条形banner-03

Produkter

Liten RNA-sekvensering-Illumina

Små RNA (sRNA)-molekyler inkluderer mikroRNA (miRNA), små interfererende RNA (siRNA) og piwi-interagerende RNA (piRNA). Blant disse er miRNA-er, rundt 18-25 nukleotider lange, spesielt bemerkelsesverdige for deres sentrale regulatoriske roller i forskjellige cellulære prosesser. Med vevsspesifikke og scenespesifikke uttrykksmønstre viser miRNA høy bevaring på tvers av forskjellige arter.

Plattform: Illumina NovaSeq


Tjenestedetaljer

Bioinformatikk

Demo resultater

Utvalgte publikasjoner

Funksjoner

● Bibliotekforberedelse inkluderer et trinn for valg av størrelse

● Bioinformatisk analyse sentrert rundt miRNA-prediksjon og deres mål

Tjenestefordeler

Omfattende bioinformatikkanalyse:Muliggjør identifikasjon av både kjente og nye miRNA-er, identifikasjon av miRNA-mål og tilsvarende funksjonell merknad og berikelse med flere databaser (KEGG, GO)

Streng kvalitetskontroll: Vi implementerer kjernekontrollpunkter på tvers av alle stadier, fra prøve- og bibliotekforberedelse til sekvensering og bioinformatikk. Denne grundige overvåkingen sikrer levering av konsekvent høykvalitetsresultater.

Support etter salg: Vårt engasjement strekker seg utover prosjektgjennomføring med en 3-måneders ettersalgsserviceperiode. I løpet av denne tiden tilbyr vi prosjektoppfølging, feilsøkingshjelp og spørsmål og svar-økter for å løse eventuelle spørsmål knyttet til resultatene.

Omfattende kompetanse: Med en merittliste for vellykket lukking av flere sRNA-prosjekter som dekker over 300 arter i ulike forskningsdomener, bringer teamet vårt et vell av erfaring til hvert prosjekt.

Prøvekrav og levering

Bibliotek

Plattform

Anbefalte data

Data QC

Størrelse valgt

Illumina SE50

10M-20M avlesninger

Q30≥85 %

Eksempelkrav:

Nukleotider:

Kons.(ng/μl)

Mengde (μg)

Renhet

Integritet

≥ 80

≥ 0,8

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Begrenset eller ingen protein- eller DNA-kontaminering vist på gel.

RIN≥6,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

begrenset eller ingen grunnlinjehøyde

● Planter:

Rot, stilk eller kronblad: 450 mg

Blad eller frø: 300 mg

Frukt: 1,2 g

● Dyr:

Hjerte eller tarm: 450 mg

Innvoller eller hjerne: 240 mg

Muskel: 600 mg

Bein, hår eller hud: 1,5 g

● Leddyr:

Insekter: 9g

Krepsdyr: 450 mg

● Fullblod: 2 rør

● Celler: 106 celler

● Serum og plasma:6 ml

Anbefalt prøvelevering

Beholder: 2 ml sentrifugerør (tinnfolie anbefales ikke)

Prøvemerking: Gruppe+replikat f.eks. A1, A2, A3; B1, B2, B3.

Forsendelse:

1. Tørris: Prøver må pakkes i poser og begraves i tørris.

2. RNAstabile rør: RNA-prøver kan tørkes i RNA-stabiliseringsrør (f.eks. RNAstable®) og sendes i romtemperatur.

Servicearbeidsflyt

Prøve QC

Eksperimentdesign

prøvelevering

Prøvelevering

Piloteksperiment

RNA-ekstraksjon

Bibliotekforberedelse

Bygging av bibliotek

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Ettersalgstjenester

Ettersalgstjenester


  • Tidligere:
  • Neste:

  • Bioinformatikk

    wps_doc_14● Kvalitetskontroll av rådata

    ● sRNA-klassifisering

    ● Justering til et referansegenom

    ● Identifikasjon av kjent og ny miRNA

    ● Differensiell miRNA-ekspresjonsanalyse

    ● Funksjonell merknad av miRNA-mål

    Identifikasjon av miRNA: struktur og dybde

     

     

     miRNA-forløper-struktur-og-sekvenseringsdybde

     

    Differensielt uttrykk for miRNA - hierarkisk clustering

     

     

    图片34

     

    Funksjonell annotering av mål for differensielt uttrykte miRNAer

     

     

    图片35

    Utforsk forskningsfremskritt tilrettelagt av BMKGene sine sRNA-sekvenseringstjenester gjennom en kuratert samling av publikasjoner.

      

    Chen, H. et al. (2023) 'Virale infeksjoner hemmer saponinbiosyntese og fotosyntese i Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, s. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.

    Li, H. et al. (2023) 'Anlegget FYVE-domeneholdig protein FREE1 assosieres med mikroprosessorkomponenter for å undertrykke miRNA-biogenese', rapporterer EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.

    Yu, J. et al. (2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p kontrollerer utviklingen av larvepuppe ved å målrette mot flere epidermale vekstfaktorlignende domener 8-genet (megf8) i honningbien, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), s. . 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.

    Zhang, M. et al. (2018) 'Integrert analyse av MiRNA og gener assosiert med kjøttkvalitet avslører at Gga-MiR-140-5p påvirker intramuskulær fettavsetning hos kyllinger', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), s. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.

    få et tilbud

    Skriv din melding her og send den til oss

    Send din melding til oss: