lncrna

RNA ที่ไม่เข้ารหัสแบบยาว (lncRNA) คือ RNA ที่มีความยาวมากกว่า 200 นิวคลีโอไทด์ มีศักยภาพในการเข้ารหัสต่ำ แต่มีหน้าที่ควบคุมที่สำคัญ ไปป์ไลน์ lncRNA ของ BMKCloud ออกแบบมาเพื่อวิเคราะห์ไลบรารีที่ปราศจาก rRNA โดยใช้จีโนมอ้างอิงคุณภาพสูงที่มีการระบุรายละเอียดอย่างดี โดยการวิเคราะห์การแสดงออกของ lncRNA และ mRNA ไปพร้อมกัน หลังจากตัดแต่งและควบคุมคุณภาพแล้ว ข้อมูลการอ่านจะถูกจัดเรียงกับจีโนมอ้างอิงเพื่อประกอบเป็นทรานสคริปต์ และการวิเคราะห์โครงสร้างยีนในภายหลังจะเผยให้เห็นการตัดต่อทางเลือกและยีนใหม่ ทรานสคริปต์จะถูกระบุว่าเป็น mRNA หรือ lncRNA และการวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกันจะระบุ lncRNA ที่แสดงออกแตกต่างกัน เป้าหมายของ lncRNA และยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (DEG) ทั้ง DEG และเป้าหมายของ lncRNA ที่แสดงออกแตกต่างกันจะได้รับการระบุหน้าที่เพื่อค้นหาหมวดหมู่หน้าที่ที่อุดมสมบูรณ์