lncrna

Os ARN longos non codificantes (ARNlnc) son ARN de máis de 200 nucleótidos con baixo potencial de codificación pero con funcións reguladoras críticas. A canalización de lncRNA de BMKCloud está deseñada para analizar bibliotecas esgotadas de ARNr cun xenoma de referencia de alta calidade e ben anotado, analizando a expresión de lncRNA e ARNm xuntos. Despois do recorte da lectura e do control de calidade, as lecturas alíñanse co xenoma de referencia para ensamblar as transcricións, e a posterior análise da estrutura dos xenes revela un empalme alternativo e xenes novos. As transcricións identifícanse como ARNm ou ARNlc, e a análise da expresión diferencial identifica os ARNmn expresados ​​de forma diferencial, as súas dianas e os xenes expresados ​​de forma diferencial (DEGS). Tanto os DEG como os obxectivos de lncRNA expresados ​​de forma diferencial están anotados funcionalmente para atopar categorías funcionais enriquecidas.