-
Analisis Asosiasi Genom-lebar
Studi asosiasi genome-wide (GWAS) bertujuan untuk mengidentifikasi varian genetik (genotipe) yang terkait dengan sifat-sifat tertentu (fenotipe).Studi GWAS menyelidiki penanda genetik melintasi seluruh genom dari sejumlah besar individu dan memprediksi asosiasi genotipe-fenotipe dengan analisis statistik pada tingkat populasi.Ini telah banyak diterapkan dalam penelitian tentang penyakit manusia dan penambangan gen fungsional pada sifat-sifat kompleks hewan atau tumbuhan.
-
Pengurutan RNA nukleus tunggal
Kemajuan dalam penangkapan sel tunggal dan teknik konstruksi perpustakaan individu yang digabungkan dengan sekuensing throughput tinggi memungkinkan studi ekspresi gen berdasarkan sel demi sel.Ini memungkinkan analisis sistem yang lebih dalam dan lengkap pada populasi sel yang kompleks, di mana sebagian besar menghindari penyembunyian heterogenitasnya dengan mengambil rata-rata semua sel.
Namun, beberapa sel tidak cocok untuk dibuat menjadi suspensi sel tunggal, sehingga diperlukan metode preparasi sampel lain – ekstraksi nukleus dari jaringan, yaitu nukleus langsung diekstrak dari jaringan atau sel dan disiapkan menjadi suspensi nukleus tunggal untuk suspensi sel tunggal. pengurutan sel.
BMK menyediakan layanan pengurutan RNA sel tunggal berbasis 10× Genomics ChromiumTM.Layanan ini telah banyak digunakan dalam studi tentang studi terkait penyakit, seperti diferensiasi sel imun, heterogenitas tumor, perkembangan jaringan, dll.
Chip transkriptom spasial: 10× Genomics
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Pengurutan Genom Utuh Tumbuhan/Hewan
Pengurutan ulang seluruh genom, juga dikenal sebagai WGS, memungkinkan pengungkapan mutasi umum dan langka pada seluruh genom termasuk Polimorfisme Nukleotida Tunggal (SNP), Penghapusan Penyisipan (InDel), Variasi Struktur (SV), dan Variasi Nomor Salinan (CNV ).SV membuat porsi basis variasi yang lebih besar daripada SNP dan memiliki dampak yang lebih besar pada genom, yang memiliki efek signifikan pada organisme hidup.Pengurutan ulang yang dibaca lama memungkinkan identifikasi fragmen besar dan variasi rumit yang lebih tepat karena pembacaan yang panjang membuatnya lebih mudah untuk menyilangkan kromosom pada daerah yang rumit seperti pengulangan tandem, daerah yang kaya GC / AT, dan daerah yang sangat bervariasi.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Transkriptom Spasial BMKMANU S1000
Organisasi spasial sel memainkan peran penting dalam berbagai proses biologis, seperti infiltrasi kekebalan, perkembangan embrio, dll. Pengurutan transkriptom spasial, yang menunjukkan profil ekspresi gen sambil mempertahankan informasi posisi spasial, telah memberikan wawasan besar ke dalam arsitektur jaringan tingkat transkriptom.Dengan perkembangan teknologi, morfologi jaringan yang sangat jelas dan perbedaan struktural yang nyata dari ekspresi molekul spasial perlu dipelajari dengan resolusi yang lebih tinggi.BMKGENE menyediakan layanan pengurutan transkriptom spasial satu atap yang komprehensif dari sampel hingga wawasan biologis.
Teknologi transkriptomik spasial memberdayakan perspektif baru dalam beragam arena penelitian dengan menyelesaikan profil ekspresi gen dengan konten spasial dalam sampel yang heterogen.
Chip transkriptom spasial: BMKMANU S1000
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
10x Transkriptom Spasial Visium Genomik
Visium Spatial Gene Expression adalah teknologi pengurutan transkriptom spasial utama untuk mengklasifikasikan jaringan berdasarkan total mRNA.Petakan seluruh transkriptom dengan konteks morfologis untuk menemukan wawasan baru tentang perkembangan normal, patologi penyakit, dan penelitian translasi klinis.BMKGENE menyediakan layanan pengurutan transkriptom spasial satu atap yang komprehensif dari sampel hingga wawasan biologis.
