lncrna

L'ARN longhi non codificanti (lncRNA) sò ARN più longhi di 200 nucleotidi cù un bassu putenziale di codificazione ma cù funzioni regulatorie critiche. A pipeline BMKCloud lncRNA hè cuncipita per analizà e biblioteche impoverite di rRNA cù un genomu di riferimentu di alta qualità è ben annotatu, analizendu inseme l'espressione di lncRNA è mRNA. Dopu u tagliu di lettura è u cuntrollu di qualità, e letture sò allineate à u genomu di riferimentu per assemblà i trascritti, è a successiva analisi di a struttura genica rivela splicing alternativu è novi geni. I trascritti sò identificati cum'è mRNA o lncRNA, è l'analisi di l'espressione differenziale identifica i lncRNA espressi in modu differenziale, i so bersagli è i geni espressi in modu differenziale (DEGS). Sia i DEG sia i bersagli di lncRNA espressi in modu differenziale sò annotati funziunalmente per truvà categurie funziunali arricchite.