● RRNA -utarmning följt av riktningsförberedelse av mRNA -bibliotek.
● Sekvensering på Illumina Novaseq.
●Studera förändringarna av komplexa mikrobiella samhällen:Detta händer på transkriptionell nivå och utforska potentiella nya gener.
●Förklara mikrobiella samhällsinteraktioner med värden eller miljön.
●Omfattande bioinformatisk analys: Detta ger insikter om gemenskapens taxonomiska och funktionella kompositioner samt differentiell genuttrycksanalys.
●Omfattande gennotation:Använda uppdaterade genfunktionsdatabaser för informativ genuttrycksinformation för mikrobiella samhällen.
●Support efter försäljning:Vårt åtagande sträcker sig utöver projektets slutförande med en 3-månaders serviceperiod efter försäljning. Under denna tid erbjuder vi projektuppföljning, felsökningsassistans och Q & A-sessioner för att hantera eventuella frågor relaterade till resultaten.
Sekvenseringsplattform | Sekvenseringsstrategi | Data rekommenderas | Datakvalitetskontroll |
Illumina Novaseq | PE150 | 12 GB | Q30≥85% |
Koncentration (ng/ul) | Totalt belopp (μg) | Volym (ul) | OD260/280 | OD260/230 | Rin |
≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1.0-2.5 | ≥6,5 |
Inkluderar följande analys:
● Sekvensering av datakvalitetskontroll
● Transkriptionsenhet
● Taxonomisk kommentar och överflöd
● Funktionell kommentar och överflöd
● Uttryckskvantifiering och differentiell analys
Taxonomisk distribution av varje prov:
Beta mångfaldsanalys: UPGMA
Funktionell kommentar - gå överflöd
Differential Taxonomy Abundance - Lefse
Utforska de framsteg som underlättas av BMKGenes metatranskriptomiksekvenseringstjänster genom en kuraterad samling publikationer.
Lu, Z. et al. (2023) 'Syra tolerans för laktatutnyttjande bakterier i ordningen Bakteroidales bidrar till förebyggande av ruminal acidos hos getter anpassade till en högkoncentratdiet',Djurnäring, 14, s. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) 'Upplösande kärnfunktionell mikrobiota i traditionell fermentering av fast tillstånd av amplikoner med hög kapacitet och metatranscriptomics-sekvensering',Gränser i mikrobiologi, 8 (jul). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/full.
Wang, W. et al. (2022) 'Nya mykovirus upptäckt från en metatranscriptomics -undersökning av den fytopatogena Alternaria -svampen',Virus, 14 (11), sid. 2552. DOI: 10.3390/v14112552/s1.
Wei, J. et al. (2022) "Parallell metatranscriptomanalys avslöjar nedbrytning av växtens sekundära metaboliter av skalbaggar och deras tarmsymbionter",Molekyl Ekologi, 31 (15), s. 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.