-
Секвениране на имунопреципитация на хроматин (ChIP-seq)
ChIP-Seq осигурява профилиране в целия геном на ДНК мишени за хистонова модификация, транскрипционни фактори и други ДНК-свързани протеини.Той съчетава селективността на имунопреципитацията на хроматина (ChIP) за възстановяване на специфични протеин-ДНК комплекси, със силата на секвениране от следващо поколение (NGS) за високопроизводително секвениране на възстановената ДНК.Освен това, тъй като комплексите протеин-ДНК се възстановяват от живи клетки, местата на свързване могат да бъдат сравнени в различни типове клетки и тъкани или при различни условия.Приложенията варират от регулиране на транскрипцията до пътища на развитие до механизми на заболяването и отвъд.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Бисулфитно секвениране на целия геном
Метилирането на ДНК на пета позиция в цитозин (5-mC) има фундаментално влияние върху генната експресия и клетъчната активност.Анормалните модели на метилиране са свързани с няколко състояния и заболявания, като рак.WGBS се превърна в златен стандарт за изследване на метилиране в целия геном при разделителна способност с единична база.
Платформа: Illumina NovaSeq6000
-
Анализ за хроматин, достъпен за транспозаза с високопроизводително секвениране (ATAC-seq)
ATAC-seq е високопроизводителен метод за секвениране за анализ на достъпността на хроматина в целия геном, който е важен за глобалния епигенетичен контрол на генната експресия.Секвениращите адаптери се вмъкват в отворени хроматинови региони чрез хиперактивна Tn5 транспоза.След PCR амплификация се конструира библиотека за секвениране.Всички отворени хроматинови региони могат да бъдат получени при специфично пространство-времево условие, не само ограничени до местата на свързване на транскрипционен фактор или определен хистон модифициран регион.
-
Бисулфитно секвениране с намалено представяне (RRBS)
Изследванията за метилиране на ДНК винаги са били гореща тема в изследванията на болестите и са тясно свързани с генната експресия и фенотипните черти.RRBS е точен, ефективен и икономичен метод за изследване на ДНК метилиране.Обогатяването на промоторните и CpG островните региони чрез ензимно разцепване (Msp I), комбинирано с бисулфитно секвениране, осигурява откриване на ДНК метилиране с висока разделителна способност.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
