lncrna

Pitkät ei-koodaavat RNA:t (lncRNA) ovat yli 200 nukleotidin pituisia RNA:ita, joilla on alhainen koodauspotentiaali, mutta kriittisiä säätelytoimintoja. BMKCloud lncRNA -prosessi on suunniteltu analysoimaan rRNA:sta tyhjennettyjä kirjastoja korkealaatuisella, hyvin annotoidulla referenssigenomilla analysoimalla lncRNA:n ja mRNA:n ilmentymistä yhdessä. Lukemien leikkaamisen ja laadunvalvonnan jälkeen lukemat kohdistetaan referenssigenomiin transkriptien kokoamiseksi, ja sitä seuraava geenirakenneanalyysi paljastaa vaihtoehtoisen silmukoinnin ja uusia geenejä. Transkriptit tunnistetaan mRNA:iksi tai lncRNA:iksi, ja differentiaalinen ilmentymisanalyysi tunnistaa differentiaalisesti ilmentyvät lncRNA:t, niiden kohteet ja differentiaalisesti ilmentyvät geenit (DEGS). Sekä DEG:t että differentiaalisesti ilmentyvät lncRNA-kohteet annotoidaan toiminnallisesti rikastettujen funktionaalisten luokkien löytämiseksi.