-
BMKMANU S3000_Transcriptoma espacial
A transcriptómica espacial é unha técnica que nos permite capturar e visualizar a expresión xénica dentro dos tecidos. Isto pode ser crucial para comprender como interactúan as células.
Existen diferentes plataformas para esta abordaxe. Neste sentido, BMKGene desenvolveu o chip de transcriptoma espacial BMKManu 3000, unha plataforma que mellora o rendemento da técnica, alcanzando unha resolución subcelular e permitindo unha configuración de resolución multinivel.
Este chip contén 4,2 millóns de manchas empregando unha tecnoloxía patentada de micropozos en capas con esferas cargadas con sondas con código de barras espacial. Con este método, despois da captura e amplificación, obtemos unha biblioteca de ADNc enriquecida coas mostras con código de barras que é compatible con Illumina.
En canto aos datos, a combinación de códigos de barras espaciais e UMI garante a precisión e especificidade dos datos xerados. Combinando todo o anterior, BMKManu proporciona un conxunto de datos extremadamente versátil.
-
Secuenciación de ARN de núcleo único
O desenvolvemento de técnicas de captura de células individuais e construción de bibliotecas personalizadas, xunto coa secuenciación de alto rendemento, revolucionou os estudos da expresión xénica a nivel celular. Este avance permite unha análise máis profunda e completa de poboacións celulares complexas, superando as limitacións asociadas coa media da expresión xénica en todas as células e preservando a verdadeira heteroxeneidade dentro destas poboacións. Aínda que a secuenciación de ARN unicelular (scRNA-seq) ten vantaxes innegables, atopa desafíos en certos tecidos onde a creación dunha suspensión unicelular resulta difícil e require mostras frescas. En BMKGene, abordamos este obstáculo ofrecendo secuenciación de ARN de núcleo único (snRNA-seq) utilizando a tecnoloxía de vangarda 10X Genomics Chromium. Esta abordaxe amplía o espectro de mostras susceptibles de análise do transcriptoma a nivel unicelular.
O illamento de núcleos realízase mediante o innovador chip 10X Genomics Chromium, que presenta un sistema microfluídico de oito canles con dobres cruces. Dentro deste sistema, as esferas de xel que incorporan códigos de barras, cebadores, encimas e un só núcleo encápsulanse en pingas de aceite do tamaño de nanolitros, formando esferas de xel en emulsión (GEM). Tras a formación do GEM, prodúcese a lise celular e a liberación do código de barras dentro de cada GEM. Posteriormente, as moléculas de ARNm sofren unha transcrición inversa en ADNc, incorporando códigos de barras 10X e identificadores moleculares únicos (UMI). Estes ADNc sométense entón á construción dunha biblioteca de secuenciación estándar, o que facilita unha exploración robusta e completa dos perfís de expresión xénica a nivel unicelular.
Plataforma: 10× Plataforma Xenómica de Cromo e Illumina NovaSeq
