-
Seicheamh genome de lus / ainmhidhean
Chan eiltha seicheamhachadh a’ toirt iomradh air togail genoma gnè iomlan a’ cleachdadh teicneòlasan sreathachaidh, me PacBio, Nanopore, NGS, msaa, às aonais genoma iomraidh.Tha an leasachadh iongantach ann an fad leughaidh de theicneòlasan sreath treas ginealach air cothroman ùra a thoirt seachad ann a bhith a’ cur ri chèile genomes iom-fhillte, leithid an fheadhainn le heterozygosity àrd, co-mheas àrd de roinnean ath-aithris, polyploids, msaa. fuasgladh eileamaidean ath-aithris, roinnean le susbaint GC neo-àbhaisteach agus roinnean eile a tha gu math toinnte.
Àrd-ùrlar: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Seanadh Genome stèidhichte air Hi-C
Is e dòigh a th’ ann an Hi-C a chaidh a dhealbhadh gus rèiteachadh chromosomes a ghlacadh le bhith a’ cothlamadh eadar-obrachaidhean stèidhichte air faisg air làimh agus sreath àrd-threabhaidh.Thathas a’ creidsinn gu bheil dian nan eadar-obrachaidhean sin co-cheangailte gu àicheil ri astar fiosaigeach air cromosoman.Mar sin, dh’ fhaodadh dàta Hi-C stiùireadh a thoirt do chruinneachadh, òrdachadh agus stiùireadh sreathan cruinnichte ann an dreach genome agus an fheadhainn sin a cheangal air àireamh sònraichte de chromosomes.Tha an teicneòlas seo a’ toirt cumhachd do cho-chruinneachadh genoma aig ìre chromosome às aonais mapa ginteil stèidhichte air àireamh-sluaigh.Feumaidh gach genoma Hi-C.
Àrd-ùrlar: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Gintinneachd mean-fhàs
Tha gintinneachd mean-fhàs na sheirbheis seicheamhachaidh làn a chaidh a dhealbhadh gus mìneachadh farsaing a thoirt seachad air fiosrachadh mean-fhàs de stuthan sònraichte stèidhichte air caochlaidhean ginteil, a’ toirt a-steach SNPn, InDels, SVn agus CNVn.Tha e a 'toirt seachad a h-uile mion-sgrùdadh bunaiteach a dh' fheumar airson cunntas a thoirt air atharrachaidhean mean-fhàs agus feartan ginteil àireamhan, leithid structar sluaigh, iomadachd ginteil, dàimhean phylogeny, msaa.
-
Genomics coimeasach
Tha genomics coimeasach gu litireil a’ ciallachadh coimeas a dhèanamh eadar sreathan genome iomlan agus structaran de dhiofar ghnèithean.Tha an smachd seo ag amas air a bhith a’ nochdadh mean-fhàs gnè, gnìomh gine, uidheamachd riaghlaidh gine aig ìre genome le bhith a’ comharrachadh nan structaran sreath agus eileamaidean a ghlèidh no a dh’ eadar-dhealachadh thar diofar ghnèithean.Tha sgrùdadh genomics coimeasach àbhaisteach a’ toirt a-steach mion-sgrùdaidhean ann an teaghlach gine, leasachadh mean-fhàs, dùblachadh genoma slàn, cuideam roghnach, msaa.
-
Mion-sgrùdadh Bulked Segregant
Tha mion-sgrùdadh segregant mòr (BSA) na dhòigh air a chleachdadh gus comharran ginteil co-cheangailte ri phenotype a chomharrachadh gu sgiobalta.Tha prìomh shruth-obrach BSA a’ toirt a-steach taghadh dà bhuidheann de dhaoine fa leth le phenotypes gu math dùbhlanach, a’ cruinneachadh DNA gach neach gus dà mhòr-chuid de DNA a chruthachadh, a’ comharrachadh sreathan eadar-dhealaichte eadar dà linne.Tha an dòigh seo air a bhith air a chleachdadh gu mòr ann a bhith a’ comharrachadh comharran ginteil a tha gu làidir co-cheangailte ri ginean cuimsichte ann an genomes planntrais / ainmhidhean.
