lncrna

Τα μακρά μη κωδικοποιητικά RNA (lncRNA) είναι RNA μήκους άνω των 200 νουκλεοτιδίων με χαμηλό δυναμικό κωδικοποίησης αλλά με κρίσιμες ρυθμιστικές λειτουργίες. Ο αγωγός lncRNA του BMKCloud έχει σχεδιαστεί για να αναλύει βιβλιοθήκες με περιορισμένο rRNA και ένα υψηλής ποιότητας, καλά σχολιασμένο γονιδίωμα αναφοράς, αναλύοντας μαζί την έκφραση lncRNA και mRNA. Μετά την περικοπή ανάγνωσης και τον ποιοτικό έλεγχο, οι αναγνώσεις ευθυγραμμίζονται με το γονιδίωμα αναφοράς για τη συναρμολόγηση μεταγραφών και η επακόλουθη ανάλυση της δομής των γονιδίων αποκαλύπτει εναλλακτική συρραφή και νέα γονίδια. Τα μεταγραφές αναγνωρίζονται ως mRNA ή lncRNA και η ανάλυση διαφορικής έκφρασης αναγνωρίζει διαφορικά εκφραζόμενα lncRNA, τους στόχους τους και τα διαφορικά εκφραζόμενα γονίδια (DEGS). Τόσο τα DEG όσο και οι διαφορικά εκφραζόμενοι στόχοι lncRNA σχολιάζονται λειτουργικά για να βρεθούν εμπλουτισμένες λειτουργικές κατηγορίες.