Análise de ARNm eucariota (dispoñibles opcións baseadas en referencia e de novo)
Esta canle usa datos de secuenciación de ARN de NGS como entrada e produce resultados de múltiples análises posteriores, incluíndo, entre outras: avaliación da calidade dos datos de secuenciación,de novoanotación de sitios de transcrición, análise de empalme variable, análise de expresión diferencial, anotación de funcións e análise de enriquecemento.
Análise de ARN longo non codificante
Os ARN longos non codificantes (ARNlnc) son transcritos non codificantes con lonxitudes superiores a 200 nt e que se sabe que desempeñan funcións na organización e regulación da cromatina. As tecnoloxías de secuenciación de alto rendemento e a bioinformática melloraron a nosa comprensión das secuencias de ARNlnc e a información de posicionamento para identificar ARNlnc con funcións reguladoras cruciais. Esta canle proporciona análise de ARNlnc ademais das análises mencionadas na canle de análise de ARNm eucariota.
Secuenciación de amplicóns 16S/18S/ITS
A canle de análise de diversidade microbiana de Amplicon Sequencing desenvolveuse baseándose en anos de experiencia na análise de proxectos de diversidade microbiana. A canle contén análises básicas estandarizadas, que abarcan o contido de análise principal da investigación microbiana actual e a análise personalizada. O informe de análise é rico e completo, coa opción de realizar análises persoais diversas. Ademais, as mostras e os grupos pódense modificar sobre a marcha para unha maior personalización e control.
Análise metaxenómica de escopeta
A canle de análise metaxenómica Shotgun emprega datos de NGS de materiais xenómicos mixtos extraídos de mostras ambientais. As análises incluídas proporcionan información detallada sobre a diversidade e abundancia de especies, a estrutura da poboación, a relación filoxenética, os xenes funcionais e as redes de correlación con factores ambientais.
Análise de variantes NGS-WGS
A análise de variantes NGS-WGS é unha canle integrada de detección de variantes que realiza control de calidade de datos, aliñamento de secuencias, anotación e análise de mutacións xénicas. A canle segue as mellores prácticas de GATK para a detección de SNP e InDel e usa Manta para a chamada de variantes estruturais.
Estudo de Asociación de Xenoma Completo (GWAS)
A canle GWAS é unha análise posterior que toma como entrada ficheiros VCF xerados previamente e os datos de fenotipo correspondentes para unha cohorte de individuos. Usando metodoloxías estatísticas específicas, GWAS ten como obxectivo descubrir variacións de nucleótidos a nivel xenómico correlacionadas con diferenzas fenotípicas. Xoga un papel crucial na exploración de xenes funcionais asociados con enfermidades humanas complexas e trazos intrincados en plantas e animais.
Análise de segregación masiva (BSA)
A análise de BSA implica agrupar individuos con trazos fenotípicos extremos dunha poboación segregada. Ao comparar loci diferenciais entre as mostras agrupadas, esta estratexia identifica rapidamente marcadores moleculares estreitamente ligados asociados cos xenes diana. Amplamente empregada na cartografía xenética de plantas e animais, é unha ferramenta valiosa para a mellora asistida por marcadores.
Análise xenética evolutiva
O fluxo de traballo de Análise Xenética Evolutiva aproveita a ampla experiencia de BMKGENE en proxectos de evolución xenética e inclúe a construción de árbores filoxenéticas, a análise de desequilibrio de ligamento, a avaliación da diversidade xenética, a identificación de varrido selectivo, a análise de parentesco, a análise de compoñentes principais e a caracterización da estrutura da poboación.
