Kev Tshuaj Xyuas Eukaryotic mRNA (raws li kev siv thiab muaj cov kev xaiv tshiab)
Cov kav dej no siv cov ntaub ntawv NGS RNA-Seq ua cov tswv yim thiab tsim cov txiaj ntsig los ntawm ntau qhov kev tshuaj xyuas downstream suav nrog tab sis tsis txwv rau: kev ntsuam xyuas cov ntaub ntawv zoo ntawm sequencing,de novokev piav qhia txog qhov chaw sau ntawv, kev tshuaj xyuas qhov sib txuas sib txawv, kev tshuaj xyuas kev qhia tawm sib txawv, kev piav qhia txog kev ua haujlwm thiab kev tshuaj xyuas kev txhim kho.
Kev Tshawb Fawb RNA Ntev uas tsis yog coding
Cov RNA ntev uas tsis yog coding (lncRNA) yog cov ntawv sau tsis yog coding nrog qhov ntev ntev dua 200 nt thiab paub tias ua lub luag haujlwm hauv kev teeb tsa chromatin thiab kev tswj hwm. Cov thev naus laus zis high-throughput sequencing thiab bioinformatic tau txhawb nqa peb txoj kev nkag siab txog lncRNA sequences thiab cov ntaub ntawv qhov chaw los txheeb xyuas lncRNAs nrog cov haujlwm tswj hwm tseem ceeb. Cov kav dej no muab kev tshuaj xyuas lncRNA ntxiv rau kev tshuaj xyuas uas tau hais hauv Eukaryotic mRNA Analysis pipeline.
Kev txheeb xyuas 16S/18S/ITS amplicon
Cov kav dej tshuaj xyuas ntau yam kab mob Amplicon Sequencing tau tsim los ntawm ntau xyoo ntawm kev paub dhau los hauv kev tshuaj xyuas qhov project ntau yam kab mob. Cov kav dej muaj cov qauv tshuaj xyuas yooj yim, uas suav nrog cov ntsiab lus tshuaj xyuas tseem ceeb ntawm kev tshawb fawb txog kab mob tam sim no thiab kev tshuaj xyuas tus kheej. Daim ntawv qhia kev tshuaj xyuas muaj ntau yam thiab ua tiav, nrog rau kev xaiv los ua ntau yam kev tshuaj xyuas tus kheej. Tsis tas li ntawd, cov qauv thiab cov pab pawg tuaj yeem hloov kho tau sai rau kev hloov kho thiab tswj hwm ntxiv.
Kev Tshuaj Xyuas Metagenomics ntawm Shotgun
Cov txheej txheem Shotgun Metagenomic Analysis siv cov ntaub ntawv NGS los ntawm cov khoom sib xyaw genomic uas tau rho tawm los ntawm cov qauv ib puag ncig. Cov kev tshuaj xyuas suav nrog muab cov ntaub ntawv qhia txog ntau haiv neeg thiab kev muaj ntau yam, cov qauv pej xeem, kev sib raug zoo ntawm phylogenetic, cov noob caj noob ces ua haujlwm, thiab kev sib raug zoo nrog cov yam ntxwv ib puag ncig.
Kev Tshawb Fawb Txog Kev Hloov Pauv ntawm NGS-WGS
Kev Tshawb Fawb Txog Qhov Txawv Txawv ntawm NGS-WGS yog ib txoj kev tshawb nrhiav cov kab sib txawv uas ua tiav kev tswj xyuas cov ntaub ntawv zoo, kev sib phim ua ntu zus, kev sau ntawv, thiab kev tshawb xyuas kev hloov pauv ntawm cov noob caj noob ces. Txoj kev tshawb nrhiav no ua raws li GATK cov kev coj ua zoo tshaj plaws rau kev tshawb nrhiav SNP thiab InDel thiab siv Manta rau kev hu cov qauv sib txawv.
Kev Tshawb Fawb Txog Kev Sib Koom Tes Thoob Plaws Genome (GWAS)
Lub GWAS pipeline yog ib qho kev tshuaj xyuas downstream uas siv cov ntaub ntawv VCF uas tau tsim ua ntej thiab cov ntaub ntawv phenotype sib xws rau ib pawg neeg ua cov tswv yim. Siv cov txheej txheem txheeb cais tshwj xeeb, GWAS lub hom phiaj yog los tshawb pom cov kev hloov pauv nucleotide thoob plaws genome uas cuam tshuam nrog cov kev sib txawv phenotypic. Nws ua lub luag haujlwm tseem ceeb hauv kev tshawb nrhiav cov noob caj noob ces ua haujlwm uas cuam tshuam nrog cov kab mob nyuaj ntawm tib neeg thiab cov yam ntxwv nyuaj hauv cov nroj tsuag thiab tsiaj txhu.
Kev Tshawb Fawb Txog Kev Sib Cais Ua Ntau Yam (BSA)
Kev tshuaj xyuas BSA suav nrog kev sib sau ua ke cov tib neeg uas muaj cov yam ntxwv phenotypic hnyav los ntawm cov pej xeem sib cais. Los ntawm kev sib piv cov chaw sib txawv ntawm cov qauv sib sau ua ke, txoj hauv kev no txheeb xyuas cov cim molecular txuas nrog cov noob caj noob ces. Siv dav hauv kev kos duab caj ces ntawm cov nroj tsuag thiab tsiaj txhu, nws yog ib qho cuab yeej muaj txiaj ntsig zoo rau kev yug me nyuam uas tau pab los ntawm cov cim.
Kev Tshawb Fawb Txog Genes ntawm Kev Hloov Pauv
Cov txheej txheem kev tshuaj xyuas noob caj noob ces ntawm Evolutionary Genetics siv BMKGENE txoj kev paub dhau los hauv cov haujlwm kev hloov pauv noob caj noob ces thiab suav nrog kev tsim tsob ntoo phylogenetic, kev tshuaj xyuas kev sib txuas tsis sib npaug, kev ntsuam xyuas ntau haiv neeg, kev txheeb xyuas kev xaiv, kev tshuaj xyuas kev sib raug zoo, kev tshuaj xyuas cov khoom tseem ceeb, thiab kev piav qhia txog cov qauv ntawm cov pej xeem.
