BMKCLOUD Logg inn

Fleksible analyseapper

WPS_DOC_5

Eukaryotisk mRNA -analyse (referansebaserte og de novo -alternativer tilgjengelig)

Denne rørledningen bruker NGS RNA-Seq-data som input og gir resultater fra flere nedstrømsanalyser inkludert, men ikke begrenset til: Sekvensering av datakvalitetsvurdering,de novoTranskripsjonssted -merknad, variabel skjøteanalyse, differensiell ekspresjonsanalyse, funksjons merknad og berikelsesanalyse.

Lang ikke-kodende RNA-analyse

Lange ikke-kodende RNA (lncRNA) er ikke-kodende transkripsjoner med lengder lengre enn 200 NT og er kjent for å spille roller i kromatinorganisasjon og regulering. Sekvenseringsteknologier med høy gjennomstrømning og bioinformatisk har styrket vår forståelse LNCRNA-sekvenser og posisjonering av informasjon for å identifisere LNCRNA med viktige reguleringsfunksjoner. Denne rørledningen gir lncRNA -analyse i tillegg til analyser som er nevnt i den eukaryote mRNA -analyselinjen.

 

WPS_DOC_6
WPS_DOC_7

16S/18S/Amplicon -sekvensering

Pipeline for amplikon -sekvensering av mikrobiell mangfoldsanalyse ble utviklet basert på mange års erfaring i prosjektanalyse av mikrobielt mangfold. Rørledningen inneholder standardisert grunnleggende analyse, som dekker mainstream -analyseinnholdet i nåværende mikrobiell forskning og personlig analyse. Analyserapporten er rik og omfattende, med muligheten til å utføre mangfoldig personlig analyse. I tillegg kan prøver og grupper modifiseres på farten for ytterligere tilpasning og kontroll.

Haglur metagenomikkanalyse

Hagelgeværmetagenomisk analyse Pipeline bruker NGS -data fra blandede genomiske materialer hentet fra miljøprøver. Inkluderte analyser gir detaljert informasjon om artsmangfold og overflod, populasjonsstruktur, fylogenetisk forhold, funksjonelle gener og korrelasjonsnettverk med miljøfaktorer.

WPS_DOC_8
WPS_DOC_9

NGS-WGS variantanalyse

NGS-WGS-variantanalysen er en integrert variantdeteksjonsrørledning som utfører datakvalitetskontroll, sekvensjustering, merknad og genmutasjonsanalyse. Rørledningen følger GATK beste praksis for SNP og indeledeteksjon og bruker manta for strukturell variantanrop.

Genome Wide Association Study (GWAS)

GWAS -rørledningen er en nedstrømsanalyse som tar tidligere genererte VCF -filer og tilsvarende fenotypedata for en kohort av individer som input. Ved å bruke spesifikke statistiske metodologier, har GWAS som mål å avdekke genomomfattende nukleotidvariasjoner korrelert med fenotypiske forskjeller. Det spiller en avgjørende rolle i å utforske funksjonelle gener assosiert med komplekse menneskelige sykdommer og intrikate egenskaper i planter og dyr.

WPS_DOC_10
WPS_DOC_11

Bulk segregeringsanalyse (BSA)

BSA -analyse innebærer å samle individer med ekstreme fenotypiske egenskaper fra en segregerende befolkning. Ved å sammenligne differensialloki mellom de samlede prøvene, identifiserer denne tilnærmingen raskt nøye koblede molekylære markører assosiert med målgener. Det er mye brukt i genetisk kartlegging av planter og dyr, det er et verdifullt verktøy for markørassistert avl.

Evolusjonær genetikkanalyse

Den evolusjonære genetiske analysen arbeidsflyt utnytter Bmkgens omfattende erfaring med genetiske evolusjonsprosjekter og inkluderer fylogenetisk trekonstruksjon, koblingsanvisningsanalyse, vurdering av genetisk mangfold, selektiv sveipidentifikasjon, slektskapsanalyse, hovedkomponentanalyse og populasjonsstrukturkarakterisering.

WPS_DOC_12

Få et tilbud

Skriv meldingen din her og send den til oss

Send meldingen din til oss: