lncrna

RNA non-coding panjang (lncRNA) adalah RNA yang panjangnya lebih dari 200 nukleotida dengan potensi coding rendah tetapi memiliki fungsi regulasi yang penting. Pipeline lncRNA BMKCloud dirancang untuk menganalisis pustaka yang telah didepleksi rRNA dengan genom referensi berkualitas tinggi dan teranotasi dengan baik, dengan menganalisis ekspresi lncRNA dan mRNA secara bersamaan. Setelah pemangkasan pembacaan dan kontrol kualitas, pembacaan diselaraskan dengan genom referensi untuk menyusun transkrip, dan analisis struktur gen selanjutnya mengungkapkan penyambungan alternatif dan gen baru. Transkrip diidentifikasi sebagai mRNA atau lncRNA, dan analisis ekspresi diferensial mengidentifikasi lncRNA yang diekspresikan secara diferensial, targetnya, dan gen yang diekspresikan secara diferensial (DEG). Baik DEG maupun target lncRNA yang diekspresikan secara diferensial dianotasi secara fungsional untuk menemukan kategori fungsional yang diperkaya.