-
BMKMANU S3000_Transkriptom Spasial
Transkriptomik spasial minangka teknik sing ngidini kita nangkep lan nggambarake ekspresi gen ing jaringan. Iki penting banget kanggo mangerteni kepiye sel sesambungan.
Ana macem-macem platform kanggo pendekatan iki. Babagan iki, BMKGene wis ngembangake Chip transkriptom spasial BMKManu 3000, platform sing ningkatake kinerja teknik, nggayuh resolusi subselular lan ngaktifake setelan resolusi multi-level.
Chip iki ngemot 4,2 yuta titik nggunakake teknologi microwell sing dipatenake sing dilapisi manik-manik sing diisi probe barcode spasial. Kanthi metode iki, sawise penangkapan lan amplifikasi, kita entuk perpustakaan cDNA sing diperkaya karo sampel barcode sing kompatibel karo Illumina.
Ing data kasebut, kombinasi barcode spasial lan UMI njamin akurasi lan spesifisitas data sing diasilake. Nggabungake kabeh ing ndhuwur, BMKManu nyedhiyakake setelan data sing serbaguna banget.
-
Urutan RNA inti tunggal
Pangembangan teknik penangkapan sel tunggal lan konstruksi perpustakaan khusus, digabungake karo sekuensing throughput dhuwur, wis ngrevolusi studi ekspresi gen ing tingkat sel. Terobosan iki ngidini analisis populasi sel sing kompleks sing luwih jero lan luwih lengkap, ngatasi watesan sing ana gandhengane karo rata-rata ekspresi gen ing kabeh sel lan njaga heterogenitas sejati ing populasi kasebut. Nalika sekuensing RNA sel tunggal (scRNA-seq) nduweni kaluwihan sing ora bisa dipungkiri, nanging nemoni tantangan ing jaringan tartamtu ing ngendi nggawe suspensi sel tunggal mbuktekake angel lan mbutuhake sampel seger. Ing BMKGene, kita ngatasi alangan iki kanthi nawakake sekuensing RNA inti tunggal (snRNA-seq) nggunakake teknologi 10X Genomics Chromium sing paling canggih. Pendekatan iki ngembangake spektrum sampel sing bisa digunakake kanggo analisis transkriptom ing tingkat sel tunggal.
Isolasi inti ditindakake liwat chip 10X Genomics Chromium sing inovatif, sing nduweni sistem mikrofluidika wolung saluran kanthi persilangan ganda. Ing sistem iki, manik-manik gel sing nggabungake barcode, primer, enzim, lan inti tunggal dienkapsulasi ing tetes minyak ukuran nanoliter, mbentuk Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Sawise pembentukan GEM, lisis sel lan pelepasan barcode kedadeyan ing saben GEM. Sabanjure, molekul mRNA ngalami transkripsi terbalik dadi cDNA, nggabungake barcode 10X lan Unique Molecular Identifiers (UMI). cDNA iki banjur ditindakake konstruksi perpustakaan sekuensing standar, sing nggampangake eksplorasi profil ekspresi gen sing kuat lan komprehensif ing tingkat sel tunggal.
Platform: 10× Genomics Chromium lan Platform Illumina NovaSeq
