-
Поўнапамернае секвенаванне мРНК-Nanopore
Секвенаванне РНК было неацэнным інструментам для ўсебаковага аналізу транскрыптам.Безумоўна, традыцыйная паслядоўнасць кароткага чытання дасягнула тут шматлікіх важных падзей.Тым не менш, ён часта сутыкаецца з абмежаваннямі ў ідэнтыфікацыі поўнаметражных изоформ, колькасным вызначэнні, зрушэнні ПЦР.
Секвенаванне нанапор адрознівае сябе ад іншых платформ секвеніравання тым, што нуклеатыды счытваюцца непасрэдна без сінтэзу ДНК і генеруе доўгае чытанне ў дзясятках кілабазаў.Гэта дае магчымасць непасрэднага счытвання скрыжавання поўнаметражных стэнаграм і вырашэння праблем у даследаваннях на ўзроўні ізаформ.
Платформа:Nanopore PromethION
Бібліятэка:кДНК-ПЦР
-
De novo Поўнаметражнае секвенаванне транскрыптамаў -PacBio
Нановапоўнаметражнае секвенаванне транскрыптамаў, таксама вядомае якНановаIso-Seq выкарыстоўвае перавагі секвенсора PacBio у даўжыні счытвання, што дазваляе секвенаваць поўнаметражныя малекулы кДНК без якіх-небудзь перапынкаў.Гэта цалкам дазваляе пазбегнуць памылак, якія ўзнікаюць на этапах зборкі транскрыптаў, і стварае ўнігенныя наборы з раздзяленнем на ўзроўні ізаформ.Гэтыя ўнігенныя наборы забяспечваюць магутную генетычную інфармацыю ў якасці «эталоннага геному» на ўзроўні транскрыптому.Акрамя таго, у спалучэнні з дадзенымі паслядоўнасці наступнага пакалення, гэтая паслуга дае магчымасць дакладнай колькаснай ацэнкі выказвання на ўзроўні ізаформы.
Платформа: PacBio Sequel IIБібліятэка: SMRT bell library -
Секвенаванне мРНК эукарыётаў-Illumina
Секвенаванне мРНК дазваляе прафіляваць усе мРНК, транскрыпаваныя з клетак у пэўных умовах.Гэта магутная тэхналогія для выяўлення профілю экспрэсіі генаў, генных структур і малекулярных механізмаў пэўных біялагічных працэсаў.На сённяшні дзень секвенирование мРНК шырока выкарыстоўваецца ў фундаментальных даследаваннях, клінічнай дыягностыцы, распрацоўцы лекавых сродкаў і г.д.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Нерэферэнтнае секвенаванне мРНК-Illumina
Секвенаванне мРНК прымае тэхніку секвенавання наступнага пакалення (NGS) для захопу інфармацыйнай РНК (мРНК) формы эукарыёт у пэўны перыяд, калі некаторыя спецыяльныя функцыі актывуюцца.Самая доўгая транскрыпцыя, якая зрошчваецца, называлася «Unigene» і выкарыстоўвалася ў якасці эталоннай паслядоўнасці для наступнага аналізу, які з'яўляецца эфектыўным сродкам для вывучэння малекулярнага механізму і рэгулятарнай сеткі віду без спасылкі.
Пасля зборкі дадзеных транскрыптам і функцыянальнай анатацыі Unigene
(1) Аналіз SNP, аналіз SSR, прадказанне CDS і структура гена будуць выкананы.
(2) Будзе праводзіцца колькасная ацэнка экспрэсіі унігена ў кожным узоры.
(3) Дыферэнцыяльна выяўленыя унігены паміж узорамі (або групамі) будуць выяўленыя на аснове ўнігеннай экспрэсіі
(4) Будуць выкананы кластарызацыя, функцыянальная анатацыя і аналіз узбагачэння дыферэнцыяльна выяўленых унігенаў
-
Доўгае некадавальнае секвенаванне-Illumina
Доўгія некадуючыя РНК (lncRNAs) — тып малекул РНК з даўжынёй больш за 200 нт, якія характарызуюцца надзвычай нізкім патэнцыялам кадавання.LncRNA, як ключавы член некадуючых РНК, у асноўным знаходзіцца ў ядры і плазме.Развіццё тэхналогіі секвенавання і біяінфармацыі дазваляе ідэнтыфікаваць мноства новых lncRNA і звязаць іх з біялагічнымі функцыямі.Назапашаныя дадзеныя сведчаць аб тым, што lncRNA шырока ўдзельнічае ў эпігенетычнай рэгуляцыі, рэгуляцыі транскрыпцыі і рэгуляцыі пасля транскрыпцыі.
