lncRNS
Garās nekodējošās RNS (lncRNS) ir RNS, kas garākas par 200 nukleotīdiem, ar zemu kodēšanas potenciālu, bet ar kritiskām regulējošām funkcijām. BMKCloud lncRNS cauruļvads ir izstrādāts, lai analizētu rRNS noplicinātas bibliotēkas ar augstas kvalitātes, labi anotētu atsauces genomu, analizējot lncRNS un mRNS ekspresiju kopā. Pēc nolasīšanas apgriešanas un kvalitātes kontroles nolasījumi tiek saskaņoti ar atsauces genomu, lai apkopotu transkriptus, un sekojošā gēnu struktūras analīze atklāj alternatīvu splaisošanu un jaunus gēnus. Transkripti tiek identificēti kā mRNS vai lncRNS, un diferenciālās ekspresijas analīze identificē diferenciāli ekspresētās lncRNS, to mērķus un diferenciāli ekspresētos gēnus (DEGS). Gan DEG, gan diferenciāli ekspresētie lncRNS mērķi tiek funkcionāli anotēti, lai atrastu bagātinātas funkcionālās kategorijas.
Bioinformātika
