lncrna

긴 비코딩 RNA(lncRNA)는 200개 이상의 뉴클레오티드로 구성된 RNA로, 코딩 가능성은 낮지만 중요한 조절 기능을 수행합니다. BMKCloud lncRNA 파이프라인은 lncRNA와 mRNA 발현을 함께 분석하여, 고품질의 잘 주석된 참조 게놈을 사용하는 rRNA 결핍 라이브러리를 분석하도록 설계되었습니다. 리드 트리밍 및 품질 관리 후, 리드는 참조 게놈에 정렬되어 전사체를 조립하고, 후속 유전자 구조 분석을 통해 대체 스플라이싱 및 새로운 유전자를 밝혀냅니다. 전사체는 mRNA 또는 lncRNA로 식별되며, 차등 발현 분석을 통해 차등 발현 lncRNA, 그 표적 유전자 및 차등 발현 유전자(DEG)를 식별합니다. 차등 발현 유전자와 차등 발현 lncRNA 표적 유전자 모두에 기능적 주석을 달아 풍부하게 나타나는 기능 범주를 찾습니다.