ-ምህዳሮች ውስጥ በጄኔቲክስ እና በኢኮሎጂ መካከል ያለውን ባለብዙ ገጽታ ግንኙነት ያበራል።
መድረኮች፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ እና DNBSEQ-T7
የአገልግሎት ጥቅሞች
●የማይክሮቢያል ማህበረሰብ መገለጫን ለመለየት የማግለል እና ከእርሻ ነፃ የሆነ ዘዴ፦ ከማይታረሱ ፍጥረታት የጄኔቲክ ቁሶችን ቅደም ተከተል ማስቻል።
●ከፍተኛ ጥራት: በአካባቢ ናሙናዎች ውስጥ ዝቅተኛ መጠን ያላቸውን ዝርያዎች መለየት።
●አጠቃላይ የባዮኢንፎርማቲክስ ትንተና፡በታክሶኖሚክ ልዩነት ላይ ብቻ ሳይሆን በማህበረሰቡ ተግባራዊ ልዩነት ላይም ትኩረት አድርጓል።
●ሰፊ ልምድ፡በተለያዩ የምርምር ዘርፎች በርካታ የሜታጂኖሚክስ ፕሮጀክቶችን በተሳካ ሁኔታ በመዝጋት እና ከ200,000 በላይ ናሙናዎችን በማስኬድ ረገድ ቡድናችን ለእያንዳንዱ ፕሮጀክት ብዙ ልምድ ያመጣል።
የአገልግሎት ዝርዝር መግለጫዎች
| የቅደም ተከተል መድረክ | የቅደም ተከተል ስትራቴጂ | የሚመከር ውሂብ | የጥራት ቁጥጥር |
| ኢሉሚና ኖቫሴክ ወይም DNBSEQ-T7 | PE150 | 6-20Gb | ሩብ 30≥85% |
የአገልግሎት መስፈርቶች
| ማጎሪያ (ng/µL) | ጠቅላላ መጠን (ንግ) | መጠን (µL) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● አፈር/ዝቃጭ፡ 2-3 ግራም
● የአንጀት ይዘት-እንስሳት፡ 0.5-2 ግ
● የአንጀት ይዘት-ነፍሳት፡ 0.1-0.25 ግ
● የእፅዋት ወለል (የበለፀገ ደለል): 0.5-1 ግ
● የማብሰያ ሾርባ የበለፀገ ደለል): 0.2-0.5 ግ
● ሰገራ (ትላልቅ እንስሳት): 0.5-2 ግ
● ሰገራ (አይጥ): 3-5 ጥራጥሬዎች
● የሳንባ አልቪዮላር ላቫጅ ፈሳሽ፡ የማጣሪያ ወረቀት
● የሴት ብልት ማጠፊያ፡ 5-6 ማጠፊያዎች
● የቆዳ/የብልት መወጋት/ምራቅ/የአፍ ለስላሳ ቲሹ/የጉሮሮ መወጋት/የፊንጢጣ መወጋት፡ 2-3 መወጋት
● የገጽታ ማይክሮአኒዝም፡ 5-6 ስዋቦች
● የውሃ አካል/አየር/ባዮፊልም፡ የማጣሪያ ወረቀት
● ኢንዶፊቶች፡ 2-3 ግ
● የጥርስ ንጣፎች፡ 0.5-1ግ
የአገልግሎት የስራ ፍሰት
የናሙና አቅርቦት
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች
የሚከተለውን ትንታኔ ያካትታል፡
● የውሂብ ጥራት ቁጥጥር ቅደም ተከተል
● የሜታጂኖም ስብስብ እና የጂን ትንበያ
● የጂን ማብራሪያ
● የታክሶኖሚክ አልፋ ልዩነት ትንተና
● የማህበረሰቡ ተግባራዊ ትንተና፡ ባዮሎጂካል ተግባር፣ ሜታቦሊክ፣ አንቲባዮቲክ መቋቋም
