Sequenza di bisulfite di u genoma tutale (WGBS)
Sequencing Bisulfite Genome Whole (WGBS) hè a metodulugia standard d'oru per l'esplorazione approfondita di a metilazione di DNA, in particulare a quinta pusizione in citosina (5-mC), un regulatore pivotale di l'espressione genica è l'attività cellulare. U principiu sottostante WGBS implica u trattamentu di bisulfite, inducendu a cunversione di citosine unmethylated in uracile (C à U), mentre chì lascianu citosine metilate inalterate. Questa tecnica offre una risoluzione di una sola basa, chì permette à i circadori di investigà in modu cumpletu u metiloma è scopre mudelli di metilazione anormali assuciati à diverse cundizioni, in particulare u cancer. Impieghendu WGBS, i scientifichi ponu acquistà insights senza precedenti in i paisaghji di metilazione in tuttu u genoma, furnisce una comprensione sfumata di i meccanismi epigenetici chì sò sottumessi à diversi prucessi biologichi è e malatie.
Funzioni di serviziu
● Esige un genoma di riferimentu.
● Lambda DNA hè aghjuntu à monitorà l'efficienza di cunversione bisulfite.
● Sequenza nantu à Illumina NovaSeq.
Vantaghji di serviziu
●Gold Standard per a ricerca di metilazione di DNA: Sta tecnulugia di trasfurmazioni di cunversione di methylation matura hà una alta precisione è una bona riproducibilità.
●Copertura larga è Risoluzione unica:rilevazione di siti di metilazione à u livellu di u genoma.
●Piattaforma cumpleta:furnisce un serviziu eccellenti unicu da a trasfurmazione di campioni, a custruzzione di a biblioteca, a sequenza à l'analisi bioinformatica.
●Vasta Competenza: cù i prughjetti di sequenza WGBS cumpletati cù successu in una varietà diversa di spezie, BMKGENE porta più di una dicada di sperienza, una squadra di analisi altamente qualificata, cuntenutu cumpletu è un eccellente supportu post-vendita.
●Possibilità di unisce cù l'Analisi di Transcriptomica: permette l'analisi integrata di WGBS cù altre dati omics cum'è RNA-seq.
Specificazioni di mostra
| Biblioteca | Strategia di sequenza | Risultato di dati cunsigliatu | Controlu di qualità |
| Bisulfite trattatu | Illumina PE150 | 30x prufundità | Q30 ≥ 85% cunversione bisulfite> 99% |
Requisiti di mostra
| Concentrazione (ng/µL) | Quantità totale (µg) | Requisiti supplementari | |
| DNA genomicu | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Degradazione limitata o contaminazione |
Flussu di travagliu di serviziu
Consegna di mostra
estrazione di DNA
Custruzzione di biblioteca
Sequencing
Analisi di dati
Consegna di dati
Include l'analisi seguente:
● Control di qualità di sequenza cruda;
● Cartografia à u genoma di riferimentu;
● Detezzione di basi methylated 5mC;
● Analisi di distribuzione di metilazione è annotazione;
● Analisi di e Regioni Methylated Differentially (DMR);
● Annotazione funzionale di i geni assuciati à i DMR.
Rilevazione di metilazione 5mC: tippi di siti metilati
Mappa di metilazione. 5mC di metilazione distribuzione genomu-wide
Annotazione di regioni altamente methylated
Regioni Methylated Differentially: genes assuciati
Regioni Methylated Differentially: annotazione di geni assuciati (Gene Ontology)
Esplora l'avanzamenti di ricerca facilitati da i servizii di sequenza di bisulfite di u genoma interu di BMKGene attraversu una cullizzioni curata di publicazioni.
Fan, Y. et al. (2020) "Analisi di i profili di metilazione di l'ADN durante u sviluppu di i musculi scheletrici d'ovini utilizendu a sequenza di bisulfite di tuttu u genoma",BMC Genomica, 21 (1), pp 1-15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) "Nove perturbazioni di metilazione di l'acidu desossiribonucleicu in i travagliadori esposti à u cloruru di vinile",Tossicologia è Salute Industriale, 38 (7), pp. 377-388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) "Relazioni trà a metilazione di u genoma, i livelli di RNA non codificanti, mRNA è metaboliti in u fruttu di pumadoru maturu".U Journal di a pianta, 103 (3), pp 980-994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
