-
Хроматин дархлалын тунадасжилтын дараалал (ChIP-seq)
ChIP-Seq нь гистоны өөрчлөлт, транскрипцийн хүчин зүйлс болон ДНХ-тэй холбоотой бусад уургийн ДНХ-ийн зорилтот геномын өргөн хүрээний профайлыг өгдөг.Энэ нь тодорхой уураг-ДНХ-ийн цогцолборыг сэргээхэд хроматин дархлалын тунадасжилтын (ChIP) сонгомол чанарыг нэгтгэж, сэргээгдсэн ДНХ-ийн өндөр дамжуулалттай дараалал тогтоох дараагийн үеийн дарааллын (NGS) хүчин чадалтай.Нэмж дурдахад, уураг-ДНХ-ийн цогцолборууд нь амьд эсээс сэргээгддэг тул холбогдох газруудыг янз бүрийн эсийн төрөл, эд эс эсвэл өөр өөр нөхцөлд харьцуулж болно.Програмууд нь транскрипцийн зохицуулалтаас эхлээд хөгжлийн зам, өвчний механизм, цаашлаад олон янз байдаг.
Платформ: Illumina NovaSeq 6000
-
Бисульфитын бүхэл геномын дараалал
Цитозины (5-mC) тав дахь байрлал дахь ДНХ-ийн метилизаци нь генийн илэрхийлэл, эсийн идэвхжилд үндсэн нөлөө үзүүлдэг.Хэвийн бус метиляци нь хорт хавдар гэх мэт хэд хэдэн нөхцөл, өвчинтэй холбоотой байдаг.WGBS нь нэг суурь нарийвчлалтайгаар геномын хэмжээнд метилжилтийг судлах алтан стандарт болсон.
Платформ: Illumina NovaSeq6000
-
Өндөр дамжуулалттай дараалал бүхий транспозазын хүртээмжтэй хроматины шинжилгээ (ATAC-seq)
ATAC-seq нь генийн илэрхийлэлд дэлхийн эпигенетик хяналт тавихад чухал ач холбогдолтой геномын өргөн хроматин хүртээмжийг шинжлэх өндөр үр дүнтэй дарааллын арга юм.Хэт идэвхтэй Tn5 транспозазын тусламжтайгаар дараалсан адаптеруудыг нээлттэй хроматин бүсэд оруулдаг.ПГУ-ын олшруулсны дараа дарааллын номын сан байгуулна.Бүх нээлттэй хроматин бүсүүдийг зөвхөн транскрипцийн хүчин зүйл, эсвэл тодорхой гистоныг өөрчилсөн бүс нутгийг холбосон газруудаар хязгаарлагдахгүй, тодорхой орон зай-цаг хугацааны нөхцөлд олж авч болно.
-
Багасгасан төлөөллийн бисульфит дараалал (RRBS)
ДНХ-ийн метилжилтийн судалгаа нь өвчний судалгааны хамгийн чухал сэдэв байсаар ирсэн бөгөөд генийн илэрхийлэл, фенотипийн шинж чанаруудтай нягт холбоотой байдаг.RRBS нь ДНХ-ийн метилжилтийн судалгааны үнэн зөв, үр ашигтай, хэмнэлттэй арга юм.Промотор болон CpG арлын бүс нутгийг ферментийн задралаар (Msp I) баяжуулж, бисульфитын дараалалтай хослуулснаар ДНХ-ийн метилжилтийг өндөр нарийвчлалтай илрүүлдэг.
Платформ: Illumina NovaSeq 6000
