lncrna

RNA không mã hóa dài (lncRNA) là các RNA dài hơn 200 nucleotide, có khả năng mã hóa thấp nhưng lại có chức năng điều hòa quan trọng. Quy trình BMKCloud lncRNA được thiết kế để phân tích các thư viện đã loại bỏ rRNA với bộ gen tham chiếu chất lượng cao, được chú thích đầy đủ, bằng cách phân tích biểu hiện lncRNA và mRNA cùng nhau. Sau khi cắt tỉa và kiểm soát chất lượng, các đoạn đọc được căn chỉnh với bộ gen tham chiếu để lắp ráp các bản phiên mã, và phân tích cấu trúc gen tiếp theo sẽ tiết lộ sự ghép nối thay thế và các gen mới. Các bản phiên mã được xác định là mRNA hoặc lncRNA, và phân tích biểu hiện khác biệt xác định các lncRNA biểu hiện khác biệt, các mục tiêu của chúng và các gen biểu hiện khác biệt (DEG). Cả DEG và các mục tiêu lncRNA biểu hiện khác biệt đều được chú thích chức năng để tìm ra các danh mục chức năng được làm giàu.