Produkter

Et metagenom er en samling av genetisk materiale fra et blandet samfunn av organismer, som miljømessige og menneskelige metagenomer. Det inneholder genomer fra både dyrkbare og ikke-dyrkbare mikroorganismer. Metagenomisk sekvensering muliggjør studiet av disse intrikate genomiske landskapene som er innebygd i økologiske prøver ved å gi mer enn taksonomisk profilering. Det tilbyr også et funksjonelt genomisk perspektiv ved å utforske de kodede genene og deres antatte roller i miljøprosesser. Mens tradisjonelle haglemetoder med Illumina-sekvensering har blitt mye brukt i metagenomiske studier, har fremveksten av Nanopore og PacBio long-read-sekvensering endret feltet. Nanopore- og PacBio-teknologi forbedrer nedstrøms bioinformatiske analyser, spesielt metagenomsamling, noe som sikrer mer kontinuerlige samlinger. Rapporter indikerer at Nanopore-basert og PacBio-basert metagenomikk har generert komplette og lukkede bakteriegenomer fra komplekse mikrobiomer (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). Integrering av Nanopore-avlesninger med Illumina-avlesninger gir en strategisk tilnærming for feilretting, noe som reduserer Nanopores iboende lave nøyaktighet. Denne synergistiske kombinasjonen utnytter styrkene til hver sekvenseringsplattform, og tilbyr en robust løsning for å overvinne potensielle begrensninger og forbedre presisjonen og påliteligheten til metagenomiske analyser.

Plattform: Nanopore PromethION 48, Illumia og PacBio Revio