lncrna

RNA non-coding dawa (lncRNA) yaiku RNA sing luwih dawa tinimbang 200 nukleotida kanthi potensi coding sing endhek nanging kanthi fungsi pangaturan sing penting. Pipa lncRNA BMKCloud dirancang kanggo nganalisis pustaka rRNA sing wis entek kanthi genom referensi sing berkualitas tinggi lan diwenehi anotasi kanthi apik, kanthi nganalisis ekspresi lncRNA lan mRNA bebarengan. Sawise pemangkasan maca lan kontrol kualitas, bacaan diselarasake karo genom referensi kanggo nglumpukake transkrip, lan analisis struktur gen sabanjure mbukak splicing alternatif lan gen anyar. Transkrip diidentifikasi minangka mRNA utawa lncRNA, lan analisis ekspresi diferensial ngenali lncRNA sing diekspresikan kanthi beda, target lan gen sing diekspresikan kanthi beda (DEGS). DEG lan target lncRNA sing diekspresikan kanthi beda diwenehi anotasi kanthi fungsional kanggo nemokake kategori fungsional sing diperkaya.