● በተግባራዊም ሆነ በታክሶኖሚክ ልዩነት ላይ ትንተና፡
የቤታ ልዩነት ትንተና
በቡድን መካከል የሚደረግ ትንተና
የትስስር ትንተና፡ በአካባቢ ሁኔታዎች እና በ OUT ቅንብር እና ልዩነት መካከል
ተግባራዊ ትንተና፡ የካርድ አንቲባዮቲክ መቋቋም
የKEGG ሜታቦሊዝም መንገዶች ልዩነት ትንተና፡- የዋና ዋና መንገዶች የሙቀት ካርታ
የአልፋ የታክሶኖሚክ ስርጭት ልዩነት፡ የACE መረጃ ጠቋሚ
የታክሶኖሚክ ስርጭት ቤታ ልዩነት፡ PCoA
በኢሉሚና አማካኝነት በBMKGene's metagenome sequencing አገልግሎቶች የተመቻቹትን እድገቶች በተዘጋጁ የህትመቶች ስብስብ ያስሱ።
ሃይ፣ ኪ. እና ሌሎች (2023) 'በተለያየ የውሃ ሙቀት በተላላፊ ሄማቶፖይቲክ ኒክሮሲስ ቫይረስ በተያዘው ቀስተ ደመና ትራውት (ኦንኮርሂንቹስ ማይኪስ) የአንጀት ይዘት ላይ የተደረጉ ለውጦችን ሜታጂኖሚክ እና ሜታቦሎሚክ ትንተና'፣በማይክሮባዮሎጂ ውስጥ ያሉ ድንበሮች, 14, ገጽ 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
ማኦ፣ ሲ. እና ሌሎች (2023) 'በተለያዩ የትሮፒካል ሁኔታዎች ውስጥ በሚገኙ የከተማ ሐይቆች ውስጥ የማይክሮባላዊ ማህበረሰቦች፣ የመቋቋም ጂኖች እና የመቋቋም አደጋዎች፡ ውስጣዊ አገናኞች እና ውጫዊ ተጽዕኖዎች'፣የአደገኛ ቁሳቁሶች እድገቶች ጆርናል9, ገጽ. 100233. doi: 10.1016 / J.HAZADV.2023.100233.
ሱ፣ ኤም. እና ሌሎች (2022) 'ሜታጂኖሚክ ትንተና በበግ ሩመን ፈሳሽ-ተዛማጅ እና ጠንካራ-ተዛማጅ ረቂቅ ተሕዋስያን መካከል ባለው ቅንብር እና ተግባር መካከል ያለውን ልዩነት አሳይቷል'፣በማይክሮባዮሎጂ ውስጥ ያሉ ድንበሮች, 13, ገጽ 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.
ዪን፣ ጄ. እና ሌሎች (2023) 'ከመጠን በላይ ወፍራም የሆነው ኒንግዚያንግ ከአሳማ የተገኘ ማይክሮባዮታ በቀጭን የዲኤልአይ አሳማዎች ውስጥ የጡንቻ ፋቲ አሲድ ክምችትን ለማሳደግ የካርኒቲን ሜታቦሊዝምን እንደገና ያገናኛል'፣ፈጠራው፣ 4(5)፣ ገጽ. 100486. doi: 10.1016 / J.XINN.2023.100486.
ዣኦ፣ ኤክስ. እና ሌሎች (2023) 'በቻይና የላይኛው እና የታችኛው የሃይ ኢስትዩዋሪ ውስጥ የሚገኙ ተወካይ ባዮ/የማይፈርስ ፕላስቲክ እና ፕላስቲክ ያልሆኑ ፍርስራሾች ሊያስከትሉ ስለሚችሉ አደጋዎች ሜታጀኖሚክ ግንዛቤዎች'የጠቅላላ አካባቢ ሳይንስ, 887, ገጽ. 164026. doi: 10.1016 / J.SCITOTENV.2023.164026.
