Analisis mRNA eukariotik (Opsi adhedhasar referensi lan de novo kasedhiya)
Pipa iki nggunakake data NGS RNA-Seq minangka input lan ngasilake asil saka pirang-pirang analisis hilir kalebu nanging ora winates ing: penilaian kualitas data sekuensing,anyaranotasi situs transkripsi, analisis penyambungan variabel, analisis ekspresi diferensial, anotasi fungsi, lan analisis pengayaan.
Analisis RNA non-koding dawa
RNA non-coding dawa (lncRNA) iku transkrip non-coding kanthi dawa luwih saka 200 nt lan dikenal nduweni peran ing organisasi lan regulasi kromatin. Teknologi sekuensing throughput dhuwur lan bioinformatika wis nguatake pangerten kita babagan sekuens lncRNA lan informasi posisi kanggo ngenali lncRNA kanthi fungsi regulasi sing penting. Pipa iki nyedhiyakake analisis lncRNA saliyane analisis sing kasebut ing pipa Analisis mRNA Eukariotik.
Urutan amplikon 16S/18S/ITS
Pipa analisis keragaman mikroba Amplicon Sequencing dikembangake adhedhasar pengalaman pirang-pirang taun ing analisis proyek keragaman mikroba. Pipa iki ngemot analisis dhasar standar, sing nyakup isi analisis utama saka riset mikroba saiki lan analisis sing dipersonalisasi. Laporan analisis iki sugih lan lengkap, kanthi pilihan kanggo nindakake analisis pribadi sing maneka warna. Kajaba iku, sampel lan klompok bisa diowahi kanthi cepet kanggo kustomisasi lan kontrol tambahan.
Analisis Metagenomik Senapan
Pipa Analisis Metagenomik Shotgun nggunakake data NGS saka bahan genomik campuran sing diekstrak saka sampel lingkungan. Analisis sing kalebu nyedhiyakake informasi rinci babagan keragaman lan kelimpahan spesies, struktur populasi, hubungan filogenetik, gen fungsional, lan jaringan korelasi karo faktor lingkungan.
Analisis Varian NGS-WGS
Analisis Varian NGS-WGS minangka pipa deteksi varian terintegrasi sing nindakake kontrol kualitas data, penyelarasan urutan, anotasi, lan analisis mutasi gen. Pipa iki ngetutake praktik paling apik GATK kanggo deteksi SNP lan InDel lan nggunakake Manta kanggo pemanggilan varian struktural.
Studi Asosiasi Genom (GWAS)
Pipa GWAS minangka analisis hilir sing njupuk file VCF sing wis digawe sadurunge lan data fenotipe sing cocog kanggo kohort individu minangka input. Nggunakake metodologi statistik tartamtu, GWAS ngarahake kanggo nemokake variasi nukleotida ing saindenging genom sing ana gandhengane karo beda fenotipik. Iki nduweni peran penting kanggo njelajah gen fungsional sing ana gandhengane karo penyakit manungsa sing kompleks lan sipat rumit ing tanduran lan kewan.
Analisis Segregasi Massal (BSA)
Analisis BSA nglibatake pangumpulan individu kanthi sipat fenotipik ekstrem saka populasi sing misah. Kanthi mbandhingake lokus diferensial antarane sampel sing dikumpulake, pendekatan iki kanthi cepet ngenali penanda molekuler sing ana gandhengane karo gen target. Digunakake sacara wiyar ing pemetaan genetik tanduran lan kewan, iki minangka alat sing penting kanggo pemuliaan sing dibantu penanda.
Analisis Genetika Evolusi
Alur kerja Analisis Genetika Evolusi nggunakake pengalaman ekstensif BMKGENE ing proyèk évolusi genetik lan kalebu konstruksi wit filogenetik, analisis ketidakseimbangan keterkaitan, penilaian keragaman genetik, identifikasi sapuan selektif, analisis kekerabatan, analisis komponen utama, lan karakterisasi struktur populasi.
