-
Penjujukan Imunopresipitasi Kromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq menyediakan pemprofilan seluruh genom bagi sasaran DNA untuk pengubahsuaian histon, faktor transkripsi dan protein berkaitan DNA yang lain.Ia menggabungkan selektiviti chromatin immuno-precipitation (ChIP) untuk memulihkan kompleks protein-DNA tertentu, dengan kuasa penjujukan generasi akan datang (NGS) untuk penjujukan pemprosesan tinggi bagi DNA yang dipulihkan.Selain itu, kerana kompleks protein-DNA diperoleh semula daripada sel hidup, tapak pengikatan boleh dibandingkan dalam jenis sel dan tisu yang berbeza, atau dalam keadaan yang berbeza.Aplikasi terdiri daripada peraturan transkrip kepada laluan perkembangan kepada mekanisme penyakit dan seterusnya.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Penjujukan genom bisulfit keseluruhan
Metilasi DNA pada kedudukan kelima dalam sitosin (5-mC) mempunyai pengaruh asas pada ekspresi gen dan aktiviti selular.Corak metilasi yang tidak normal telah dikaitkan dengan beberapa keadaan dan penyakit, seperti kanser.WGBS telah menjadi piawaian emas untuk mengkaji metilasi seluruh genom pada resolusi asas tunggal.
Platform: Illumina NovaSeq6000
-
Ujian untuk Kromatin Boleh Akses Transposase dengan Penjujukan Throughput Tinggi (ATAC-seq)
ATAC-seq ialah kaedah penjujukan throughput tinggi untuk analisis kebolehcapaian kromatin seluruh genom, yang penting untuk kawalan epigenetik global ekspresi gen.Penyesuai penjujukan dimasukkan ke dalam kawasan kromatin terbuka oleh transposase Tn5 hiperaktif.Selepas penguatan PCR, perpustakaan penjujukan dibina.Semua kawasan kromatin terbuka boleh diperoleh di bawah keadaan ruang-masa tertentu, bukan sahaja terhad kepada tapak pengikatan faktor transkripsi, atau kawasan ubah suai histon tertentu.
-
Penjujukan Bisulfit Perwakilan Terkurang (RRBS)
Penyelidikan metilasi DNA sentiasa menjadi topik hangat dalam penyelidikan penyakit, dan berkait rapat dengan ekspresi gen dan sifat fenotip.RRBS ialah kaedah yang tepat, cekap dan menjimatkan untuk penyelidikan metilasi DNA.Pengayaan kawasan pulau promoter dan CpG oleh belahan enzimatik (Msp I), digabungkan dengan penjujukan Bisulfit, menyediakan pengesanan metilasi DNA resolusi tinggi.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