Teknologi transkriptomik spasial memberdayakan perspektif baru dalam beragam arena penelitian dengan menyelesaikan profil ekspresi gen dengan konten spasial dalam sampel heterogen.
Chip transkriptom spasial: 10x Genomics Visium
Platform:Illumina NovaSeq 6000
-
Pengurutan mRNA Panjang Penuh-Nanopore
Pengurutan RNA telah menjadi alat yang sangat berharga untuk analisis transkriptom yang komprehensif.Tidak diragukan lagi, pengurutan baca pendek tradisional mencapai banyak perkembangan penting di sini.Namun demikian, sering menemui keterbatasan dalam identifikasi isoform panjang penuh, kuantifikasi, bias PCR.
Pengurutan nanopori membedakan dirinya dari platform pengurutan lainnya, karena nukleotida dibaca langsung tanpa sintesis DNA dan menghasilkan pembacaan panjang pada puluhan kilobase.Ini memberdayakan pembacaan langsung lintas transkrip panjang penuh dan mengatasi tantangan dalam studi tingkat isoform.
Platform：Nanopore PromethION
Perpustakaan:cDNA-PCR
-
Pengurutan mRNA panjang penuh -PacBio
Baru sajapengurutan transkriptome panjang penuh, juga dikenal sebagaiBaru sajaIso-Seq mengambil keuntungan dari pengurutan PacBio dalam panjang baca, yang memungkinkan pengurutan molekul cDNA panjang penuh tanpa putus.Ini sepenuhnya menghindari kesalahan yang dihasilkan dalam langkah perakitan transkrip dan membangun set unigene dengan resolusi tingkat isoform.Kumpulan unigen ini memberikan informasi genetik yang kuat sebagai "genom referensi" pada tingkat transkriptom.Selain itu, menggabungkan dengan data pengurutan generasi berikutnya, layanan ini memberdayakan kuantifikasi ekspresi tingkat isoform yang akurat.
Platform： Sekuel PacBio IIPerpustakaan: Perpustakaan bel SMRT -
Sequencing-Illumina mRNA eukariotik
pengurutan mRNA memungkinkan pembuatan profil semua mRNA yang ditranskripsi dari sel dalam kondisi tertentu.Ini adalah teknologi yang kuat untuk mengungkap profil ekspresi gen, struktur gen, dan mekanisme molekuler dari proses biologis tertentu.Sampai saat ini, pengurutan mRNA telah banyak digunakan dalam penelitian fundamental, diagnostik klinis, pengembangan obat, dll.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Sequencing-Illumina mRNA berbasis Non-Referensi
sequencing mRNA mengadopsi next-generation sequencing technique (NGS) untuk menangkap messenger RNA (mRNA) dari Eukaryote pada periode tertentu dimana beberapa fungsi khusus diaktifkan.Transkrip yang disambung terpanjang disebut 'Unigene' dan digunakan sebagai urutan referensi untuk analisis selanjutnya, yang merupakan cara yang efektif untuk mempelajari mekanisme molekuler dan jaringan pengatur spesies tanpa referensi.
Setelah perakitan data transkriptom dan anotasi fungsional unigene
(1) Analisis SSR, prediksi CDS dan struktur gen akan dibentuk sebelumnya.
(2) Kuantifikasi ekspresi unigen pada setiap sampel akan dilakukan.
(3) Unigen yang diekspresikan secara berbeda antara sampel (atau kelompok) akan ditemukan berdasarkan ekspresi unigen
(4) Pengelompokan, anotasi fungsional, dan analisis pengayaan unigen yang diekspresikan secara berbeda akan dilakukan
-
Sequencing non-coding panjang-Illumina
RNA non-coding panjang (lncRNAs) adalah jenis molekul RNA dengan panjang melebihi 200 nt, yang ditandai dengan potensi pengkodean yang sangat rendah.LncRNA, sebagai anggota kunci dalam RNA non-coding, terutama ditemukan di nukleus dan plasma.Perkembangan teknologi pengurutan dan bioinformtik memungkinkan identifikasi banyak lncRNA baru dan mengaitkannya dengan fungsi biologis.Bukti akumulatif menunjukkan bahwa lncRNA secara luas terlibat dalam regulasi epigenetik, regulasi transkripsi, dan regulasi pasca transkripsi.
