Analisis mRNA Eukariotik (Pilihan dumasar rujukan sareng de novo sayogi)
Pipa ieu nganggo data NGS RNA-Seq salaku input sareng ngahasilkeun hasil tina sababaraha analisis hilir kalebet tapi henteu diwatesan ku: penilaian kualitas data sekuensing,anyaranotasi situs transkripsi, analisis panyambungan variabel, analisis éksprési diferensial, anotasi fungsi sareng analisis pangayaan.
Analisis RNA non-coding anu panjang
RNA non-coding anu panjang (lncRNA) nyaéta transkrip non-coding kalayan panjang langkung ti 200 nt sareng dipikanyaho maénkeun peran dina organisasi sareng pangaturan kromatin. Téhnologi sekuensing throughput anu luhur sareng bioinformatika parantos nguatkeun pamahaman urang ngeunaan sekuen lncRNA sareng inpormasi posisi pikeun ngaidentipikasi lncRNA kalayan fungsi pangaturan anu penting. Pipa ieu nyayogikeun analisis lncRNA salian ti analisis anu disebatkeun dina pipa Analisis mRNA Eukariotik.
Sekuensing amplikon 16S/18S/ITS
Pipa analisis karagaman mikroba Amplicon Sequencing dikembangkeun dumasar kana pangalaman mangtaun-taun dina analisis proyék karagaman mikroba. Pipa ieu ngandung analisis dasar standar, anu ngawengku eusi analisis utama tina panalungtikan mikroba ayeuna sareng analisis anu dipersonalisasi. Laporan analisisna beunghar sareng komprehensif, kalayan pilihan pikeun ngalaksanakeun analisis pribadi anu beragam. Salaku tambahan, sampel sareng grup tiasa dirobih sacara instan pikeun kustomisasi sareng kontrol tambahan.
Analisis Metagenomik Senapan
Pipa Analisis Shotgun Metagenomic ngagunakeun data NGS tina bahan genomik campuran anu diekstrak tina sampel lingkungan. Analisis anu kalebet nyayogikeun inpormasi lengkep ngeunaan karagaman sareng kaayaan spésiés, struktur populasi, hubungan filogenetik, gén fungsional, sareng jaringan korélasi sareng faktor lingkungan.
Analisis Varian NGS-WGS
Analisis Varian NGS-WGS nyaéta pipa deteksi varian terpadu anu ngalaksanakeun kontrol kualitas data, panyelarasan runtuyan, anotasi, sareng analisis mutasi gén. Pipa ieu nuturkeun prakték pangsaéna GATK pikeun deteksi SNP sareng InDel sareng nganggo Manta pikeun panggero varian struktural.
Ulikan Asosiasi Sakumna Génom (GWAS)
Pipa GWAS mangrupikeun analisis hilir anu nyandak file VCF anu dihasilkeun sateuacanna sareng data fenotipe anu saluyu pikeun kohort individu salaku input. Ngagunakeun metodologi statistik khusus, GWAS ngagaduhan tujuan pikeun ngungkabkeun variasi nukléotida sakumna génom anu aya hubunganana sareng béda fenotipe. Éta maénkeun peran penting dina ngajalajah gén fungsional anu aya hubunganana sareng panyakit manusa anu rumit sareng sipat anu rumit dina pepelakan sareng sato.
Analisis Segregasi Massal (BSA)
Analisis BSA ngalibatkeun ngahijikeun individu-individu anu gaduh sipat fenotipik ekstrim tina populasi anu misah. Ku cara ngabandingkeun lokus diferensial antara sampel anu dikumpulkeun, pendekatan ieu gancang ngaidentipikasi spidol molekuler anu raket patalina sareng gén target. Seueur dianggo dina pemetaan genetik pepelakan sareng sasatoan, éta mangrupikeun alat anu berharga pikeun beternak anu dibantuan ku spidol.
Analisis Genetika Évolusionér
Alur kerja Analisis Genetika Évolusi ngamangpaatkeun pangalaman BMKGENE anu lega dina proyék évolusi genetik sareng kalebet konstruksi tangkal filogenetik, analisis disekuilibrium linkage, penilaian karagaman genetik, idéntifikasi sapuan selektif, analisis kekerabatan, analisis komponén utama, sareng karakterisasi struktur populasi.
