Sequenziamentu di u bisulfitu di u genomu interu (WGBS)
Sta tecnica, basata annantu à u trattamentu di u DNA cù bisulfitu per induce a cunversione di citosine non metilate in uracile (C à U), lascendu invariate e citosine metilate, si prisenta cum'è a metodologia di punta per una esplorazione approfondita di a metilazione di u DNA, in particulare a quinta pusizione in a citosina (5-mC), un regulatore pivotale di l'espressione genica è di l'attività cellulare.
Sta tecnica offre una risoluzione à basa unica, chì permette à i circadori d'investigà in modu cumpletu u metiloma è di scopre mudelli di metilazione anormali in i campioni. Impieghendu WGBS, i scientifichi ponu ottene insights senza paragone in i paisaghji di metilazione à livellu di u genomu, furnendu una cumprensione sfumata di i miccanismi epigenetichi chì sò à a basa di diversi prucessi biologichi è malatie.
Funzioni di serviziu
● Sequenziamentu nantu à Illumina NovaSeq.
● Richiede un genomu di riferimentu.
● L'ADN Lambda hè aghjuntu per monitorà l'efficienza di cunversione di bisulfitu.
Vantaghji di u serviziu
●Standard d'oru per a ricerca di metilazione di u DNAQuesta tecnulugia matura hà una alta precisione è una bona riproducibilità.
●Ampia cupertura è risoluzione à basa unica:A rilevazione di siti di metilazione hè à livellu di u genomu.
●Piattaforma cumpleta:Offremu un serviziu unicu da u trattamentu di campioni, a custruzione di biblioteche, u sequenziamentu à l'analisi bioinformatica.
●Una vasta cumpetenzaAvemu una larga gamma di prughjetti cumpletati in una vasta gamma di spezie. BMKGENE porta più di una decina d'anni di sperienza, una squadra d'analisi altamente qualificata, un cuntenutu cumpletu è un eccellente supportu post-vendita.
●Pussibilità di cunghjuntà si cù l'analisi di trascrizionePermette l'analisi integrata di WGBS cù altri dati omici cum'è RNA-seq.
Specifiche di Campione
| Biblioteca | Strategia di Sequenziamentu | Output di dati cunsigliatu | cuntrollu di qualità |
| Trattatu cù bisulfitu | Illumina PE150 | 30x prufundità | Q30 ≥ 85% Cunversione di bisulfitu > 99% |
Requisiti di Campione
| Cuncentrazione (ng/µL) | Quantità tutale (µg) | Requisiti supplementari | |
| ADN genomicu | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Degradazione o contaminazione limitata |
Flussu di travagliu di serviziu
Cunsegna di campioni
Estrazione di DNA
Custruzzione di a biblioteca
Sequenziamentu
Analisi di dati
Cunsegna di dati
U serviziu include l'analisi seguenti:
● Cuntrollu di qualità di u sequenziamentu crudu;
● Mappatura à u genomu di riferimentu;
● Rilevazione di basi metilate 5mC;
● Analisi di a distribuzione di metilazione è annotazione;
● Analisi di e Regioni Metilate Differenzialmente (DMR);
● Annotazione funzionale di i geni assuciati à i DMR.
Rilevazione di metilazione 5mC: tipi di siti metilati
Carta di metilazione. Distribuzione di metilazione 5mC in tuttu u genomu
Annotazione di regioni altamente metilate
Regioni Metilate Differenzialmente: geni assuciati
Regioni Metilate Differenzialmente: annotazione di geni assuciati (Ontologia Genetica)
Esplora i progressi di a ricerca facilitati da i servizii di sequenziamentu di bisulfiti di u genomu interu di BMKGene attraversu una cullezzione curata di publicazioni.
Fan, Y. et al. (2020) 'Analisi di i profili di metilazione di u DNA durante u sviluppu di u musculu scheletricu di e pecure utilizendu u sequenziamentu di u bisulfitu di u genomu interu',BMC Genomics, 21 (1), pp 1-15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Nove perturbazioni di metilazione di l'acidu desossiribonucleicu in i travagliadori esposti à u cloruru di vinile',Tossicologia è Salute Industriale, 38 (7), pp. 377-388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Relazioni trà a metilazione di u genomu, i livelli di RNA non codificanti, mRNA è metaboliti in i frutti di pumata maturanti',U Ghjurnale di e Piante, 103 (3), pp 980-994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
