Pieni RNA-sekvensointi-Alumina
Piirteet
● Kirjaston valmistelu sisältää kokovalintavaiheen
● Bioinformaattinen analyysi keskittyi miRNA -ennusteen ja niiden kohteiden ympärille
Palvelun edut
●Kattava bioinformatiikkaanalyysi:Sekä tunnettujen että uusien miRNA: ien tunnistamisen, miRNA: n kohteiden tunnistamisen ja vastaavan funktionaalisen merkinnän ja rikastumisen identifioinnin useiden tietokantojen kanssa (Kegg, GO)
●Tiukka laadunvalvonta: Otamme käyttöön ydinohjauspisteitä kaikissa vaiheissa näytteen ja kirjaston valmistelusta sekvensointiin ja bioinformatiikkaan. Tämä huolellinen seuranta varmistaa jatkuvasti korkealaatuisten tulosten toimittamisen.
●Myynnin jälkeinen tuki: Sitoumuksemme ulottuu projektin valmistumisen jälkeen 3 kuukauden myynnin jälkeisellä palvelujaksolla. Tänä aikana tarjoamme projektin seurantaa, vianetsintäapua sekä Q & A-istuntoja tuloksiin liittyvien kyselyjen ratkaisemiseksi.
●Laaja asiantuntemus: Kun menestyksekkäästi suljetaan useita SRNA -projekteja, jotka kattavat yli 300 lajia eri tutkimusalueilla, tiimimme tuo runsaasti kokemusta jokaiselle projektille.
Näytteen vaatimukset ja toimitus
| Kirjasto | Alusta | Suositellut tiedot | Tiedot QC |
| Koko valittu | Illumina SE50 | 10m-20m lukee | Q30 ≥85% |
Näytteen vaatimukset:
Nukleotidit:
| Conc. (Ng/μl) | Määrä (μg) | Puhtaus | Eheys |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Rajoitettu tai ei lainkaan proteiini- tai DNA -kontaminaatiota, joka on esitetty geelissä. | Rin≥6,0; 5,0 ≥28s/18S≥1,0; rajoitettu tai ei lainkaan lähtötason korkeus |
● Kasvit:
Juuri, varsi tai terälehti: 450 mg
Lehti tai siemen: 300 mg
Hedelmät: 1,2 g
● Eläin:
Sydän tai suolisto: 450 mg
Viskera tai aivot: 240 mg
Lihas: 600 mg
Luut, hiukset tai iho: 1,5 g
● Niveljalkaiset:
Hyönteiset: 9G
Crustacea: 450 mg
● Kokoveri: 2 putkea
● Solut: 106 solut
● Seerumi ja plasma:6 ml
Suositeltu näytteen toimitus
Kontti: 2 ml sentrifugiputkea (tinakalvoa ei suositella)
Näytteen merkinnät: ryhmä+replikoitu esim. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Lähetys:
1. Kuiva-jää: Näytteet on pakattava pusseihin ja haudata kuivajää.
2.
Huoltotyövirta
Kokeen suunnittelu
Näytteenotto
RNA: n uutto
Kirjaston rakennus
Sekvensointi
Tietojen analysointi
Myynnin jälkeiset palvelut
Bioinformatiikka
● Raakadatan laadunvalvonta
● SRNA -luokitus
● Kohdistus vertailugenomiin
● Tunnetun ja uuden miRNA: n tunnistaminen
● Mirna -ekspressioanalyysi differentiaalisesti
● MiRNA -kohteiden toiminnallinen merkintä
MiRNA: n tunnistaminen: rakenne ja syvyys
MiRNA: n differentiaalinen ekspressio - hiearginen klusterointi
Erilaisesti ekspressoitujen miRNA: ien kohteen funktionaalinen merkintä
Tutustu Bmkgenen SRNA -sekvensointipalvelujen helpottamiin tutkimusaikaan kuratoidun julkaisujen avulla.
Chen, H. et ai. (2023) 'Virusinfektiot estävät saponiinin biosynteesiä ja fotosynteesiä Panax Notoginsengissä', kasvien fysiologia ja biokemia, 203, s. 108038. Doi: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Li, H. et ai. (2023) 'Kasvin FYVE -domeenia sisältävä proteiinivapaa1 assosioituu mikroprosessorikomponenttien kanssa miRNA -biogeneesin tukahduttamiseksi', EMBO raportoi, 24 (1). doi: 10.15252/omaksu.202255037/Suppl_File/Embr202255037-SUP-0004-SDataFig4.Tif.
Yu, J. et ai. (2023) 'MicroRNA AME-BANTAM-3P hallitsee toukkien puboalikehitystä kohdistamalla moniin epidermaalisiin kasvutekijän kaltaisiin domeeneihin 8 geeniin (MEGF8) mehiläisissä, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), P . 5726. Doi: 10.3390/ijms24065726/s1.
Zhang, M. et ai. (2018) 'MiRNA: n ja lihan laatuun liittyvien geenien integroitu analyysi paljastaa, että GGA-MIR-140-5P vaikuttaa lihaksensisäiseen rasvan laskeutumiseen kanoilla', solufysiologia ja biokemia, 46 (6), s. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
