● Tersedia dua panel eksom berdasarkan pengayaan target dengan probe: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) dan xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).
● Pengurutan DNA menggunakan Illumina NovaSeq.
● Alur kerja bioinformatika yang diarahkan pada analisis penyakit atau analisis tumor.
●Menargetkan Wilayah Pengkodean ProteinDengan menangkap dan mengurutkan wilayah pengkodean protein, hWES digunakan untuk mengungkap varian yang terkait dengan struktur protein.
●Hemat Biaya:hWES menghasilkan sekitar 85% mutasi terkait penyakit manusia dari 1% genom manusia.
●Akurasi TinggiDengan kedalaman sekuensing yang tinggi, hWES mempermudah deteksi baik varian umum maupun varian langka dengan frekuensi kurang dari 1%.
●Kontrol Kualitas yang KetatKami menerapkan lima titik kontrol inti di semua tahapan, mulai dari persiapan sampel dan pustaka hingga pengurutan dan bioinformatika. Pemantauan yang cermat ini memastikan penyampaian hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
●Analisis Bioinformatika Komprehensif: Alur kerja kami melampaui sekadar mengidentifikasi variasi pada genom referensi, karena menggabungkan analisis canggih yang dirancang khusus untuk menjawab pertanyaan penelitian yang berkaitan dengan aspek genetik penyakit atau analisis tumor.
●Dukungan Purna Jual:Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan masa layanan purna jual selama 3 bulan. Selama periode ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menjawab pertanyaan apa pun terkait hasil proyek.
| Strategi Penangkapan Exon | Strategi Pengurutan | Output Data yang Direkomendasikan |
| Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) atau xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)
| Illumina NovaSeq PE150 | 5-10 GB Untuk gangguan Mendel/penyakit langka: > 50x Untuk sampel tumor: ≥ 100x |
| Jenis Sampel
| Jumlah(Qubit®)
| Konsentrasi | Volume
| Kemurnian (NanoDrop™) |
|
DNA genomik
| ≥ 50 ng | ≥ 6 ng/μL | ≥ 15 μL | OD260/280=1.8-2.0 tidak ada degradasi, tidak ada kontaminasi
|
Analisis bioinformatika sampel penyakit hWES meliputi:
● Kontrol kualitas data sekuensing
● Penyelarasan Genom Referensi
● Identifikasi SNP dan InDels
● Anotasi Fungsional SNP dan InDels
Analisis bioinformatika sampel tumor meliputi:
● Kontrol kualitas data sekuensing
● Penyelarasan Genom Referensi
● Identifikasi SNP, InDels, dan variasi somatik
● Identifikasi varian germline
● Analisis tanda mutasi
● Identifikasi gen penggerak berdasarkan mutasi peningkatan fungsi
● Anotasi mutasi pada tingkat kerentanan obat
● Analisis heterogenitas – perhitungan kemurnian dan ploidi
Kontrol Kualitas Data – Statistik Pengambilan Eksom
Identifikasi varian – InDels
Analisis lanjutan: identifikasi dan distribusi SNP/InDels berbahaya – plot Circos
Analisis tumor: identifikasi dan distribusi mutasi somatik – plot Circos
Analisis tumor: garis keturunan klonal