-
BMKMANU S3000_Transkriptoma Fezayî
Transkrîptomîkên fezayî teknîkek e ku dihêle em îfadeya genan di nav tevnvîsan de bigirin û dîtbarî bikin. Ev dikare ji bo fêmkirina ka hucre çawa bi hev re têkilî datînin girîng be.
Ji bo vê rêbazê platformên cûda hene. Di vê mijarê de, BMKGene Çîpa transkrîptomê ya Spatial BMKManu 3000 pêşxistiye, platformek e ku performansa teknîkê zêde dike, digihîje çareseriya binhucreyî û mîhenga çareseriya pir-astî çalak dike.
Ev çîp 4.2 milyon xalan bi karanîna teknolojiyeke patentkirî ya mîkroçalan dorpêç dike ku bi morîkên ku bi probên barkodkirî yên cîhî barkirî ne, hatine qatkirin. Bi vê rêbazê, piştî girtin û zêdekirinê, em pirtûkxaneyek cDNA-yê bi nimûneyên barkodkirî dewlemend dikin ku bi Illumina-yê re hevaheng e û bi dest dixin.
Li ser daneyan, têkelbûna barkodên fezayî û UMIyan rastbûn û taybetmendiya daneyên çêkirî misoger dike. Bi hevgirtina hemû jorîn, BMKManu mîhengek daneyan a piralî peyda dike.
-
Rêzkirina RNA-ya yek-nukleî
Pêşxistina teknîkên girtina şaneyên yekane û avakirina pirtûkxaneyên xwerû, digel rêzkirina bi rêjeya bilind, lêkolînên îfadeya genan di asta şaneyan de şoreşek çêkiriye. Ev pêşketin rê dide analîzek kûrtir û berfirehtir a nifûsên şaneyên tevlihev, derbaskirina sînorkirinên têkildarî navînîkirina îfadeya genan li ser hemî şaneyan û parastina nehevsengiya rastîn di nav van nifûsan de. Her çend rêzkirina RNA ya şaneyên yekane (scRNA-seq) xwedî avantajên nayên înkarkirin be jî, ew di hin tevnên ku çêkirina rawestandina şaneyên yekane dijwar dibe û hewceyê nimûneyên nû ye, rastî dijwarîyan tê. Li BMKGene, em vê astengiyê bi pêşkêşkirina rêzkirina RNA ya navokî ya yekane (snRNA-seq) bi karanîna teknolojiya Chromium a 10X Genomics ya herî pêşkeftî çareser dikin. Ev nêzîkatî spektruma nimûneyên ku ji bo analîza transkrîptomê di asta şaneyên yekane de maqûl in fireh dike.
Veqetandina navokan bi rêya çîpa nûjen a 10X Genomics Chromium tê kirin, ku pergaleke mîkrofluîdîk a heşt-kanal bi xaçkirinên ducarî vedihewîne. Di vê pergalê de, morîkên jel ên ku barkod, primer, enzîm û navokek yekane dihewînin, di dilopên rûnê yên bi qasî nanolîtreyan de têne kapsul kirin, û Morîkên Gel-di-Emulsiyonê (GEM) de çêdikin. Piştî avakirina GEM, di her GEM de lîza şaneyê û berdana barkodê çêdibe. Piştre, molekulên mRNA ji bo cDNAyan transkrîpsiyona berevajî derbas dibin, ku barkodên 10X û Nasnameyên Molekulî yên Bêhempa (UMI) dihewînin. Dûv re ev cDNA ji bo avakirina pirtûkxaneya rêzkirina standard têne derbas kirin, ku lêkolînek xurt û berfireh a profîlên îfadeya genan di asta şaneya yekane de hêsan dike.
Platform: 10× Genomics Chromium û Platforma Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transscriptome
Transkriptomîka cîhî teknolojiyeke pêşketî ye ku rê dide lêkolîneran ku şêwazên îfadeya genan di nav tevnvîsan de lêkolîn bikin di heman demê de çarçoveya wan a cîhî biparêzin. Platformeke bihêz di vê qadê de 10x Genomics Visium e ku bi rêzkirina Illumina ve girêdayî ye. Prensîba 10X Visium li ser çîpeke taybetî ye ku deverek girtinê ya diyarkirî heye ku beşên tevnvîsan lê têne danîn. Ev dever xalên barkodkirî dihewîne, her yek bi cihekî cîhî yê bêhempa di nav tevnvîsê de re têkildar e. Molekulên RNA yên ji tevnvîsê hatine girtin dûv re di dema pêvajoya transkrîpsiyona berevajî de bi nasnameyên molekulî yên bêhempa (UMI) têne nîşankirin. Ev xalên barkodkirî û UMI nexşeya cîhî ya rast û hejmartina îfadeya genan di çareseriyek yek-hucreyî de gengaz dikin. Têkeliya nimûneyên barkodkirî yên cîhî û UMI rastbûn û taybetmendiya daneyên çêkirî misoger dike. Bi karanîna vê teknolojiya Transcriptomîkên Cîhanî, lêkolîner dikarin têgihîştineke kûrtir a rêxistina cîhî ya şaneyan û têkiliyên molekulî yên tevlihev ên ku di nav tevnvîsan de çêdibin bi dest bixin, û têgihiştinên bêqîmet li ser mekanîzmayên bingehîn ên pêvajoyên biyolojîkî di gelek waran de, di nav de onkolojî, neurozanistî, biyolojiya pêşkeftinê, îmmunolojî û lêkolînên botanîkî pêşkêş dikin.
Platform: 10X Genomics Visium û Illumina NovaSeq
