lncrna

RNA non-coding panjang (lncRNA) adalah RNA yang lebih panjang dari 200 nukleotida dengan potensi pengkodean rendah tetapi memiliki fungsi pengaturan yang penting. Pipeline lncRNA BMKCloud dirancang untuk menganalisis pustaka yang telah dikurangi rRNA dengan genom referensi berkualitas tinggi dan terannotasi dengan baik, dengan menganalisis ekspresi lncRNA dan mRNA secara bersamaan. Setelah pemangkasan bacaan dan kontrol kualitas, bacaan diselaraskan dengan genom referensi untuk menyusun transkrip, dan analisis struktur gen selanjutnya mengungkapkan penyambungan alternatif dan gen baru. Transkrip diidentifikasi sebagai mRNA atau lncRNA, dan analisis ekspresi diferensial mengidentifikasi lncRNA yang diekspresikan secara diferensial, targetnya, dan gen yang diekspresikan secara diferensial (DEGS). Baik DEGs maupun target lncRNA yang diekspresikan secara diferensial dianotasi secara fungsional untuk menemukan kategori fungsional yang diperkaya.