-
ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਇਮਯੂਨੋਪ੍ਰੀਸੀਪੀਟੇਸ਼ਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (ChIP-seq)
ChIP-Seq ਹਿਸਟੋਨ ਸੋਧ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਕਾਰਕਾਂ, ਅਤੇ ਹੋਰ ਡੀਐਨਏ-ਸਬੰਧਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਲਈ ਡੀਐਨਏ ਟੀਚਿਆਂ ਦੀ ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।ਇਹ ਖਾਸ ਪ੍ਰੋਟੀਨ-ਡੀਐਨਏ ਕੰਪਲੈਕਸਾਂ ਨੂੰ ਮੁੜ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨ ਲਈ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਇਮਿਊਨੋ-ਪ੍ਰੀਪੀਟੇਸ਼ਨ (ChIP) ਦੀ ਚੋਣ ਨੂੰ ਜੋੜਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਨਾਲ ਬਰਾਮਦ ਕੀਤੇ ਗਏ ਡੀਐਨਏ ਦੇ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁਟ ਕ੍ਰਮ ਲਈ ਅਗਲੀ ਪੀੜ੍ਹੀ ਦੇ ਕ੍ਰਮ (NGS) ਦੀ ਸ਼ਕਤੀ ਹੈ।ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, ਕਿਉਂਕਿ ਪ੍ਰੋਟੀਨ-ਡੀਐਨਏ ਕੰਪਲੈਕਸ ਜੀਵਿਤ ਸੈੱਲਾਂ ਤੋਂ ਬਰਾਮਦ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ, ਬਾਈਡਿੰਗ ਸਾਈਟਾਂ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮਾਂ ਅਤੇ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਵਿੱਚ, ਜਾਂ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸਥਿਤੀਆਂ ਵਿੱਚ ਕੀਤੀ ਜਾ ਸਕਦੀ ਹੈ।ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨਲ ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ ਤੋਂ ਲੈ ਕੇ ਡਿਵੈਲਪਮੈਂਟਲ ਪਾਥਵੇਅਜ਼ ਤੋਂ ਲੈ ਕੇ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਮਕੈਨਿਜ਼ਮ ਤੱਕ ਅਤੇ ਇਸ ਤੋਂ ਵੀ ਅੱਗੇ ਹਨ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq 6000
-
ਪੂਰਾ ਜੀਨੋਮ ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਕ੍ਰਮ
ਸਾਇਟੋਸਾਈਨ (5-mC) ਵਿੱਚ ਪੰਜਵੇਂ ਸਥਾਨ 'ਤੇ ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਦਾ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਅਤੇ ਸੈਲੂਲਰ ਗਤੀਵਿਧੀ 'ਤੇ ਇੱਕ ਬੁਨਿਆਦੀ ਪ੍ਰਭਾਵ ਹੈ।ਅਸਧਾਰਨ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਪੈਟਰਨ ਕਈ ਹਾਲਤਾਂ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀਆਂ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਕੈਂਸਰ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਹਨ।WGBS ਸਿੰਗਲ ਬੇਸ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ 'ਤੇ ਜੀਨੋਮ-ਵਾਈਡ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਕਰਨ ਲਈ ਸੋਨੇ ਦਾ ਮਿਆਰ ਬਣ ਗਿਆ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq6000
-
ਹਾਈ ਥ੍ਰੂਪੁੱਟ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ (ATAC-seq) ਦੇ ਨਾਲ ਟ੍ਰਾਂਸਪੋਸੇਜ਼-ਪਹੁੰਚਯੋਗ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਲਈ ਪਰਖ
ATAC-seq ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਅਸੈਸਬਿਲਟੀ ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਇੱਕ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁੱਟ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਵਿਧੀ ਹੈ, ਜੋ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੇ ਗਲੋਬਲ ਐਪੀਜੇਨੇਟਿਕ ਨਿਯੰਤਰਣ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ।ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਅਡਾਪਟਰਾਂ ਨੂੰ ਹਾਈਪਰਐਕਟਿਵ Tn5 ਟ੍ਰਾਂਸਪੋਸੇਸ ਦੁਆਰਾ ਖੁੱਲੇ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਪਾਇਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।ਪੀਸੀਆਰ ਐਂਪਲੀਫੀਕੇਸ਼ਨ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਇੱਕ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਬਣਾਈ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।ਸਾਰੇ ਖੁੱਲੇ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਖੇਤਰ ਇੱਕ ਖਾਸ ਸਪੇਸ-ਟਾਈਮ ਸਥਿਤੀ ਦੇ ਅਧੀਨ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤੇ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਨਾ ਸਿਰਫ ਇੱਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਕਾਰਕ ਦੀਆਂ ਬਾਈਡਿੰਗ ਸਾਈਟਾਂ, ਜਾਂ ਇੱਕ ਖਾਸ ਹਿਸਟੋਨ ਸੋਧੇ ਹੋਏ ਖੇਤਰ ਤੱਕ ਸੀਮਿਤ ਨਹੀਂ।
-
ਘਟੀ ਹੋਈ ਪ੍ਰਤੀਨਿਧਤਾ ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (RRBS)
ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਖੋਜ ਰੋਗ ਖੋਜ ਵਿੱਚ ਹਮੇਸ਼ਾਂ ਇੱਕ ਗਰਮ ਵਿਸ਼ਾ ਰਿਹਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਅਤੇ ਫੀਨੋ-ਟਾਈਪਿਕ ਗੁਣਾਂ ਨਾਲ ਨੇੜਿਓਂ ਸਬੰਧਤ ਹੈ।RRBS DNA ਮੈਥਾਈਲੇਸ਼ਨ ਖੋਜ ਲਈ ਇੱਕ ਸਹੀ, ਕੁਸ਼ਲ ਅਤੇ ਕਿਫ਼ਾਇਤੀ ਤਰੀਕਾ ਹੈ।ਐਨਜ਼ਾਈਮੈਟਿਕ ਕਲੀਵੇਜ (Msp I) ਦੁਆਰਾ ਪ੍ਰਮੋਟਰ ਅਤੇ CpG ਟਾਪੂ ਖੇਤਰਾਂ ਦਾ ਸੰਸ਼ੋਧਨ, ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਕ੍ਰਮ ਦੇ ਨਾਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਉੱਚ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਖੋਜ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq 6000
