lncrna

Long non-coding RNAs (lncRNA) nyaéta RNA anu panjangna leuwih ti 200 nukléotida kalayan poténsi coding low tapi mibanda fungsi pangaturan kritis. Pipa lncRNA BMKCloud dirancang pikeun nganalisa perpustakaan anu rusak rRNA kalayan kualitas luhur, génom rujukan anu annotated, ku cara nganalisis éksprési lncRNA sareng mRNA babarengan. Saatos trimming dibaca sareng kontrol kualitas, bacaan disaluyuan kana génom rujukan pikeun ngumpul transkrip, sareng analisis struktur gén salajengna ngungkabkeun splicing alternatif sareng gén novel. Transkrip diidentifikasi minangka mRNA atanapi lncRNA, sareng analisis éksprési diferensial ngaidentipikasi lncRNA anu dikedalkeun sacara béda, udaganana sareng gén anu dikedalkeun sacara béda (DEGS). Duanana DEG sareng target lncRNA anu dikedalkeun sacara béda sacara fungsional dijelaskeun pikeun mendakan kategori fungsional anu diperkaya.