lncrna

RNA luze ez-kodetzaileak (lncRNA) 200 nukleotido baino luzeagoak diren RNAk dira, kodetze potentzial txikia dutenak baina funtzio erregulatzaile kritikoak dituztenak. BMKCloud lncRNA hoditeria kalitate handiko eta ondo anotatutako erreferentziazko genoma duen rRNA agortutako liburutegiak aztertzeko diseinatuta dago, lncRNA eta mRNAren adierazpena elkarrekin aztertuz. Irakurketak moztu eta kalitate-kontrola egin ondoren, irakurketak erreferentziazko genomarekin lerrokatzen dira transkripzioak muntatzeko, eta ondorengo gene-egituraren analisiak splicing alternatiboa eta gene berriak agerian uzten ditu. Transkripzioak mRNA edo lncRNA gisa identifikatzen dira, eta adierazpen diferentzialaren analisiak modu diferentzialean adierazitako lncRNAk, haien helburuak eta modu diferentzialean adierazitako geneak (DEGS) identifikatzen ditu. Bai DEGak bai diferentzialki adierazitako lncRNA helburuak funtzionalki anotatzen dira kategoria funtzional aberastuak aurkitzeko.