lncrna

Lange net-kodearjende RNA's (lncRNA) binne RNA's langer as 200 nukleotiden mei leech kodearringspotinsjeel, mar mei krityske regeljouwingsfunksjes. De BMKCloud lncRNA-pipeline is ûntworpen om rRNA-útputte bibleteken te analysearjen mei in heechweardich, goed annotearre referinsjegenoom, troch lncRNA- en mRNA-ekspresje tegearre te analysearjen. Nei it trimmen fan lêzen en kwaliteitskontrôle wurde lêzingen ôfstimd op it referinsjegenoom om transkripten gear te stellen, en neifolgjende genstruktueranalyse ûntbleatet alternative splicing en nije genen. Transkripten wurde identifisearre as mRNA's of lncRNA's, en differinsjele ekspresjeanalyse identifisearret differinsjeel útdrukte lncRNA's, har doelen en differinsjeel útdrukte genen (DEGS). Sawol DEG's as differinsjeel útdrukte lncRNA-doelen wurde funksjoneel annotearre om ferrike funksjonele kategoryen te finen.