-
טשראָמאַטין יממונאָפּרעסיפּיטאַטיאָן סיקוואַנסינג (ChIP-seq)
טשיפּ-סעק גיט גענאָמע-ברייט פּראָפילינג פון דנאַ טאַרגאַץ פֿאַר היסטאָנע מאָדיפיקאַטיאָן, טראַנסקריפּציע סיבות און אנדערע דנאַ-פארבונדן פּראָטעינס.עס קאַמביינז די סעלעקטיוויטי פון טשראָמאַטין ימיונאָ-אָפּזאַץ (טשיפּ) צו צוריקקריגן ספּעציפיש פּראָטעין-דנאַ קאַמפּלעקסאַז, מיט די מאַכט פון ווייַטער-דור סיקוואַנסינג (NGS) פֿאַר הויך-טרופּוט סיקוואַנסינג פון די ריקאַווערד דנאַ.דערצו, ווייַל די פּראָטעין-דנאַ קאַמפּלעקסאַז זענען ריקאַווערד פון לעבעדיק סעלז, ביינדינג זייטלעך קענען זיין קאַמפּערד אין פאַרשידענע צעל טייפּס און געוועבן אָדער אונטער פאַרשידענע טנאָים.אַפּפּליקאַטיאָנס קייט פון טראַנסקריפּציע רעגולירן צו אַנטוויקלונג פּאַטווייז צו קרענק מעקאַניזאַמז און ווייַטער.
פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq 6000
-
גאַנץ גענאָמע ביסולפיטע סיקוואַנסינג
דנאַ מעטהילאַטיאָן אין די פינפט שטעלע אין סיטאָסין (5-MC) האט אַ פונדאַמענטאַל השפּעה אויף דזשין אויסדרוק און סעליאַלער טעטיקייט.אַבנאָרמאַל מעטהילאַטיאָן פּאַטערנז זענען פארבונדן מיט עטלעכע באדינגונגען און חולאתן, אַזאַ ווי ראַק.WGBS איז געווארן דער גאָלד סטאַנדאַרט פֿאַר לערנען גענאָמע-ברייט מעטהילאַטיאָן אין איין באַזע האַכלאָטע.
פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq6000
-
אַססייַ פֿאַר טראַנספּאָסאַסע-אַקסעסאַבאַל טשראָמאַטין מיט הויך טרופּוט סיקוואַנסינג (ATAC-seq)
ATAC-seq איז אַ הויך-טראַפּוט סיקוואַנסינג אופֿן פֿאַר אַנאַליסיס פון גענאָמע-ברייט טשראָמאַטין אַקסעסאַביליטי, וואָס איז וויכטיק פֿאַר גלאבאלע עפּיגענעטיק קאָנטראָל פון דזשין אויסדרוק.סיקוואַנסינג אַדאַפּטערז זענען ינסערטאַד אין עפענען טשראָמאַטין מקומות דורך כייפּעראַקטיווע Tn5 טראַנספּאָסאַסע.נאָך פּקר אַמפּלאַפאַקיישאַן, אַ סיקוואַנסינג ביבליאָטעק איז קאַנסטראַקטאַד.אַלע די עפענען טשראָמאַטין מקומות קענען זיין באקומען אונטער אַ ספּעציפיש פּלאַץ-צייט צושטאַנד, ניט בלויז לימיטעד צו די ביינדינג זייטלעך פון אַ טראַנסקריפּציע פאַקטאָר, אָדער אַ זיכער היסטאָנע מאַדאַפייד געגנט.
-
רידוסט פאַרטרעטונג ביסולפיטע סיקוואַנסינג (RRBS)
דנאַ מעטהילאַטיאָן פאָרשונג איז שטענדיק געווען אַ הייס טעמע אין קרענק פאָרשונג, און איז ענג שייַכות צו דזשין אויסדרוק און פענאָ-טיפּיש טרייץ.RRBS איז אַן פּינטלעך, עפעקטיוו און שפּאָרעוודיק אופֿן פֿאַר דנאַ מעטהילאַטיאָן פאָרשונג.ענריטשמענט פון פּראָמאָטער און קפּג אינזל מקומות דורך ענזימאַטיק קלעאַוואַגע (Msp I), קאַמביינד מיט ביסולפיטע סיקוואַנסינג, גיט הויך האַכלאָטע דנאַ מעטהילאַטיאָן דיטעקשאַן.
פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq 6000
