lncrna

L'ARN long non codificanti (lncRNA) sò RNA più longu di 200 nucleotidi cù un putenziale di codificazione bassu ma cù funzioni regulatori critichi. U pipeline lncRNA BMKCloud hè pensatu per analizà e librerie rRNA impoverite cù un genoma di riferimentu di alta qualità, ben annotatu, analizendu l'espressione di lncRNA è mRNA inseme. Dopu a lettura di trimming è u cuntrollu di qualità, e letture sò allineate à u genoma di riferimentu per assemble e trascrizioni, è l'analisi di a struttura genetica successiva revela splicing alternativu è geni novi. I trascrizioni sò identificati cum'è mRNAs o lncRNAs, è l'analisi di l'espressione differenziale identificanu lncRNAs espressi di manera differenziale, i so miri è i geni espressi di manera differenziale (DEGS). Sia i DEG sia l'obiettivi di lncRNA espressi in modu differenziale sò annotati funzionalmente per truvà categurie funzionali arricchite.