lncrna

Long non-coding RNAs (lncRNA) yaiku RNA sing luwih dawa tinimbang 200 nukleotida kanthi potensial pengkodean sing sithik nanging nduweni fungsi pangaturan kritis. Pipa lncRNA BMKCloud dirancang kanggo nganalisa pustaka sing wis entek rRNA kanthi genom referensi sing berkualitas tinggi, kanthi anotasi kanthi apik, kanthi nganalisa ekspresi lncRNA lan mRNA bebarengan. Sawise maca trimming lan kontrol kualitas, maca didadekake siji kanggo genom referensi kanggo ngumpulake transkrip, lan analisis struktur gen sakteruse mbukak splicing alternatif lan gen novel. Transkrip diidentifikasi minangka mRNA utawa lncRNAs, lan analisis ekspresi diferensial ngenali lncRNA sing diwedharake kanthi beda, target lan gen sing diungkapake kanthi beda (DEGS). Loro-lorone DEG lan target lncRNA sing diungkapake kanthi beda diwulangake kanthi fungsional kanggo nemokake kategori fungsional sing diperkaya.