BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Soppgenom

Biomarker Technologies gir genomundersøkelse, fint genom og pene-komplett genom av sopp avhengig av spesifikke forskningsmål.Genomsekvensering, montering og funksjonell annotering kan oppnås ved å kombinere neste generasjons sekvensering + tredje generasjons sekvensering for å oppnå genomsamling på høyt nivå.Hi-C-teknologi kan også brukes for å lette genomsamling på kromosomnivå.

Plattform:PacBio oppfølger II

Nanopore PromethION P48

Illumina NovaSeq-plattformen


Tjenestedetaljer

Demo resultater

Tjenestefordeler

● Flere sekvenseringsstrategier tilgjengelig for ulike forskningsmål

● Svært erfaren i soppgenomsamling med over 10 000 pene-komplette genom satt sammen.

● Profesjonelt ettersalgs teknisk supportteam som oppfyller mer spesifikke forskningsbehov.

Tjenestespesifikasjoner

Service

Sekvenseringsstrategi

Kvalitet garantert

Beregnet behandlingstid

Soppfinkart

Illumina 50X+Nanopore 100X

Contig N50≥2 Mb

35 virkedager

PacBio HiFi 30X

Fungal pene-komplett kart

Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X

Kromosom forankringsforhold >90 %

45 virkedager

Bioinformatikkanalyser

● Kvalitetskontroll av rådata

● Genomsamling

● Genomkomponentanalyse

● Annotering av genfunksjon

● Komparativ genomisk analyse

2

Prøvekrav og levering

Eksempelkrav:

TilDNA-ekstrakter:

Eksempeltype

Beløp

Konsentrasjon

Renhet

DNA-ekstrakter

> 1,2 μg

> 20 ng/μl

OD260/280= 1,6-2,5

For vevsprøver:

Prøvetype Anbefalt prøvebehandling Prøvelagring og forsendelse
Encellet sopp Observer gjær under mikroskop og samle dem i eksponentiell fase

Overfør kulturen (som inneholder ca. 3-4.5e9 celler) til en 1,5 eller 2 ml eppendorf.(Hold deg på is)

Sentrifuger røret i 1 min ved 14000 g for å samle bakterier og fjern supernatanten forsiktig

Forsegl røret og frys bakteriene i flytende nitrogen i minst 1-3 timer.Oppbevar røret i -80 ℃ kjøleskap.

Frys prøvene i flytende nitrogen i 3-4 timer og oppbevar i flytende nitrogen eller -80 grader til langtidsreservasjon.Prøvefrakt med tørris er nødvendig.
Makrosopp Vev i aktivt voksende fase anbefales.

Skyll vevet med endotoksinfritt vann, deretter 70 % etonal.

Lagre prøven i kryorør.

Servicearbeidsflyt

prøvelevering

Prøvelevering

Bibliotekforberedelse

Bygging av bibliotek

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Ettersalgstjenester

Ettersalgstjenester


  • Tidligere:
  • Neste:

  • 1. Cirkosdiagram over soppgenomiske komponenter

    3

    2.Komparativ genomikkanalyse: Fylogenetisk tre

    4

     

    få et tilbud

    Skriv din melding her og send den til oss

    Send din melding til oss: