-
Секвенування імунопреципітації хроматину (ChIP-seq)
ChIP-Seq забезпечує профільування ДНК-мішеней у всьому геномі для модифікації гістонів, факторів транскрипції та інших білків, асоційованих з ДНК.Він поєднує в собі селективність імунопреципітації хроматину (ChIP) для відновлення специфічних комплексів білок-ДНК з потужністю секвенування наступного покоління (NGS) для високопродуктивного секвенування відновленої ДНК.Крім того, оскільки комплекси білок-ДНК відновлюються з живих клітин, сайти зв’язування можна порівнювати в різних типах клітин і тканинах або в різних умовах.Застосування варіюються від регуляції транскрипції до шляхів розвитку до механізмів захворювання і далі.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Секвенування бісульфіту всього геному
Метилування ДНК на п’ятій позиції в цитозині (5-mC) має фундаментальний вплив на експресію генів і клітинну активність.Аномальні моделі метилювання були пов’язані з кількома станами та захворюваннями, такими як рак.WGBS став золотим стандартом для вивчення метилювання всього геному з роздільною здатністю однієї основи.
Платформа: Illumina NovaSeq6000
-
Аналіз хроматину, доступного для транспозази, із високопродуктивним секвенуванням (ATAC-seq)
ATAC-seq — це високопродуктивний метод секвенування для аналізу доступності хроматину в усьому геномі, що важливо для глобального епігенетичного контролю експресії генів.Адаптери для секвенування вставляють у відкриті ділянки хроматину за допомогою гіперактивної транспозази Tn5.Після ампліфікації ПЛР створюється бібліотека секвенування.Усі відкриті ділянки хроматину можуть бути отримані за певних умов простору-часу, а не лише обмежуючись сайтами зв’язування транскрипційного фактора або певної модифікованої гістоном області.
-
Секвенування бісульфіту зі зниженим представництвом (RRBS)
Дослідження метилювання ДНК завжди були гарячою темою в дослідженнях хвороб і тісно пов’язані з експресією генів і фенотиповими ознаками.RRBS – точний, ефективний та економічний метод дослідження метилювання ДНК.Збагачення промоторних та CpG-острівкових ділянок шляхом ферментативного розщеплення (Msp I) у поєднанні з бісульфітним секвенуванням забезпечує виявлення метилювання ДНК високої роздільної здатності.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