-
Секвенаванне малых РНК-Illumina
Маленькая РНК адносіцца да класа некадуючых малекул РНК, даўжыня якіх звычайна менш за 200 нт, уключаючы мікраРНК (міРНК), малую інтэрферэнцыйную РНК (miRNA) і РНК, якая ўзаемадзейнічае з piwi (piRNA).
МікраРНК (miRNA) - гэта клас эндагеннай малой РНК даўжынёй каля 20-24 нт, якая выконвае розныя важныя рэгулятарныя ролі ў клетках.микроРНК ўдзельнічае ў шматлікіх жыццёвых працэсах, якія выяўляюць спецыфічную экспрэсію тканін і стадыйную экспрэсію і вельмі кансерваваную ў розных відаў.
-
секвеніраванне circRNA-Illumina
Секвенаванне ўсяго транскрыпту прызначана для профілювання ўсіх тыпаў малекул РНК, у тым ліку кадуючых (мРНК) і некадуючых РНК (уключаючы lncRNA, circRNA і miRNA), якія транскрыбуюцца пэўнымі клеткамі ў пэўны час.Секвенаванне цэлага транскрыпта, таксама вядомае як «поўнае секвенаванне РНК», накіравана на выяўленне ўсёабдымных рэгулятарных сетак на ўзроўні транскрыптамаў.Выкарыстоўваючы перавагі тэхналогіі NGS, паслядоўнасці цэлых прадуктаў транскрыпту даступныя для аналізу ceRNA і сумеснага аналізу РНК, што забяспечвае першы крок да функцыянальнай характарыстыкі.Выяўленне рэгулятарнай сеткі цеРНК на аснове циркРНК-миРНК-мРНК.
-
Секвенаванне ўсёй транскрыптам - Illumina
Секвенаванне ўсяго транскрыпту прызначана для профілювання ўсіх тыпаў малекул РНК, у тым ліку кадуючых (мРНК) і некадуючых РНК (уключаючы lncRNA, circRNA і miRNA), якія транскрыбуюцца пэўнымі клеткамі ў пэўны час.Секвенаванне цэлага транскрыпта, таксама вядомае як «поўнае секвенаванне РНК», накіравана на выяўленне ўсёабдымных рэгулятарных сетак на ўзроўні транскрыптамаў.Выкарыстоўваючы перавагі тэхналогіі NGS, паслядоўнасці цэлых прадуктаў транскрыпту даступныя для аналізу ceRNA і сумеснага аналізу РНК, што забяспечвае першы крок да функцыянальнай характарыстыкі.Выяўленне рэгулятарнай сеткі цеРНК на аснове циркРНК-миРНК-мРНК.
-
Секвенаванне РНК пракарыётаў
Секвенаванне РНК пракарыётаў выкарыстоўвае секвенаванне наступнага пакалення (NGS), каб выявіць наяўнасць і колькасць РНК у дадзены момант, аналізуючы зменлівы клеткавы транскриптом.Секвенаванне пракарыётнай РНК нашай кампаніі, у прыватнасці, накіравана на пракарыёт з эталонным геномам, забяспечваючы вам прафіляванне транскрыптам, аналіз структуры генаў і г.д. Яно шырока ўжывалася ў фундаментальных навуковых даследаваннях, даследаваннях і распрацоўках лекавых сродкаў і многае іншае.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Секвенаванне метатранскриптома
Секвенаванне метатранскриптома вызначае экспрэсію генаў мікробаў (як эўкарыёт, так і пракарыёт) у прыродным асяроддзі (напрыклад, у глебе, вадзе, моры, фекаліях і кішачніку). У прыватнасці, гэтыя паслугі дазваляюць атрымаць поўнае прафіляванне экспрэсіі генаў складаных мікробных супольнасцяў, таксанамічны аналіз відаў, аналіз функцыянальнага ўзбагачэння па-рознаму экспрэсаваных генаў і інш.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
