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Sequenza di immunoprecipitazione di cromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq furnisce una profilazione genomica di i target di DNA per a modificazione di l'istone, fattori di trascrizione, è altre proteine associate à l'ADN.Unisce a selettività di l'immuno-precipitazione di cromatina (ChIP) per ricuperà complexi specifici di proteina-DNA, cù u putere di a sequenza di a prossima generazione (NGS) per a sequencing high-throughput di l'ADN recuperatu.Inoltre, perchè i cumplessi di proteina-DNA sò recuperati da e cellule viventi, i siti di ubligatoriu ponu esse paragunati in diversi tipi di cellule è tessuti, o in diverse cundizioni.L'applicazioni varienu da a regulazione trascrizionale à i percorsi di sviluppu à i meccanismi di a malatia è oltre.
Piattaforma: Illumina NovaSeq 6000
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Sequenza di bisulfite di u genoma tutale
A metilazione di l'ADN in a quinta pusizione in a citosina (5-mC) hà una influenza fundamentale nantu à l'espressione genica è l'attività cellulare.I mudelli anormali di metilazione sò stati assuciati cù parechje cundizioni è malatie, cum'è u cancer.WGBS hè diventatu u standard d'oru per studià a metilazione in tuttu u genoma à una risoluzione di basa unica.
Piattaforma: Illumina NovaSeq6000
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Assai per a cromatina accessibile à a transposasi cù sequenziamentu à altu rendimentu (ATAC-seq)
ATAC-seq hè un metudu di sequencing high-throughput per l'analisi di l'accessibilità di cromatina in tuttu u genoma, chì hè impurtante per u cuntrollu epigeneticu globale di l'espressione genica.L'adattatori di sequenza sò inseriti in regioni di cromatina aperte da a transposase Tn5 iperattiva.Dopu l'amplificazione PCR, una biblioteca di sequenza hè custruita.Tutte e regioni di cromatina aperta ponu esse ottenute in una cundizione specifica di u spaziu-tempu, micca solu limitatu à i siti di ubligatoriu di un fattore di trascrizione, o una certa regione mudificata di histona.
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Sequenza di bisulfite à rappresentazione ridotta (RRBS)
A ricerca di metilazione di l'ADN hè sempre stata un tema caldu in a ricerca di e malatie, è hè strettamente ligata à l'espressione genica è e caratteristiche fenotipiche.RRBS hè un metudu precisu, efficiente è ecunomicu per a ricerca di metilazione di DNA.L'arricchimentu di u promotore è di e regioni insulari CpG per clivaggio enzimaticu (Msp I), cumminatu cù sequencing Bisulfite, furnisce a rilevazione di metilazione di DNA à alta risoluzione.
Piattaforma: Illumina NovaSeq 6000
