lncrna

ကုဒ်မပါဝင်သော ရှည်လျားသော RNA များ (lncRNA) သည် ကုဒ်ရေးနိုင်စွမ်းနည်းသော်လည်း အရေးကြီးသော ထိန်းညှိပေးသည့် လုပ်ဆောင်ချက်များရှိသော နျူကလီယိုတိုက် ၂၀၀ ထက်ပိုရှည်သော RNA များဖြစ်သည်။ BMKCloud lncRNA pipeline ကို lncRNA နှင့် mRNA ဖော်ပြမှုကို အတူတကွ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းဖြင့် အရည်အသွေးမြင့်မားပြီး ကောင်းစွာမှတ်ချက်ပြုထားသော reference genome ရှိသော rRNA ကုန်ဆုံးသွားသော libraries များကို ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာရန် ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသည်။ ဖတ်ရှုမှုဖြတ်တောက်ခြင်းနှင့် အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုပြီးနောက်၊ ဖတ်ရှုမှုများကို transcripts များကိုစုစည်းရန် reference genome နှင့် ချိန်ညှိပြီး နောက်ဆက်တွဲ gene structure analysis သည် အခြားရွေးချယ်စရာ splicing နှင့် novel genes များကို ဖော်ပြသည်။ Transcripts များကို mRNA သို့မဟုတ် lncRNAs အဖြစ် ခွဲခြားသတ်မှတ်ပြီး differential expression analysis သည် differentially expressed lncRNAs၊ ၎င်းတို့၏ targets များနှင့် differentially expressed genes (DEGS) များကို ဖော်ထုတ်သည်။ DEGs နှင့် differentially expressed lncRNA targets နှစ်ခုလုံးကို ကြွယ်ဝသော functional categories များကိုရှာဖွေရန် functionally annotated လုပ်ထားသည်။