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염색질 면역침전 시퀀싱(ChIP-seq)
ChIP-Seq는 히스톤 변형, 전사 인자 및 기타 DNA 관련 단백질에 대한 DNA 표적의 게놈 전체 프로파일링을 제공합니다.이것은 특정 단백질-DNA 복합체를 복구하기 위한 염색질 면역 침전(ChIP)의 선택성과 회수된 DNA의 고처리량 시퀀싱을 위한 차세대 시퀀싱(NGS)의 능력을 결합합니다.또한 단백질-DNA 복합체가 살아있는 세포에서 회수되기 때문에 결합 부위는 다른 세포 유형 및 조직 또는 다른 조건에서 비교할 수 있습니다.적용 범위는 전사 조절에서 질병 메커니즘 및 그 이상에 이르는 발달 경로에 이르기까지 다양합니다.
플랫폼: Illumina NovaSeq 6000
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전체 게놈 바이설파이트 시퀀싱
사이토신(5-mC)의 다섯 번째 위치에서 DNA 메틸화는 유전자 발현과 세포 활동에 근본적인 영향을 미칩니다.비정상적인 메틸화 패턴은 암과 같은 여러 상태 및 질병과 관련이 있습니다.WGBS는 단일 염기 분해능에서 게놈 전체의 메틸화를 연구하기 위한 황금 표준이 되었습니다.
플랫폼: Illumina NovaSeq6000
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높은 처리량 시퀀싱(ATAC-seq)을 사용한 트랜스포사제 액세스 가능 염색질 분석
ATAC-seq는 유전자 발현의 전체적인 후성유전학적 제어에 중요한 게놈 전체의 염색질 접근성 분석을 위한 고처리량 시퀀싱 방법입니다.시퀀싱 어댑터는 과활성 Tn5 트랜스포사제에 의해 열린 염색질 영역에 삽입됩니다.PCR 증폭 후 시퀀싱 라이브러리가 구성됩니다.모든 열린 염색질 영역은 전사 인자의 결합 부위 또는 특정 히스톤 변형 영역에 국한되지 않고 특정 시공간 조건에서 얻을 수 있습니다.
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RRBS(Reduced Representation Bisulfite Sequencing)
DNA 메틸화 연구는 항상 질병 연구에서 뜨거운 주제였으며 유전자 발현 및 표현형 특성과 밀접한 관련이 있습니다.RRBS는 DNA 메틸화 연구를 위한 정확하고 효율적이며 경제적인 방법입니다.Bisulfite 시퀀싱과 결합된 효소 절단(Msp I)에 의한 프로모터 및 CpG 섬 영역의 농축은 고해상도 DNA 메틸화 검출을 제공합니다.
플랫폼: Illumina NovaSeq 6000
