条形 Banner-03

Produkti

Metagenomiskā secība -NGS

图片 62

Metagenoms ir jauktas organismu kopienas, piemēram, vides un cilvēku metagenomu kopienas, kopējā ģenētiskā materiāla kolekcija. Tas satur gan kultivējamu, gan negribīgu mikroorganismu genomus. Bise metagenomiskā secība ar NGS ļauj izpētīt šīs sarežģītās genomiskās ainavas, kas iestrādātas vides paraugos, nodrošinot vairāk nekā taksonomijas profilēšanu, sniedzot arī sīku ieskatu sugu daudzveidībā, pārpilnības dinamikā un sarežģītās populācijas struktūrās. Papildus taksonomiskajiem pētījumiem, bise metagenomika piedāvā arī funkcionālu genomikas perspektīvu, ļaujot izpētīt kodētus gēnus un to domājamo lomu ekoloģiskos procesos. Visbeidzot, korelācijas tīklu izveidošana starp ģenētiskajiem elementiem un vides faktoriem veicina holistisku izpratni par sarežģīto mijiedarbību starp mikrobu kopienām un to ekoloģisko fonu. Noslēgumā jāsaka, ka metagenomiskā secība ir galvenā instrumenta dažādu mikrobu kopienu genoma sarežģītības atšķetināšanai, apgaismojot daudzšķautņainās attiecības starp ģenētiku un ekoloģiju šajās sarežģītajās ekosistēmās.

Platformas: Illumina Novaseq un DNBSEQ-T7


Sīkāka informācija par pakalpojumu

Bioinformātika

Demonstrācijas rezultāti

Piedāvātās publikācijas

Pakalpojumu priekšrocības

Izolēšana un bez kultivēšanas metode mikrobu kopienas profilēšanai: Ģenētiskā materiāla sekvencēšanas iespējošana no nekulturējamiem organismiem.

Augsta izšķirtspēja: Vides paraugos noteikt zemas samazināšanas sugas.

Visaptveroša bioinformātikas analīze:Koncentrējās ne tikai uz taksonomisko daudzveidību, bet arī uz sabiedrības funkcionālo daudzveidību.

Plaša pieredze:Ar panākumiem veiksmīgi slēgt vairākus metagenomikas projektus dažādās pētniecības jomās un apstrādājot vairāk nekā 200 000 paraugu, mūsu komanda katram projektam sniedz lielu pieredzi.

Pakalpojumu specifikācijas

Sekvencēšanas platforma

Sekvencēšanas stratēģija

Ieteicamie dati

Kvalitātes kontrole

Illumina Novaseq vai DNBSEQ-T7

PE150

6-20 GB

Q30≥85%

Pakalpojuma prasības

Koncentrācija (ng/µl)

Kopējā summa (ng)

Tilpums (µL)

≥1

≥30

≥20

● Augsne/dūņas: 2-3g
● zarnu saturs-dzīvnieks: 0,5-2g
● Zarnu saturs-insects: 0,1-0,25G
● Augu virsma (bagātināti nogulumi): 0,5-1g
● Fermentācijas buljona bagātināti nogulumi): 0,2-0,5 g
● Fekālijas (lieli dzīvnieki): 0,5-2g
● Fekālijas (pele): 3-5grain
● Plaušu alveolu skalošanas šķidrums: filtrpapīrs
● Vaginālais tampons: 5-6 tamponi
● Ādas/dzimumorgānu tampons/siekalas/perorālie mīkstie audi/faringeālā tampons/taisnās zarnas tampons: 2-3 tamponi
● Virsmas mikroorganisms: 5-6 tamponi
● Waterbody/Gaisa/bioplēvi: filtrpapīrs
● Endofīti: 2-3g
● Zobu aplikācija: 0,5-1g

Servisa darba plūsma

Paraugu piegāde

Paraugu piegāde

Bibliotēkas sagatavošana

Bibliotēkas celtniecība

Sekvencēšana

Sekvencēšana

Datu analīze

Datu analīze

Pēc pārdošanas pakalpojumiem

Pēcpārdošanas pakalpojumi


  • Iepriekšējais:
  • Nākamais:

  • 流程图 贝贝第三版 -01

    Ietver šādu analīzi:

    ● Datu kvalitātes kontroles secība

    ● Metagenoma montāža un gēnu prognozēšana

    ● Gēnu anotācija

    ● Taksonomiskās alfa daudzveidības analīze

    ● Sabiedrības funkcionālā analīze: bioloģiskā funkcija, metabolisma, antibiotiku rezistence

    ● Analīze gan par funkcionālo, gan taksonomisko daudzveidību:

    Beta daudzveidības analīze

    Starp grupu analīze

    Korelācijas analīze: starp vides faktoriem un sastāvu un daudzveidību

    Funkcionālā analīze: karšu antibiotiku rezistence

    图片 63

    KEGG metabolisma ceļu diferenciālā analīze: nozīmīgu ceļu siltuma karte

     

    图片 64

     Alfa taksonomijas sadalījuma daudzveidība: ACE indekss

    图片 65

     

    Taksonomijas sadalījuma beta daudzveidība: PCOA

    图片 66

    Izpētiet sasniegumus, ko veicina Bmkgene metagenomu secības pakalpojumi ar Illumina, izmantojot izstrādātu publikāciju kolekciju.

    Hai, Q. et al. (2023) “Varavīksnes foreļu zarnu satura izmaiņu metagenomiskā un metabolisma analīze (Oncorhynchus mykiss), kas inficēti ar infekcijas hematopoētiskās nekrozes vīrusu dažādās kultūras ūdens temperatūrās”,Robežas mikrobioloģijā, 14, lpp. 1275649. Doi: 10.3389/fmicb.2023.1275649.

    Mao, C. et al. (2023) “Mikrobu kopienas, rezistences gēni un pretestības riski dažādu trofisko stāvokļu pilsētu ezeros: iekšējās saites un ārējās ietekmes”,Bīstamo materiālu avansa žurnāls, 9, lpp. 100233. Doi: 10.1016/j.hazadv.2023.100233.

    Su, M. et al. (2022) “Metagenomiskā analīze atklāja atšķirības kompozīcijā un funkcijā starp ar šķidrumu saistītajiem un cietajiem saistītajiem aitu spurekļa mikroorganismiem”,Robežas mikrobioloģijā, 13, lpp. 851567. Doi: 10.3389/fmicb.2022.851567.

    Yin, J. et al. (2023) “Aptaukojušās Ningxiang no cūkas iegūtā mikrobiota pārņem karnitīna metabolismu, lai veicinātu muskuļu taukskābju nogulsnēšanos liesās dly cūkās”,Inovācijas, 4 (5), lpp. 100486. Doi: 10.1016/j.xinn.2023.100486.

    Zhao, X. et al. (2023) “Metagenomiska ieskats reprezentatīvo bio/nesadalāmo plastmasas un plastisko gružu iespējamos riskos Haihe estuāra augšējā un apakšējā daļā”, Ķīnā ”,Zinātne par kopējo vidi, 887, lpp. 164026. Doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.164026.

    Iegūstiet cenu

    Uzrakstiet savu ziņojumu šeit un nosūtiet to mums

    Nosūtiet mums savu ziņojumu: