Värmekarta
Matrisdatafil används för ritning av värmekartor, som kan filtrera, normalisera och klustra matrisdata.Det används mest för klusteranalys av genuttrycksnivå mellan olika prover.
Genanteckning
Genfunktionsanteckning utförs genom att kartlägga sekvenser i FASTA-fil mot olika databaser.
Genanteckning
Grundläggande sökverktyg för lokal anpassning
CDS_UTR_Prediction
Detta verktyg är utformat för att förutsäga kodande regioner (CDS) och icke-kodande regioner (UTR) i givna transkriptsekvenser baserat på sprängning mot känd proteindatabas och ORF-prediktion.
Manhattan Plot
Manhattan plot möjliggör visning av data med ett stort antal datapunkter.Det används ofta i genomomfattande associationsstudier (GWAS).
Circos
CIRCOS-diagram möjliggör direkt presentation av SNP, InDeL, SV, CNV-distributioner på genomet.
GO_Anrikning
TopGO är ett verktyg designat för funktionell berikning.TopGO-Bioconductor-paketet består av differentiell uttrycksanalys, GO-anrikningsanalys och visualisering av resultaten.Det kommer att generera en mapp med utdata som heter "Graph", som innehåller resultat för topGO_BP, topGO_CC och topGO_MF.
WGCNA
WGCNA är en allmänt använd metod för datautvinning för att upptäcka gensamuttrycksmoduler.Den är tillämpbar på olika uttrycksdatauppsättningar inklusive mikroarraydata och genuttrycksdata som härrör från nästa generations sekvensering.
InterProScan
InterPro proteinsekvensanalys och klassificering
GO_KEGG_Anrikning
Detta verktyg är designat för att generera GO-anrikningshistogram, KEGG-anrikningshistogram och KEGG-anrikningsväg baserat på tillhandahållen genuppsättning och motsvarande anteckning.